199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3051 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3051  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  413  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.129241 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5251  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  64.32 
 
 		 226 aa  238  5e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.144523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3252  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  63.85 
 
 		 222 aa  223  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.309546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2605  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  63.85 
 
 		 222 aa  222  3e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0949581  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1202  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  62.96 
 
 		 245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00500241 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1747  small-conductance mechanosensitive channel-like protein  48.09 
 
 		 187 aa  178  4e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.346445 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0290  hypothetical protein  54.71 
 
 		 179 aa  168  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5477  hypothetical protein  54.97 
 
 		 193 aa  162  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.730703 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2944  hypothetical protein  52.36 
 
 		 197 aa  160  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0723144  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0221  hypothetical protein  51.02 
 
 		 195 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0197  hypothetical protein  52.72 
 
 		 195 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0218  hypothetical protein  52.72 
 
 		 195 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.485558  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0139  hypothetical protein  50.27 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0051  hypothetical protein  52.35 
 
 		 197 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69330  hypothetical protein  58.15 
 
 		 192 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5996  hypothetical protein  60.12 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3136  hypothetical protein  34.48 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0787  hypothetical protein  28.82 
 
 		 176 aa  77.4  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0381  hypothetical protein  31.03 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001007  small-conductance mechanosensitive channel  28.07 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0229  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  31.82 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.727419  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07084  hypothetical protein  28.11 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12023  hypothetical protein  25.57 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0804  hypothetical protein  32.95 
 
 		 181 aa  62  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.445531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3219  hypothetical protein  32.95 
 
 		 181 aa  62  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3322  hypothetical protein  32.95 
 
 		 181 aa  62  0.000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0899  hypothetical protein  31.18 
 
 		 181 aa  60.8  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0540  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  30.86 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000231888  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0614  hypothetical protein  32.32 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.431847 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0852  hypothetical protein  31.18 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3441  hypothetical protein  31.18 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4184  small-conductance mechanosensitive channel  29.81 
 
 		 184 aa  60.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3512  hypothetical protein  31.18 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3635  hypothetical protein  31.18 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1640  mechanosensitive ion channel  30.86 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0204845  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1752  MscS Mechanosensitive ion channel  32.03 
 
 		 356 aa  58.9  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1549  hypothetical protein  28.57 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1265  small-conductance mechanosensitive channel  28.57 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.455732 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0520  hypothetical protein  34.31 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3043  hypothetical protein  29.53 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0790  hypothetical protein  33.63 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  34.33 
 
 		 494 aa  55.5  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  29.87 
 
 		 533 aa  55.1  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2956  hypothetical protein  26.76 
 
 		 176 aa  54.3  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1335  MscS mechanosensitive ion channel  25.97 
 
 		 275 aa  53.5  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000063147 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0258  hypothetical protein  25.85 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0961  hypothetical protein  35.92 
 
 		 150 aa  53.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  26.58 
 
 		 281 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  31.65 
 
 		 268 aa  52.4  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 288 aa  52.4  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  25.54 
 
 		 547 aa  52  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0515  MscS Mechanosensitive ion channel  27.01 
 
 		 292 aa  51.6  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2331  MscS mechanosensitive ion channel  25.99 
 
 		 307 aa  51.6  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0340157  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  28.33 
 
 		 544 aa  51.2  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  26.38 
 
 		 276 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4903  MscS mechanosensitive ion channel  28.23 
 
 		 327 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3684  MscS mechanosensitive ion channel  28.85 
 
 		 278 aa  50.8  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  30.67 
 
 		 549 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  30.67 
 
 		 549 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  27.42 
 
 		 288 aa  50.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  26.71 
 
 		 540 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00165  mechanosensitive ion channel family protein  25.35 
 
 		 276 aa  50.4  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  30.67 
 
 		 549 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  29.09 
 
 		 351 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0514  MscS Mechanosensitive ion channel  28.93 
 
 		 288 aa  49.7  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3024  MscS Mechanosensitive ion channel  29.14 
 
 		 282 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000332583  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0417  hypothetical protein  29.2 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101281  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0560.2  small-conductance mechanosensitive channel  30.3 
 
 		 429 aa  49.3  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  27.4 
 
 		 547 aa  48.9  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0207  MscS Mechanosensitive ion channel  28.57 
 
 		 283 aa  48.9  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  25 
 
 		 534 aa  48.9  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3509  MscS mechanosensitive ion channel  28.21 
 
 		 278 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.126996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2989  Ricin B lectin  26.19 
 
 		 474 aa  48.5  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000129425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0443  MscS mechanosensitive ion channel  28.21 
 
 		 278 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0311128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  31.76 
 
 		 262 aa  48.5  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  25 
 
 		 286 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  27.42 
 
 		 288 aa  48.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  25 
 
 		 286 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 286 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  31.72 
 
 		 275 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  25 
 
 		 286 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3818  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.39 
 
 		 289 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.905722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0854  MscS mechanosensitive ion channel  26.39 
 
 		 289 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.11552  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0460  transporter, small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  21.35 
 
 		 280 aa  47.8  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00313509  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  25 
 
 		 286 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1609  MscS mechanosensitive ion channel  26.16 
 
 		 319 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2842  MscS mechanosensitive ion channel  28.98 
 
 		 369 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4090  MscS mechanosensitive ion channel  23.15 
 
 		 349 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  25 
 
 		 286 aa  47.8  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  25 
 
 		 291 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1634  MscS mechanosensitive ion channel  26.16 
 
 		 319 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112948  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  25 
 
 		 286 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2331  MscS Mechanosensitive ion channel  25.16 
 
 		 276 aa  47.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.412123  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  25 
 
 		 286 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1580  MscS mechanosensitive ion channel  26.16 
 
 		 319 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0851  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.39 
 
 		 289 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.17895  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  22.42 
 
 		 270 aa  47  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  29.33 
 
 		 550 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  26.25 
 
 		 561 aa  47.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3699  MscS Mechanosensitive ion channel  24.84 
 
 		 283 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>