20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0470 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2960  TPR repeat-containing protein  40.65 
 
 		 1154 aa  800    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0470  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 1070 aa  2159    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.524501  normal  0.148928 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1325  TPR repeat-containing protein  48.78 
 
 		 1122 aa  812    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379611 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1304  hypothetical protein  34.76 
 
 		 982 aa  491  1e-137  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3225  Tetratricopeptide domain protein  34.27 
 
 		 1031 aa  431  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  24.54 
 
 		 1000 aa  56.2  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3636  tol-pal system protein YbgF  31 
 
 		 395 aa  50.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.655529  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5310  tol-pal system protein YbgF  28.42 
 
 		 341 aa  50.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5388  tol-pal system protein YbgF  29.47 
 
 		 339 aa  50.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.986897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4842  tol-pal system protein YbgF  28.42 
 
 		 341 aa  49.7  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.29028  normal  0.989146 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5489  tol-pal system protein YbgF  29.21 
 
 		 304 aa  49.3  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39153  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4333  tol-pal system protein YbgF  27.66 
 
 		 329 aa  48.5  0.0007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.105755 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1221  Tol-Pal system YbgF  28.04 
 
 		 505 aa  48.5  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 257 aa  48.5  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0281  tol-pal system protein YbgF  27.05 
 
 		 313 aa  48.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.433103  normal  0.0147653 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  30.11 
 
 		 350 aa  46.6  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  28.04 
 
 		 488 aa  45.4  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  28.04 
 
 		 488 aa  45.4  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  28.37 
 
 		 729 aa  45.1  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  25.25 
 
 		 487 aa  44.7  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>