More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4025 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  58.99 
 
 		 734 aa  727    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  51.21 
 
 		 703 aa  642    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  58.71 
 
 		 712 aa  731    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  55.28 
 
 		 706 aa  687    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  91.85 
 
 		 687 aa  1250    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  57.49 
 
 		 711 aa  739    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  51.91 
 
 		 717 aa  645    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  58.52 
 
 		 714 aa  749    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  56.98 
 
 		 706 aa  739    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  100 
 
 		 687 aa  1376    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  57.55 
 
 		 703 aa  749    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  58.46 
 
 		 703 aa  744    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  53.4 
 
 		 694 aa  667    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  89.67 
 
 		 687 aa  1193    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  66.15 
 
 		 709 aa  924    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  53.26 
 
 		 713 aa  657    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  70.57 
 
 		 708 aa  925    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  52.22 
 
 		 717 aa  692    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  51.06 
 
 		 696 aa  644    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  56.17 
 
 		 714 aa  739    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2346  putative DNA-binding protein  70.2 
 
 		 536 aa  720    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.598568  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  52.35 
 
 		 709 aa  642    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  58.78 
 
 		 714 aa  751    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  54.35 
 
 		 685 aa  697    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  58.2 
 
 		 708 aa  722    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  56.98 
 
 		 706 aa  739    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  51.27 
 
 		 713 aa  632  1e-180  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3151  hypothetical protein  49.04 
 
 		 716 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.258373  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  47.63 
 
 		 694 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  46.61 
 
 		 759 aa  549  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  45.81 
 
 		 723 aa  538  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1474  ParB family protein  52.65 
 
 		 577 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.430156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3333  putative plasmid stabilization protein  52.99 
 
 		 577 aa  532  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7409  hypothetical protein  51.36 
 
 		 546 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  46.36 
 
 		 726 aa  502  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7711  hypothetical protein  49.17 
 
 		 582 aa  482  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0320471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  45.41 
 
 		 694 aa  478  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  40.84 
 
 		 715 aa  475  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7310  putative ParB-like nuclease  42.88 
 
 		 528 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  38.08 
 
 		 636 aa  364  3e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  37.05 
 
 		 615 aa  338  1.9999999999999998e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  36.76 
 
 		 683 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  36.24 
 
 		 688 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  36.24 
 
 		 688 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  37.11 
 
 		 683 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  35.38 
 
 		 684 aa  302  1e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  36.5 
 
 		 682 aa  300  6e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  35.82 
 
 		 690 aa  298  2e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  35.69 
 
 		 681 aa  295  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  36.26 
 
 		 679 aa  295  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  35.25 
 
 		 684 aa  294  4e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  33.08 
 
 		 658 aa  293  7e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  36.76 
 
 		 680 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  33.58 
 
 		 654 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  34.73 
 
 		 689 aa  281  3e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  35.23 
 
 		 687 aa  276  1.0000000000000001e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  35.61 
 
 		 687 aa  269  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  32.87 
 
 		 645 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  32.16 
 
 		 667 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  30.85 
 
 		 751 aa  267  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  34.73 
 
 		 692 aa  264  4e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2347  ParB-like nuclease  80.77 
 
 		 156 aa  259  8e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  34.34 
 
 		 679 aa  258  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  35.39 
 
 		 677 aa  256  9e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  32.77 
 
 		 709 aa  250  8e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  34.54 
 
 		 740 aa  247  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3089  hypothetical protein  50.41 
 
 		 369 aa  243  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.762612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  34.36 
 
 		 765 aa  239  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0428  parB-like partition proteins  31.68 
 
 		 662 aa  227  7e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.62662  normal  0.628869 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  34.3 
 
 		 754 aa  219  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  32.1 
 
 		 727 aa  219  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  31.32 
 
 		 662 aa  212  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  31.42 
 
 		 623 aa  212  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0139  ParB domain-containing protein  29.78 
 
 		 669 aa  208  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000818484 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0024  plasmid partition protein B  30.25 
 
 		 654 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3925  parB-like partition protein  28.07 
 
 		 690 aa  197  7e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0068  plasmid partition protein B  29.86 
 
 		 652 aa  192  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.878087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1468  putative plasmid stabilization protein  79.17 
 
 		 129 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7403  putative chromosome partitioning protein parB  76.61 
 
 		 133 aa  190  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0054  ParB-like partition protein  29.39 
 
 		 654 aa  183  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.737762 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5262  ParB family protein  28.26 
 
 		 729 aa  181  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0053  ParB-like partition protein  29.39 
 
 		 652 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.172926  hitchhiker  0.000557548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3327  putative plasmid stabilization protein  73.33 
 
 		 129 aa  177  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  27.44 
 
 		 624 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  27.09 
 
 		 626 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  27.09 
 
 		 626 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  27.09 
 
 		 626 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  27.6 
 
 		 624 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4956  nuclease  63.58 
 
 		 172 aa  164  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  27.76 
 
 		 624 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  27.22 
 
 		 624 aa  163  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4273  nuclease  27.4 
 
 		 670 aa  154  5e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  44.5 
 
 		 597 aa  154  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  33.51 
 
 		 595 aa  152  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3345  nuclease  37.56 
 
 		 603 aa  146  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3609  ParB family protein  37.05 
 
 		 606 aa  145  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7705  hypothetical protein  62.1 
 
 		 133 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2258  nuclease  36.53 
 
 		 607 aa  145  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0720626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1660  ParB family protein  37.31 
 
 		 389 aa  144  7e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.295778  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2079  ParB family protein  36.53 
 
 		 603 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>