More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0300 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0300  aspartate aminotransferase  100 
 
 
427 aa  863    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0401102 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0411  aspartate aminotransferase  60.48 
 
 
388 aa  459  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0167  aspartate aminotransferase  59.51 
 
 
388 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.288155 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  58.06 
 
 
388 aa  441  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3209  aspartate aminotransferase  57.25 
 
 
410 aa  442  1e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.053672  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  58.06 
 
 
388 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  56.79 
 
 
395 aa  436  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7544  aspartate aminotransferase  57.64 
 
 
403 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6805  aspartate aminotransferase  58.45 
 
 
401 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19657  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  45.12 
 
 
395 aa  317  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1295  aminotransferase class I and II  45.89 
 
 
398 aa  317  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.768016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4926  aminotransferase class I and II  44.92 
 
 
406 aa  315  9.999999999999999e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00335974 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  42.65 
 
 
410 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  42.41 
 
 
399 aa  299  7e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  42.13 
 
 
408 aa  294  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  42.21 
 
 
403 aa  293  4e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  41.27 
 
 
408 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  43.27 
 
 
400 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  44 
 
 
402 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  42.67 
 
 
400 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  42.01 
 
 
390 aa  280  3e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1397  aspartate aminotransferase  41.25 
 
 
388 aa  276  7e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.991404 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  43.27 
 
 
400 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  43.27 
 
 
400 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  42.93 
 
 
400 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  39.58 
 
 
385 aa  267  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  40.91 
 
 
388 aa  266  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  39.22 
 
 
385 aa  259  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3262  aspartate aminotransferase  38.93 
 
 
395 aa  250  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0096  aspartate aminotransferase  40.85 
 
 
402 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0113  aspartate aminotransferase  40.85 
 
 
402 aa  246  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1418  aspartate aminotransferase  37.53 
 
 
384 aa  236  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  36.63 
 
 
404 aa  218  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  36.41 
 
 
388 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  33.15 
 
 
395 aa  211  3e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  34.2 
 
 
401 aa  208  1e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1170  aminotransferase class I and II  35.05 
 
 
412 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  32.74 
 
 
388 aa  206  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  36.29 
 
 
387 aa  206  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  36.13 
 
 
392 aa  206  7e-52  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1308  aspartate aminotransferase  33.89 
 
 
379 aa  205  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4591  aminotransferase class I and II  32.82 
 
 
386 aa  203  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1423  aminotransferase  35.2 
 
 
384 aa  203  5e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2494  aminotransferase, class I and II  37.73 
 
 
381 aa  202  9e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546912  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  35.92 
 
 
402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1425  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  35.38 
 
 
444 aa  201  3e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  35.05 
 
 
390 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0165  aminotransferase, class I and II  35.6 
 
 
390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  31.63 
 
 
387 aa  197  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  36.93 
 
 
397 aa  197  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  35.31 
 
 
392 aa  197  4.0000000000000005e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0276062 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1877  aminotransferase class I and II  30.95 
 
 
402 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1431  aminotransferase class I and II  33.95 
 
 
391 aa  196  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000143032 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  31.79 
 
 
388 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  33.8 
 
 
392 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  33.8 
 
 
392 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1295  L-aspartate aminotransferase  36.65 
 
 
392 aa  195  1e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  35.28 
 
 
367 aa  195  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  33.93 
 
 
393 aa  194  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  33.07 
 
 
396 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0363  aminotransferase  33.42 
 
 
390 aa  194  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2564  aminotransferase class I and II  34.2 
 
 
386 aa  193  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  32.36 
 
 
375 aa  193  4e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0256  aminotransferase class I and II  33.24 
 
 
386 aa  193  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0003  aminotransferase class I and II  34.03 
 
 
388 aa  193  5e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00871395 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1973  aminotransferase, class I and II  29.47 
 
 
429 aa  192  7e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238227  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  31.79 
 
 
395 aa  192  9e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1771  aminotransferase class I and II  33.51 
 
 
391 aa  192  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000897955  normal  0.363557 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  32.11 
 
 
382 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  32.69 
 
 
398 aa  192  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2083  aspartate aminotransferase  32.71 
 
 
380 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00810333  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  35.2 
 
 
412 aa  192  1e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4723  hypothetical protein  32.65 
 
 
396 aa  192  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  32.65 
 
 
396 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2902  aminotransferase, class I and II  35.71 
 
 
406 aa  191  2e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0134054 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5045  hypothetical protein  32.39 
 
 
396 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0428  aspartate aminotransferase  31.79 
 
 
380 aa  191  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  35.47 
 
 
393 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  33.52 
 
 
385 aa  191  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  31.63 
 
 
387 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2204  aminotransferase class I and II  35.16 
 
 
390 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  32.39 
 
 
396 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0877  aminotransferase  30.85 
 
 
417 aa  190  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.706864  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0201  hypothetical protein  32.13 
 
 
396 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.39659  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0003  aminotransferase  33.16 
 
 
387 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  35.53 
 
 
392 aa  189  5.999999999999999e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4771  hypothetical protein  32.13 
 
 
396 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4611  hypothetical protein  32.13 
 
 
396 aa  189  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  34.44 
 
 
392 aa  189  7e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5012  hypothetical protein  32.13 
 
 
396 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5133  hypothetical protein  32.13 
 
 
396 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2679  aminotransferase class I and II  36.66 
 
 
411 aa  189  7e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  31.06 
 
 
392 aa  189  8e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  31.64 
 
 
387 aa  189  8e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0707  aspartate aminotransferase  31.06 
 
 
392 aa  189  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.498645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  31.25 
 
 
395 aa  189  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  31.25 
 
 
395 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  33.89 
 
 
377 aa  188  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  31.61 
 
 
385 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0880  aminotransferase, class I and II  34.12 
 
 
396 aa  188  1e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>