More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3665 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3665  hypothetical protein  100 
 
 		 326 aa  656    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3470  hypothetical protein  80.13 
 
 		 330 aa  504  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  77.56 
 
 		 322 aa  497  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  56.91 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  58.72 
 
 		 353 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0594  hypothetical protein  63.95 
 
 		 233 aa  323  3e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  45.64 
 
 		 328 aa  287  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  45.64 
 
 		 328 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  48 
 
 		 327 aa  285  5.999999999999999e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  48.66 
 
 		 335 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  44.15 
 
 		 324 aa  282  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  43.61 
 
 		 332 aa  279  6e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  44.48 
 
 		 321 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  42.59 
 
 		 328 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  43.42 
 
 		 330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  43.62 
 
 		 330 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  43.29 
 
 		 325 aa  271  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  45.07 
 
 		 326 aa  271  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  44.06 
 
 		 335 aa  270  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  42.99 
 
 		 336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  46.15 
 
 		 323 aa  268  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  43.64 
 
 		 325 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  44.3 
 
 		 339 aa  268  8.999999999999999e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  42.55 
 
 		 327 aa  267  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  43 
 
 		 336 aa  267  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  43.73 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  45.64 
 
 		 314 aa  267  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  45.75 
 
 		 331 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  45.21 
 
 		 333 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  43.62 
 
 		 325 aa  265  5.999999999999999e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.81 
 
 		 325 aa  265  8.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  44.63 
 
 		 339 aa  265  8.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  44.44 
 
 		 331 aa  265  8.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  46.51 
 
 		 330 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  43.61 
 
 		 337 aa  263  2e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  43.28 
 
 		 360 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  43.28 
 
 		 328 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  45.66 
 
 		 334 aa  264  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  43.14 
 
 		 328 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  42.15 
 
 		 327 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  43.17 
 
 		 328 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  43.1 
 
 		 339 aa  261  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1253  hypothetical protein  43.3 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  46.15 
 
 		 328 aa  260  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  42.12 
 
 		 344 aa  260  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  42.72 
 
 		 339 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5203  hypothetical protein  45.51 
 
 		 332 aa  259  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  44.67 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.14 
 
 		 326 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  40.13 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  42.62 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  42.14 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  42.62 
 
 		 345 aa  256  3e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  42.62 
 
 		 345 aa  256  3e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  40.98 
 
 		 337 aa  255  6e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  42.04 
 
 		 333 aa  255  6e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  40.12 
 
 		 334 aa  255  8e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  41.59 
 
 		 358 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  40.47 
 
 		 324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  41.72 
 
 		 305 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  42.47 
 
 		 324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  42.86 
 
 		 326 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  42.86 
 
 		 327 aa  252  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  40.53 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  44.81 
 
 		 339 aa  251  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  40.55 
 
 		 329 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  42.3 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  44.38 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  39.43 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3122  hypothetical protein  43.14 
 
 		 343 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00641753  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  40.53 
 
 		 341 aa  251  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1295  hypothetical protein  42.47 
 
 		 324 aa  250  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.356601  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  40.06 
 
 		 331 aa  249  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  44.48 
 
 		 324 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  42.43 
 
 		 322 aa  249  5e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  43.67 
 
 		 322 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5794  hypothetical protein  44.07 
 
 		 318 aa  249  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  40.4 
 
 		 323 aa  248  7e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4631  hypothetical protein  42.05 
 
 		 325 aa  248  8e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  40.8 
 
 		 332 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1323  hypothetical protein  40.68 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  42.47 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  42.39 
 
 		 326 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  42.28 
 
 		 338 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  40.79 
 
 		 343 aa  246  4.9999999999999997e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  43 
 
 		 334 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  41.1 
 
 		 325 aa  245  8e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2444  hypothetical protein  41.47 
 
 		 334 aa  245  9e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  43.19 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  43.19 
 
 		 330 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  40.38 
 
 		 325 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  41.33 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  41.07 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  43.49 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  40.85 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  38.94 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  43.05 
 
 		 349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  43.49 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  38.89 
 
 		 335 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4280  hypothetical protein  39.94 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.711918  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>