More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3157 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3157  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 437 aa  861    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0967  major facilitator transporter  65.03 
 
 		 431 aa  561  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3970  major facilitator transporter  40.47 
 
 		 415 aa  290  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3962  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0137  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 427 aa  155  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711872  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4117  putative permease  28.54 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4224  putative permease  29.04 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4044  putative permease  28.28 
 
 		 420 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4166  putative permease  28.57 
 
 		 420 aa  145  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 431 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2240  putative permease  29.1 
 
 		 411 aa  107  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6216  major facilitator transporter  28.32 
 
 		 460 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0431  major facilitator transporter  26.64 
 
 		 440 aa  95.5  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000529382  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  27.27 
 
 		 460 aa  95.5  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 428 aa  93.2  9e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 460 aa  92  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  26.13 
 
 		 430 aa  91.3  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  26.28 
 
 		 432 aa  90.5  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  29.15 
 
 		 419 aa  90.1  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  25.12 
 
 		 448 aa  89.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  30.07 
 
 		 447 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  28.01 
 
 		 447 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7255  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 448 aa  89  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 446 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  25.12 
 
 		 446 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 447 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 		 407 aa  85.9  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4584  d-galactonate transporter  28.77 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.960578  normal  0.440179 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4450  d-galactonate transporter  28.77 
 
 		 450 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  26.49 
 
 		 447 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  28.12 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0828  putative glucarate transporter (D-glucarate permease) transmembrane protein  26.73 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.667348  normal  0.455207 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  26.09 
 
 		 442 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36120  putative MFS transporter  27.51 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000263423 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  26.39 
 
 		 454 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4725  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 430 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.456281  normal  0.916146 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  26.39 
 
 		 454 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2498  major facilitator transporter  27.71 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.761213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  26.15 
 
 		 454 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  25.33 
 
 		 427 aa  84.3  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  27.94 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3397  D-galactonate transporter  28.13 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 440 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  28.08 
 
 		 430 aa  83.2  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3099  d-galactonate transporter  26.87 
 
 		 454 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3600  d-galactonate transporter  26.87 
 
 		 454 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  26.15 
 
 		 454 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  26.09 
 
 		 410 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3689  D-galactonate transporter  25.93 
 
 		 458 aa  81.3  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  27.7 
 
 		 451 aa  80.9  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0993  2-ketogluconate/H(+) major facilitator transporter  23.88 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.051326  normal  0.375991 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 435 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  26.38 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  24.29 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  24.36 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3058  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 430 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3935  major facilitator transporter  26.3 
 
 		 431 aa  79.7  0.00000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3398  d-galactonate transporter  27.6 
 
 		 458 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0331831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2316  d-galactonate transporter  26.17 
 
 		 454 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.601207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 427 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  26.39 
 
 		 447 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3242  d-galactonate transporter  23.25 
 
 		 451 aa  79.7  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  27.11 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0187  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  28.16 
 
 		 451 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  29.04 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  26.05 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5207  d-galactonate transporter  27.3 
 
 		 485 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.045527 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0217  d-galactonate transporter  27.66 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0225  d-galactonate transporter  27.66 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305819 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4680  d-galactonate transporter  27.3 
 
 		 485 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5069  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 430 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2815  d-galactonate transporter  26.2 
 
 		 453 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.362765  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  24.35 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  24.35 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  24.35 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  27.32 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  24.35 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  24.35 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  24.03 
 
 		 420 aa  77.8  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  24.35 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3569  d-galactonate transporter  24.38 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.576776 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  24.35 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8658  major facilitator superfamily MFS_1  26.75 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  24.35 
 
 		 444 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1401  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.270057  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3283  glucarate permease  22.29 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.747059 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  22.29 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  26.08 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  22.29 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0477  major facilitator transporter  21.93 
 
 		 441 aa  77  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  22.29 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.513823 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  22.29 
 
 		 452 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6215  major facilitator transporter  27.75 
 
 		 417 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0327  D-galactonate transporter  27.25 
 
 		 459 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>