More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1027 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1027  aminotransferase class I and II  100 
 
 
421 aa  831    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2813  aminotransferase class I and II  72.39 
 
 
401 aa  550  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.140428  normal  0.350751 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13700  succinyldiaminopimelate aminotransferase  66.18 
 
 
413 aa  499  1e-140  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.189376 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1046  aminotransferase class I and II  70.34 
 
 
402 aa  473  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1414  aminotransferase class I and II  64.21 
 
 
413 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.278944 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2244  aminotransferase class I and II  57.99 
 
 
409 aa  431  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000234233 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4355  succinyldiaminopimelate aminotransferase  59.52 
 
 
385 aa  422  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.339813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6569  aminotransferase, classes I and II  58.33 
 
 
394 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00706713  hitchhiker  0.00702095 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2507  succinyldiaminopimelate aminotransferase  55.34 
 
 
402 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0380247  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2218  aminotransferase class I and II  57.58 
 
 
382 aa  411  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.156784  normal  0.455276 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5952  aminotransferase  59.53 
 
 
387 aa  409  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.270012  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6777  aminotransferase class I and II  58.76 
 
 
381 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.655387  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0835  aminotransferase class I and II  58.64 
 
 
400 aa  398  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02410  succinyldiaminopimelate aminotransferase  57.85 
 
 
387 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4880  aminotransferase  54.19 
 
 
389 aa  390  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.10288 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1680  aminotransferase  53.4 
 
 
391 aa  390  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.591573  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  55.91 
 
 
386 aa  389  1e-107  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5070  aminotransferase  54.19 
 
 
391 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.807516  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3861  aminotransferase  57.61 
 
 
397 aa  386  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2956  aminotransferase class I and II  58.22 
 
 
387 aa  386  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00270718  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1208  aminotransferase class I and II  54.81 
 
 
384 aa  387  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0243  aminotransferase class I and II  54.97 
 
 
393 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10875  aminotransferase  55.78 
 
 
397 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.069515 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4251  aminotransferase  59.01 
 
 
397 aa  377  1e-103  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0228978  normal  0.0474481 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4497  aminotransferase  54.97 
 
 
389 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4584  aminotransferase  54.97 
 
 
389 aa  377  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.344557 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0568  aminotransferase  54.59 
 
 
391 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09980  succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.54 
 
 
387 aa  363  2e-99  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.466854  normal  0.440994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0047  aminotransferase class I and II  54.57 
 
 
395 aa  360  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30130  succinyldiaminopimelate aminotransferase  53.75 
 
 
408 aa  354  2e-96  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.47445  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0804  aminotransferase class I and II  51.04 
 
 
389 aa  352  1e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3242  aminotransferase class I and II  49.21 
 
 
392 aa  333  5e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.363576 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08850  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  49.21 
 
 
417 aa  332  8e-90  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2519  aminotransferase class I and II  50.26 
 
 
389 aa  323  4e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151807  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3059  hypothetical protein  48.55 
 
 
397 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3904  aminotransferase class I and II  43.88 
 
 
387 aa  313  2.9999999999999996e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1480  hypothetical protein  49.6 
 
 
388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.202316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1395  aminotransferase class I and II  48.95 
 
 
397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4149  hypothetical protein  47.42 
 
 
384 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2740  hypothetical protein  46.6 
 
 
394 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.419662 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3167  putative aminotransferase  45.29 
 
 
389 aa  300  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.0026749  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4413  hypothetical protein  46.34 
 
 
383 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.94668 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4725  hypothetical protein  46.56 
 
 
388 aa  298  9e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.483633  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2517  hypothetical protein  46.74 
 
 
394 aa  298  1e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0935034 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2445  hypothetical protein  45.29 
 
 
394 aa  297  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4133  aminotransferase, class I and II  46.21 
 
 
395 aa  297  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3515  hypothetical protein  43.86 
 
 
387 aa  298  2e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0853374  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2084  hypothetical protein  46.35 
 
 
394 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1996  aminotransferase, class I and II  41.77 
 
 
379 aa  293  3e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.974269 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1935  aminotransferase class I and II  45.91 
 
 
383 aa  293  4e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.183078  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1209  aminotransferase class I and II  45.31 
 
 
395 aa  293  6e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0857  hypothetical protein  44.79 
 
 
383 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0998197 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3534  putative aminotransferase  42.67 
 
 
388 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.605783  normal  0.0143572 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  42.97 
 
 
382 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2166  putative aminotransferase  41.03 
 
 
390 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.184753  normal  0.0648044 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0901  putative aminotransferase  42.78 
 
 
382 aa  286  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0002174 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1720  putative aminotransferase  41.78 
 
 
383 aa  286  5e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2104  hypothetical protein  42.56 
 
 
384 aa  286  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40190  putative aminotransferase  43.6 
 
 
382 aa  286  5.999999999999999e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1240  hypothetical protein  45.95 
 
 
383 aa  286  7e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2111  putative aminotransferase  40.83 
 
 
386 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  40.2 
 
 
400 aa  285  1.0000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1842  putative aminotransferase  40.77 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00218837 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1144  putative aminotransferase  41.15 
 
 
386 aa  284  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.749942 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1915  putative aminotransferase  41.51 
 
 
383 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0472461  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3458  putative aminotransferase  41.91 
 
 
385 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2081  hypothetical protein  41.82 
 
 
384 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292167  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0976  putative aminotransferase  40.97 
 
 
389 aa  282  7.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.164056 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1440  aminotransferase, classes I and II  41.21 
 
 
382 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0858  putative aminotransferase  42.78 
 
 
382 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.599809  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4320  putative aminotransferase  42.26 
 
 
382 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0776  hypothetical protein  45.66 
 
 
391 aa  282  9e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.623469  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0888  putative aminotransferase  42.78 
 
 
382 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.533677 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3361  hypothetical protein  41.78 
 
 
384 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  decreased coverage  0.00419079 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2011  putative aminotransferase  41.01 
 
 
399 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.482994  normal  0.0887187 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3793  hypothetical protein  44.09 
 
 
391 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1012  putative aminotransferase  41.79 
 
 
390 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2224  hypothetical protein  40.73 
 
 
385 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3304  putative aminotransferase  41.38 
 
 
385 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1253  putative aminotransferase  40.94 
 
 
382 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4321  hypothetical protein  44.74 
 
 
409 aa  276  5e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  40.47 
 
 
382 aa  276  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2174  putative aminotransferase  42.15 
 
 
394 aa  276  6e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.796298  normal  0.154643 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00568  putative aminotransferase  39.32 
 
 
386 aa  275  9e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00557  hypothetical protein  39.32 
 
 
386 aa  275  9e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0884  putative aminotransferase  41.91 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2725  putative aminotransferase  41.71 
 
 
391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.111664  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2403  putative aminotransferase  40 
 
 
391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.121886  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1500  hypothetical protein  44.39 
 
 
384 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0917  putative aminotransferase  40.79 
 
 
385 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.934756  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3322  putative aminotransferase  40.58 
 
 
386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3183  putative aminotransferase  40.58 
 
 
386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3495  putative aminotransferase  40.99 
 
 
382 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2793  aminotransferase  37.86 
 
 
390 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3024  aminotransferase class I and II  39.06 
 
 
386 aa  273  6e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3043  putative aminotransferase  39.06 
 
 
386 aa  273  6e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0652  putative aminotransferase  39.06 
 
 
386 aa  273  6e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.841721  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4927  putative aminotransferase  42.15 
 
 
393 aa  273  6e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3332  putative aminotransferase  40.58 
 
 
386 aa  272  8.000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.816568 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0686  putative aminotransferase  39.32 
 
 
386 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>