More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2928 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4805  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  74.88 
 
 
443 aa  652    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495821  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2779  Rieske (2Fe-2S) domain protein  76.25 
 
 
443 aa  667    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261515  normal  0.259625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1910  phthalate 4,5-dioxygenase, oxygenase subunit  73.27 
 
 
438 aa  652    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.578876  normal  0.581965 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4627  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  76.41 
 
 
417 aa  649    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4958  Rieske (2Fe-2S) domain protein  76.25 
 
 
443 aa  667    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.879177  normal  0.275764 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2928  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
445 aa  915    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.149906  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5781  Rieske (2Fe-2S) region  40.66 
 
 
417 aa  290  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4882  phthalate 4,5-dioxygenase  37.32 
 
 
422 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7254  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.35 
 
 
430 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0574  phthalate 4,5-dioxygenase  36.98 
 
 
406 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.105836  normal  0.217979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0877  putative dioxygenase  36.57 
 
 
452 aa  229  7e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.297728  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4881  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.5 
 
 
434 aa  227  4e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5548  putative Phthalate 4,5-dioxygenase subunit alpha  33.7 
 
 
439 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2268  Rieske (2Fe-2S) protein  36.72 
 
 
452 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0946291  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  35.94 
 
 
452 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3532  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.98 
 
 
446 aa  210  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048657  normal  0.0515471 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3537  aromatic acid dioxygenase alpha subunit  35.24 
 
 
440 aa  210  4e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  35.37 
 
 
438 aa  209  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4795  phthalate 4,5-dioxygenase  32.01 
 
 
412 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2370  putative phthalate 4,5-dioxygenase oxygenase subunit (OhpA2)  34.91 
 
 
440 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000399664  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5154  Rieske (2Fe-2S) region  33.17 
 
 
440 aa  201  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291358  normal  0.277417 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8462  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.43 
 
 
448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1445  Rieske (2Fe-2S) protein  33.67 
 
 
437 aa  196  9e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.491711  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3529  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.11 
 
 
433 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551503  normal  0.104416 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2133  twin-arginine translocation pathway signal  33.96 
 
 
484 aa  193  5e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.395399  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6324  phthalate 4,5-dioxygenase  31.94 
 
 
437 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3201  phthalate 4,5-dioxygenase  32.56 
 
 
436 aa  171  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1044  phthalate 4,5-dioxygenase  39.63 
 
 
454 aa  160  5e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.714091 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.64 
 
 
408 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00683325  hitchhiker  0.00740172 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5678  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.39 
 
 
408 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000120872  normal  0.0293014 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.75 
 
 
410 aa  154  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3062  phthalate 4,5-dioxygenase  31.48 
 
 
431 aa  153  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.021682 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4297  phthalate 4,5-dioxygenase  30.33 
 
 
392 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0555  phthalate 4,5-dioxygenase  31.75 
 
 
470 aa  144  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.547165  normal  0.18525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1687  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.82 
 
 
449 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1473  Rieske (2Fe-2S) region  28.12 
 
 
398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.826795  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1543  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.1 
 
 
519 aa  116  7.999999999999999e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.453445  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1001  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.95 
 
 
380 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  34.15 
 
 
327 aa  99.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0175  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.15 
 
 
363 aa  99.4  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  29.94 
 
 
334 aa  95.5  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7059  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.41 
 
 
364 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2387  normal  0.465604 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4568  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.8 
 
 
356 aa  93.2  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.380862  hitchhiker  0.000303241 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1105  Rieske (2Fe-2S) protein  27.64 
 
 
358 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.080608  normal  0.368914 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.86 
 
 
450 aa  92.8  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3984  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.21 
 
 
356 aa  91.7  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.643695  normal  0.0193847 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  28.32 
 
 
315 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3658  Rieske (2Fe-2S) region  27.11 
 
 
356 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4709  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.11 
 
 
356 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700082  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.44 
 
 
356 aa  90.5  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.119091 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5591  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.11 
 
 
356 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00790855 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4233  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.44 
 
 
362 aa  89.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  29.28 
 
 
380 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3570  Rieske (2Fe-2S) region  25.71 
 
 
355 aa  89  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0161982  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  31.28 
 
 
345 aa  89  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1336  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.44 
 
 
355 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.4835  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1307  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.44 
 
 
355 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.992701  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2494  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.44 
 
 
355 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1501  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.44 
 
 
355 aa  87.8  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0319  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.44 
 
 
355 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.456896  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1234  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.44 
 
 
355 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0972  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.44 
 
 
355 aa  87.4  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0595  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.44 
 
 
355 aa  87.4  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0958903  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4245  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.21 
 
 
371 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2686  Rieske (2Fe-2S) protein  32.05 
 
 
376 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.59 
 
 
358 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  32.79 
 
 
492 aa  84.7  0.000000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  25.17 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2725  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.81 
 
 
354 aa  83.6  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0149406 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 
347 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0195459 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4642  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.82 
 
 
355 aa  83.2  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.44027  normal  0.0329483 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4510  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.82 
 
 
355 aa  83.2  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  26.44 
 
 
367 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5029  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.65 
 
 
359 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.44 
 
 
450 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5693  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.59 
 
 
352 aa  82.8  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.44 
 
 
450 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2687  Rieske (2Fe-2S) protein  32.72 
 
 
356 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2170  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.99 
 
 
355 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.461217  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64800  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  31.36 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0565633  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3124  Rieske (2Fe-2S) region  28.07 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.439622  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5243  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.07 
 
 
359 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2045  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.4 
 
 
355 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3736  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.81 
 
 
355 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.554225  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  32.59 
 
 
358 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1485  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.99 
 
 
343 aa  79.7  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5124  vanillate monooxygenase  27.49 
 
 
359 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14115  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0222  vanillate O-demethylase oxygenase subunit oxidoreductase protein  26.32 
 
 
342 aa  78.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000016692  normal  0.0221534 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2027  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.22 
 
 
355 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1296  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.81 
 
 
367 aa  79  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.85642 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4278  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.64 
 
 
362 aa  79  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.844018 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0963  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  25.9 
 
 
350 aa  79  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4591  vanillate monooxygenase  26.63 
 
 
373 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1649  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.07 
 
 
370 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0132  Rieske (2Fe-2S) protein  29.2 
 
 
343 aa  77.4  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1220  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.4 
 
 
334 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0507919  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0187  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.4 
 
 
334 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.531075  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1377  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.4 
 
 
334 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2607  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.4 
 
 
334 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1112  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.4 
 
 
334 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.624843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>