More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0710 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0710  hypothetical protein  100 
 
 		 331 aa  667    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0073  hypothetical protein  76.36 
 
 		 330 aa  493  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0604  hypothetical protein  70.91 
 
 		 329 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3116  twin-arginine translocation pathway signal  64.35 
 
 		 331 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143461  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4540  hypothetical protein  61.33 
 
 		 330 aa  398  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4405  hypothetical protein  62.73 
 
 		 329 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0136  hypothetical protein  50.61 
 
 		 355 aa  319  3.9999999999999996e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0198  twin-arginine translocation pathway signal  49.09 
 
 		 328 aa  315  5e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.297337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0805  hypothetical protein  51.2 
 
 		 328 aa  311  9e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2451  hypothetical protein  47.75 
 
 		 330 aa  308  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0236  hypothetical protein  47.58 
 
 		 329 aa  307  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1766  twin-arginine translocation pathway signal  46.08 
 
 		 338 aa  266  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0796  hypothetical protein  43.77 
 
 		 340 aa  241  2e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.980673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1801  hypothetical protein  40.2 
 
 		 343 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.939675  normal  0.361643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4305  hypothetical protein  39.6 
 
 		 327 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4788  hypothetical protein  38.34 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0126294  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  36.24 
 
 		 336 aa  195  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3576  hypothetical protein  37.34 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.37147  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.92 
 
 		 330 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.92 
 
 		 330 aa  192  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3697  hypothetical protein  35.28 
 
 		 334 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583429  normal  0.151066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2943  hypothetical protein  37.16 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.357737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  37.54 
 
 		 334 aa  190  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  35.23 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  34.55 
 
 		 331 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4467  hypothetical protein  37.97 
 
 		 328 aa  185  8e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0114308  normal  0.0574707 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  36.48 
 
 		 324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  35.74 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  35.57 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  36.24 
 
 		 331 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  37 
 
 		 325 aa  182  8.000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  37.25 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2663  hypothetical protein  36.25 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  34.04 
 
 		 332 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1547  hypothetical protein  34.97 
 
 		 324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  35.91 
 
 		 328 aa  179  7e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3311  hypothetical protein  35.76 
 
 		 324 aa  179  7e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3420  hypothetical protein  34.66 
 
 		 320 aa  178  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1548  hypothetical protein  36.63 
 
 		 332 aa  179  9e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1950  hypothetical protein  35.89 
 
 		 327 aa  178  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0031153 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  35.5 
 
 		 331 aa  178  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  33.64 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0567  hypothetical protein  36.61 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  35.38 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  34.06 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5824  extra-cytoplasmic solute receptor  36.94 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  35.74 
 
 		 339 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  38.8 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4796  hypothetical protein  33.99 
 
 		 331 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  35.78 
 
 		 331 aa  176  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2422  hypothetical protein  35.45 
 
 		 698 aa  175  9e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  34.02 
 
 		 333 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  35.93 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0560  twin-arginine translocation pathway signal  34.05 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2198  hypothetical protein  33.74 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000306315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  33.56 
 
 		 337 aa  174  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  33.74 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  35.1 
 
 		 386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4673  hypothetical protein  36.08 
 
 		 344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4563  hypothetical protein  34.56 
 
 		 329 aa  173  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  36.58 
 
 		 335 aa  174  2.9999999999999996e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  36.09 
 
 		 322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  36.08 
 
 		 324 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3407  hypothetical protein  34.8 
 
 		 322 aa  172  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.495053  normal  0.890495 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3217  hypothetical protein  34.69 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  32.42 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  33.89 
 
 		 327 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  34.23 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0288  hypothetical protein  33.67 
 
 		 325 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  33.92 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  35.64 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  32.21 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  37.25 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  34.98 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3575  hypothetical protein  36.45 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.571272  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  32.32 
 
 		 351 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0120  hypothetical protein  37.98 
 
 		 361 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4644  hypothetical protein  35.33 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.206487  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  34.44 
 
 		 344 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  34.23 
 
 		 337 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1106  hypothetical protein  36.58 
 
 		 326 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.171121  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3716  hypothetical protein  31.88 
 
 		 334 aa  169  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.128099  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4337  extra-cytoplasmic solute receptor  32.21 
 
 		 335 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0105  hypothetical protein  34.12 
 
 		 330 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  36.53 
 
 		 339 aa  169  5e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  32.48 
 
 		 319 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  34.45 
 
 		 332 aa  169  7e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  33.23 
 
 		 330 aa  169  7e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  33.22 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  33.53 
 
 		 356 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  35.31 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  36.75 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  35.17 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  36.08 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  33.89 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  33.23 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  33.89 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  33.67 
 
 		 335 aa  167  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2042  hypothetical protein  35.45 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.406961  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2596  hypothetical protein  34.11 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523201  normal  0.428813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>