More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4388 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_4388  rare lipoprotein A  100 
 
 
119 aa  238  2e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2475  hypothetical protein  64.44 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0834  rare lipoprotein A  55.37 
 
 
124 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0578704  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5099  hypothetical protein  56.67 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.637831  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0965  rare lipoprotein A  65.59 
 
 
371 aa  124  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4283  rare lipoprotein A  67.03 
 
 
367 aa  124  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3960  rare lipoprotein A  63.83 
 
 
118 aa  124  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0220  rare lipoprotein A  60.87 
 
 
163 aa  124  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.602975  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0611  rare lipoprotein A  56.99 
 
 
167 aa  122  1e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0852  rare lipoprotein A  66.67 
 
 
140 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4924  rare lipoprotein A  54.24 
 
 
121 aa  121  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4765  rare lipoprotein A  62.79 
 
 
179 aa  121  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58210  hypothetical protein  59.63 
 
 
125 aa  120  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4167  rare lipoprotein A  52.89 
 
 
145 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0709  rare lipoprotein A  59 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.416345  normal  0.119045 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0720  rare lipoprotein A  57.66 
 
 
116 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1475  rare lipoprotein A  63.83 
 
 
124 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140201  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2973  rare lipoprotein A  64.84 
 
 
134 aa  118  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5339  rare lipoprotein A  60.87 
 
 
324 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4317  rare lipoprotein A  62.37 
 
 
120 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4952  rare lipoprotein A  52.54 
 
 
121 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.464519  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4580  rare lipoprotein A  62.77 
 
 
120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0743429 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3637  rare lipoprotein A  56.86 
 
 
163 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117902  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3377  rare lipoprotein A  55 
 
 
115 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.437587  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2020  rare lipoprotein A  48.09 
 
 
139 aa  117  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.451852 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3182  rare lipoprotein A  53.39 
 
 
115 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3506  rare lipoprotein A  53.39 
 
 
115 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.898762 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2019  rare lipoprotein A  56.86 
 
 
165 aa  116  9e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.202137  normal  0.287448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0929  rare lipoprotein A  65.91 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.352567 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0638  rare lipoprotein A  47.86 
 
 
127 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00262012 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0775  rare lipoprotein A  46.96 
 
 
118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.384839  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0252  rare lipoprotein A  56.52 
 
 
170 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0969  rare lipoprotein A  64.77 
 
 
124 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.629172  normal  0.144178 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2772  rare lipoprotein A  55.45 
 
 
171 aa  114  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2135  rare lipoprotein A family protein  60 
 
 
118 aa  114  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2050  rare lipoprotein A family protein  60 
 
 
118 aa  114  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0189793  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2800  rare lipoprotein A  61.54 
 
 
342 aa  114  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.472757  normal  0.158248 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0337  rare lipoprotein A  56.84 
 
 
144 aa  113  6.9999999999999995e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0114  rare lipoprotein A  65.91 
 
 
142 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4286  rare lipoprotein A  58.49 
 
 
155 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2925  rare lipoprotein A  53.68 
 
 
131 aa  113  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.542762  normal  0.960084 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22481  rare lipoprotein A  63.44 
 
 
221 aa  113  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3340  rare lipoprotein A  61.96 
 
 
358 aa  112  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0135  rare lipoprotein A  54.87 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1357  rare lipoprotein A  54.9 
 
 
199 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.24818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7192  Lipoprotein-like protein  61.63 
 
 
257 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0272359 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0269  rare lipoprotein A  64.52 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.586864 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2366  rare lipoprotein A  58.51 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3104  rare lipoprotein A  53.68 
 
 
131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4476  rplA family protein  57.45 
 
 
122 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0415  rare lipoprotein A  61.96 
 
 
179 aa  112  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.382353  normal  0.149224 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0534  rare lipoprotein A  58.33 
 
 
169 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0936  rare lipoprotein A  63.64 
 
 
124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3531  rare lipoprotein A  59.3 
 
 
124 aa  110  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4319  rare lipoprotein A  58.7 
 
 
212 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.617805 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0747  rare lipoprotein A, putative  55.1 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0479565  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1684  rare lipoprotein A  55.56 
 
 
150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1622  rare lipoprotein A  59.34 
 
 
157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.502299  normal  0.40448 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1108  rare lipoprotein A  49.52 
 
 
360 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1087  rare lipoprotein A  53.19 
 
 
137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.198857  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1509  rare lipoprotein A  55.66 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1079  rare lipoprotein A  49.52 
 
 
360 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0428  rare lipoprotein A  55.14 
 
 
168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.480759  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1915  rare lipoprotein A  61.96 
 
 
196 aa  108  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0736  rare lipoprotein A  56.84 
 
 
124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0240086  hitchhiker  0.0000000179293 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1773  rare lipoprotein A  47.9 
 
 
127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.662489 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3007  rare lipoprotein A  52.63 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0729065  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0084  rare lipoprotein A  55.1 
 
 
213 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.332012  normal  0.0350309 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1489  rare lipoprotein A  53.1 
 
 
122 aa  108  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3653  rare lipoprotein A  52.38 
 
 
175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.582784  normal  0.812873 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2593  rare lipoprotein A  48.67 
 
 
166 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.891934  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0319  rare lipoprotein A  54.74 
 
 
186 aa  107  5e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000762425  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2298  rare lipoprotein A  55.56 
 
 
238 aa  107  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0555  rare lipoprotein A  61.54 
 
 
159 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.789792  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0215  rare lipoprotein A  56.6 
 
 
171 aa  107  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1190  rare lipoprotein a rlpa  51.04 
 
 
239 aa  107  8.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2030  RlpA family lipoprotein  60 
 
 
261 aa  106  9.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000777021  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1159  rare lipoprotein A  52.13 
 
 
137 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3870  putative RlpA family protein  60.23 
 
 
238 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1152  rare lipoprotein A  56.84 
 
 
335 aa  106  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1099  rare lipoprotein A  52.13 
 
 
137 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0175  rare lipoprotein A  60.44 
 
 
156 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3199  rare lipoprotein A  52.13 
 
 
137 aa  105  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.476215 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01087  hypothetical protein  45.38 
 
 
181 aa  105  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0178  rare lipoprotein A  54.72 
 
 
159 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0760  rare lipoprotein A  51.06 
 
 
262 aa  105  2e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1191  rare lipoprotein A  51.06 
 
 
137 aa  104  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0103428  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2837  rare lipoprotein A  62.92 
 
 
121 aa  104  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1456  rare lipoprotein A  57.95 
 
 
322 aa  104  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.12367  normal  0.0142155 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5674  rare lipoprotein A  63.22 
 
 
110 aa  103  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417848  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0060  rare lipoprotein A  42.98 
 
 
129 aa  103  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4990  rare lipoprotein A  57.78 
 
 
227 aa  103  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.141289  normal  0.0854565 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2481  rare lipoprotein A  56.86 
 
 
162 aa  102  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.383159  normal  0.0948331 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2911  rare lipoprotein A family protein  56.18 
 
 
230 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.339601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1631  rare lipoprotein A family protein  56.18 
 
 
242 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3821  rare lipoprotein A family protein  56.18 
 
 
230 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577854  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1351  rare lipoprotein A  58.7 
 
 
162 aa  102  1e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.281508  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0492  rare lipoprotein A  53.4 
 
 
238 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0445  rare lipoprotein A  52.58 
 
 
142 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0289513  normal  0.285838 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3399  rare lipoprotein A family protein  56.18 
 
 
242 aa  102  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0569835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>