86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_2097 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_2097  hypothetical protein  100 
 
 
372 aa  733    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2162  hypothetical protein  74.15 
 
 
339 aa  445  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0151001  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2304  protein of unknown function DUF58  68.81 
 
 
341 aa  423  1e-117  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2815  hypothetical protein  68.81 
 
 
341 aa  424  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.682313  normal  0.278413 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1218  hypothetical protein  65.57 
 
 
355 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.892265  normal  0.23692 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3378  protein of unknown function DUF58  62.39 
 
 
323 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.476103  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3147  hypothetical protein  62.16 
 
 
337 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.210354 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2385  hypothetical protein  60.19 
 
 
344 aa  361  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2530  hypothetical protein  60.74 
 
 
341 aa  358  9e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1244  hypothetical protein  55.66 
 
 
336 aa  309  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164654  normal  0.183066 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2913  hypothetical protein  45.19 
 
 
362 aa  231  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.278272 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1838  hypothetical protein  37.96 
 
 
317 aa  186  8e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3010  protein of unknown function DUF58  38.08 
 
 
333 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.29026  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3625  hypothetical protein  37.34 
 
 
316 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2518  hypothetical protein  35.49 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.451759  normal  0.113037 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0467  hypothetical protein  37.58 
 
 
321 aa  166  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2068  hypothetical protein  31.78 
 
 
349 aa  159  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.604941 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3969  protein of unknown function DUF58  37.69 
 
 
357 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.068653 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3855  protein of unknown function DUF58  37.69 
 
 
357 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2249  hypothetical protein  34.48 
 
 
327 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.497774  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5566  hypothetical protein  38.67 
 
 
346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708703  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03012  hypothetical protein  38.79 
 
 
352 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.606349 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1576  hypothetical protein  36.22 
 
 
339 aa  149  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0183217  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1490  hypothetical protein  33.77 
 
 
326 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00153565  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1884  hypothetical protein  38.44 
 
 
323 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.65449  normal  0.844493 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2075  protein of unknown function DUF58  37.17 
 
 
315 aa  145  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0220521  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2449  hypothetical protein  36.51 
 
 
318 aa  142  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.340294  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2280  hypothetical protein  36.68 
 
 
317 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2054  hypothetical protein  34.28 
 
 
318 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.285922  normal  0.509055 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2369  hypothetical protein  29.06 
 
 
323 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.366253  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1324  protein of unknown function DUF58  32.89 
 
 
344 aa  138  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.12431  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0863  protein of unknown function DUF58  36.51 
 
 
314 aa  122  9.999999999999999e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.344005  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1211  hypothetical protein  30.67 
 
 
319 aa  116  5e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1117  hypothetical protein  30.67 
 
 
319 aa  116  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1863  hypothetical protein  26.38 
 
 
316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26920  hypothetical protein  34.28 
 
 
318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1872  hypothetical protein  26.69 
 
 
316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2349  hypothetical protein  29.51 
 
 
417 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2417  hypothetical protein  29.01 
 
 
338 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.479744  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1898  hypothetical protein  29.05 
 
 
342 aa  106  8e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2108  hypothetical protein  30.4 
 
 
354 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0820  hypothetical protein  28.28 
 
 
323 aa  103  7e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2531  hypothetical protein  26.69 
 
 
372 aa  103  7e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1944  hypothetical protein  26.33 
 
 
353 aa  102  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02437  hypothetical protein  31.1 
 
 
318 aa  100  4e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1966  hypothetical protein  28.05 
 
 
329 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1793  transglutaminase-like protein  32.13 
 
 
943 aa  99.4  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.634482  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1675  hypothetical protein  27.09 
 
 
353 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2624  hypothetical protein  27.74 
 
 
329 aa  97.4  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.681677  normal  0.0502315 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02556  hypothetical protein  25.66 
 
 
374 aa  94.7  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2777  hypothetical protein  25.07 
 
 
337 aa  93.2  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668338  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0727  protein of unknown function DUF58  29.04 
 
 
302 aa  93.2  7e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1878  hypothetical protein  30.18 
 
 
330 aa  88.6  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2243  hypothetical protein  30.03 
 
 
361 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.760307  normal  0.435241 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2127  hypothetical protein  27.16 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2425  hypothetical protein  30.69 
 
 
276 aa  83.6  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337672  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2151  hypothetical protein  28.26 
 
 
346 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2097  hypothetical protein  29.79 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2050  hypothetical protein  29.79 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3276  hypothetical protein  26.8 
 
 
294 aa  82.8  0.000000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.864378  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4562  hypothetical protein  29.79 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2276  hypothetical protein  29.79 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2288  protein of unknown function DUF58  29.79 
 
 
365 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.523334  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1855  hypothetical protein  29.73 
 
 
361 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270651  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1777  hypothetical protein  29.43 
 
 
361 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2043  protein of unknown function DUF58  29.2 
 
 
267 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1320  protein of unknown function DUF58  26.16 
 
 
275 aa  62  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.5057  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6585  protein of unknown function DUF58  26.9 
 
 
380 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433364 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2963  protein of unknown function DUF58  25.81 
 
 
275 aa  56.6  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.023693 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1522  protein of unknown function DUF58  23.5 
 
 
293 aa  56.6  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0048  protein of unknown function DUF58  21.56 
 
 
363 aa  55.8  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0817  protein of unknown function DUF58  24.57 
 
 
552 aa  54.3  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3388  protein of unknown function DUF58  25.68 
 
 
385 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1633  hypothetical protein  23.89 
 
 
257 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000447033  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2105  protein of unknown function DUF58  27.27 
 
 
431 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5229  hypothetical protein  33.86 
 
 
449 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.421211  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4950  hypothetical protein  33.86 
 
 
449 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4861  hypothetical protein  33.86 
 
 
449 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0188  hypothetical protein  25 
 
 
412 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0629  protein of unknown function DUF58  28.73 
 
 
325 aa  46.6  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2053  hypothetical protein  25.48 
 
 
263 aa  46.2  0.0009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0403432  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4049  protein of unknown function DUF58  34.11 
 
 
430 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1077  protein of unknown function DUF58  26.67 
 
 
426 aa  44.3  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2419  protein of unknown function DUF58  33.59 
 
 
638 aa  43.9  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2536  protein of unknown function DUF58  26.52 
 
 
333 aa  43.5  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3578  protein of unknown function DUF58  28.49 
 
 
370 aa  43.1  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>