More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1709 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1709  ABC transporter related  100 
 
 		 245 aa  485  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.995593  normal  0.0343274 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0007  ABC transporter related  72.65 
 
 		 245 aa  353  1e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.726275  hitchhiker  0.000259784 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0898  ABC transporter related  66.25 
 
 		 245 aa  326  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2887  ABC transporter ATP-binding protein  49.14 
 
 		 239 aa  240  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3617  ABC transporter related  47.52 
 
 		 244 aa  238  9e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.509048  normal  0.533217 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1850  ABC transporter related  47.93 
 
 		 244 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.716563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1951  ABC transporter related  46.28 
 
 		 244 aa  230  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3750  ABC transporter related  47.28 
 
 		 603 aa  228  7e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408417  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1101  ABC transporter related  50.63 
 
 		 255 aa  227  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00497633  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0114  ABC transporter related  46.64 
 
 		 241 aa  227  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  47.48 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0800  ABC transporter related  49.17 
 
 		 253 aa  226  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1499  ABC transporter related  45.76 
 
 		 244 aa  225  6e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.229827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0311  ABC transporter related  47.35 
 
 		 237 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.382743  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1452  ABC transporter related  45.53 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1583  ABC transporter related  42.37 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2129  ABC transporter related  47.68 
 
 		 244 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.214797  normal  0.206631 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  42.86 
 
 		 258 aa  217  2e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2427  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  44.44 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  44.35 
 
 		 271 aa  215  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0337  branched-chain amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  45.08 
 
 		 609 aa  215  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5992  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.3 
 
 		 248 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.156334 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1436  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 		 239 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  44.84 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2008  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.19 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.366522  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1531  ABC transporter related  44.44 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0795  ABC transporter related  44.96 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.213138  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0360  ABC transporter related  48.72 
 
 		 243 aa  211  9e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  40.78 
 
 		 259 aa  211  9e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0864  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.15 
 
 		 241 aa  210  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0303052  normal  0.202538 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1540  ABC transporter related  43.46 
 
 		 242 aa  210  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.8751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1678  ABC transporter-like protein  48.73 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.939026  normal  0.0800845 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0850  ATPase  42.06 
 
 		 242 aa  209  4e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  42 
 
 		 255 aa  207  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6134  ABC transporter related  45.53 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204704  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1827  ABC transporter related  40.68 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.017401  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2299  ABC transporter related  43.46 
 
 		 242 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  42.97 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1907  ABC transporter related  43.7 
 
 		 253 aa  206  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  42.8 
 
 		 259 aa  206  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1618  ABC transporter related  43.75 
 
 		 616 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.103337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1930  ABC transporter related  45.92 
 
 		 247 aa  206  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.211937  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2333  ABC transporter related protein  44.77 
 
 		 243 aa  205  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.552467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  41.7 
 
 		 258 aa  204  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1565  ABC transporter related  47.01 
 
 		 246 aa  204  8e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  41.04 
 
 		 258 aa  204  9e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0330  ABC transporter related  43.33 
 
 		 245 aa  204  9e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.813664 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  41.04 
 
 		 258 aa  204  9e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 		 270 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.04 
 
 		 257 aa  203  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  40.24 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  41.27 
 
 		 270 aa  203  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  41.94 
 
 		 283 aa  202  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  40.89 
 
 		 258 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  39.92 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4392  ABC transporter-related protein  41.73 
 
 		 270 aa  202  5e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3397  ABC transporter related  44.3 
 
 		 249 aa  201  7e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0271922 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  41.3 
 
 		 258 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5639  ABC transporter related  41.74 
 
 		 253 aa  201  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  41.3 
 
 		 258 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  41.3 
 
 		 258 aa  201  8e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  41.73 
 
 		 271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  40.64 
 
 		 258 aa  199  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  40.89 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2844  ABC transporter-related protein  41.94 
 
 		 293 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  43.03 
 
 		 612 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  41.2 
 
 		 280 aa  198  5e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  42.8 
 
 		 256 aa  199  5e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0511  ABC transporter related  42.55 
 
 		 238 aa  198  7e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0526817  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.49 
 
 		 258 aa  197  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  41.13 
 
 		 275 aa  197  9e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3102  ABC transporter related  41.6 
 
 		 258 aa  197  9e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.585714 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  41.13 
 
 		 275 aa  197  9e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  41.13 
 
 		 275 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  40.8 
 
 		 259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  41.77 
 
 		 334 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  39.2 
 
 		 264 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  39.52 
 
 		 255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0144  ABC transporter related  39.08 
 
 		 249 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  42.34 
 
 		 261 aa  196  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3648  ABC transporter related  42.98 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160755  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  43.25 
 
 		 256 aa  195  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  39.92 
 
 		 259 aa  195  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2916  ABC transporter related  45.57 
 
 		 236 aa  195  6e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  40.08 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  41.37 
 
 		 270 aa  195  7e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  39.2 
 
 		 265 aa  194  7e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  39.29 
 
 		 259 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  40.8 
 
 		 278 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  39.38 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  45.75 
 
 		 608 aa  194  1e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  37.89 
 
 		 256 aa  194  1e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  40.32 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  38.89 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3626  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  44.27 
 
 		 257 aa  193  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3142  ABC transporter related  39.68 
 
 		 257 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  42.69 
 
 		 261 aa  192  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2496  ABC transporter related  44.03 
 
 		 243 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0963402  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7437  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.28 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  39.76 
 
 		 253 aa  192  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>