171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3081 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_3081  Tol-Pal system YbgF  100 
 
 		 307 aa  597  1e-169  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2713  TPR repeat-containing protein  43.69 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0957329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6876  hypothetical protein  41.02 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.617207  normal  0.0553562 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1816  hypothetical protein  39.34 
 
 		 321 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18225  normal  0.591091 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3508  TPR repeat-containing protein  43.58 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.024508  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1315  tol-pal system protein YbgF  41.38 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4747  hypothetical protein  43.99 
 
 		 323 aa  185  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5489  tol-pal system protein YbgF  38.31 
 
 		 304 aa  179  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5388  tol-pal system protein YbgF  39.94 
 
 		 339 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.986897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5310  tol-pal system protein YbgF  40 
 
 		 341 aa  176  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4842  tol-pal system protein YbgF  40 
 
 		 341 aa  175  8e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  0.989146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4143  hypothetical protein  37.15 
 
 		 345 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0778  tol-pal system protein YbgF  37.71 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0520444 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4333  tol-pal system protein YbgF  37.78 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3636  tol-pal system protein YbgF  38.06 
 
 		 395 aa  151  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.655529  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  32.48 
 
 		 329 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  33.14 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0281  tol-pal system protein YbgF  49.61 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433103  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2625  Tol-Pal system YbgF  31.99 
 
 		 345 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3624  tol-pal system protein YbgF  31.64 
 
 		 333 aa  126  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3169  tetratricopeptide TPR_2  31 
 
 		 334 aa  114  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2414  hypothetical protein  29.3 
 
 		 291 aa  97.4  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1221  Tol-Pal system YbgF  35.36 
 
 		 505 aa  95.9  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  35 
 
 		 488 aa  90.5  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  35 
 
 		 488 aa  90.5  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  27.21 
 
 		 279 aa  87.4  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4425  tol-pal system protein YbgF  40.22 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.667598 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  31.9 
 
 		 325 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  27.17 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  25.74 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 312 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  31.31 
 
 		 239 aa  67  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  29.29 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0016  hypothetical protein  35.85 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  27.89 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0667  hypothetical protein  33.64 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2320  hypothetical protein  33.64 
 
 		 274 aa  62.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.152947  normal  0.674714 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1113  Tol-Pal system YbgF  38.89 
 
 		 272 aa  62.4  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.636864  normal  0.58924 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1597  hypothetical protein  24.63 
 
 		 313 aa  61.6  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.214914 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0564  hypothetical protein  33.64 
 
 		 274 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.85427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1209  hypothetical protein  31.97 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  24.32 
 
 		 267 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  26.39 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1912  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  26.88 
 
 		 257 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0263  tol-pal system protein YbgF  27.27 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067735 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  26.89 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0977  hypothetical protein  34.35 
 
 		 281 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0268883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  24.13 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3115  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.479676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  25.64 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  30.66 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  30.3 
 
 		 242 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  23.81 
 
 		 322 aa  57  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  30.26 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  31.43 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  30.26 
 
 		 262 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  30.71 
 
 		 258 aa  56.2  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  30.08 
 
 		 350 aa  56.2  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  24.33 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  22.78 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  24.24 
 
 		 248 aa  55.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  29.61 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  31.82 
 
 		 343 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  29.61 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 		 270 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2893  tol-pal system protein YbgF  31.15 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  7.77215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  25.89 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1986  tetratricopeptide TPR_2  27.48 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.396777  normal  0.343263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  25.89 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00702  hypothetical protein  31.15 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0845  tol-pal system protein YbgF  31.15 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000128041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0664  tol-pal system protein YbgF  31.15 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123566  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2913  tol-pal system protein YbgF  31.15 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000329093  normal  0.329929 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0765  tol-pal system protein YbgF  31.15 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00691  hypothetical protein  31.15 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000612768  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  23.71 
 
 		 271 aa  54.3  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  25.89 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0796  tol-pal system protein YbgF  31.15 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.27837e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0771  tol-pal system protein YbgF  31.15 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000973622  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  29.41 
 
 		 487 aa  53.9  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  28.1 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  25.89 
 
 		 271 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  32.48 
 
 		 257 aa  53.5  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  27.13 
 
 		 274 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  29.6 
 
 		 252 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 274 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 269 aa  52.4  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  25.41 
 
 		 271 aa  52  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2527  hypothetical protein  32.35 
 
 		 255 aa  52  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000191168  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  22.5 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1240  tol-pal system protein YbgF  28.75 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000229086  normal  0.061063 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  28.16 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  30.85 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  22.5 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0470  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 1070 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.524501  normal  0.148928 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2562  Tol-Pal system YbgF  30.85 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000429972  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  29.52 
 
 		 263 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  30.33 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  30.56 
 
 		 272 aa  50.4  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>