260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3154 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3154  extracellular solute-binding protein family 3  100 
 
 		 249 aa  485  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0903537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3873  extracellular solute-binding protein  66.23 
 
 		 250 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.543903  normal  0.744123 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7267  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  62.5 
 
 		 264 aa  293  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6880  extracellular solute-binding protein  63.33 
 
 		 244 aa  289  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21399  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6190  extracellular solute-binding protein family 3  62.87 
 
 		 273 aa  286  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5966  extracellular solute-binding protein  62.24 
 
 		 349 aa  286  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5602  extracellular solute-binding protein  62.24 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5977  extracellular solute-binding protein  63.33 
 
 		 244 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6273  extracellular solute-binding protein  61.83 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6466  extracellular solute-binding protein  61.41 
 
 		 244 aa  281  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.59873  normal  0.0219509 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4553  extracellular solute-binding protein  61.86 
 
 		 247 aa  281  8.000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.221841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5653  extracellular solute-binding protein  60.83 
 
 		 243 aa  278  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.493733 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3717  extracellular solute-binding protein  60.42 
 
 		 243 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.241075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4651  extracellular solute-binding protein  60.42 
 
 		 243 aa  275  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545523  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2836  extracellular solute-binding protein  58.58 
 
 		 248 aa  271  9e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.918231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4744  extracellular solute-binding protein family 3  56.67 
 
 		 277 aa  268  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273902  normal  0.741652 
 
 
-
 
NC_003296  RS04698  periplasmic substrate binding ABC transporter protein  58.51 
 
 		 245 aa  267  2e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.291783 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1361  extracellular solute-binding protein  48.35 
 
 		 269 aa  239  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1628  extracellular solute-binding protein  49.57 
 
 		 279 aa  207  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.625521  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0588  extracellular solute-binding protein family 3  46.57 
 
 		 207 aa  192  5e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4109  extracellular solute-binding protein  49.34 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.664204  normal  0.53519 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3636  extracellular solute-binding protein family 3  45.98 
 
 		 238 aa  169  5e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.59453 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8634  extracellular solute-binding protein family 3  39.91 
 
 		 237 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2646  extracellular solute-binding protein  38.33 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.997273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45195  predicted protein  35.15 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.177256  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0285  extracellular solute-binding protein  31.9 
 
 		 266 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.994895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3455  putative amino acid ABC transporter, substrate-binding protein  30.41 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4313  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 		 278 aa  79.3  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.438014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1297  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 		 248 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  30.57 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  30.57 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3631  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 		 282 aa  65.9  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.867063  normal  0.017598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6284  putative periplasmic-binding protein  24.36 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0609  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein  23.85 
 
 		 286 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0109579  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0461  amino acid ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  26.99 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4078  extracellular solute-binding protein  26.99 
 
 		 277 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2601  extracellular solute-binding protein  22.97 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.186233 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  28.82 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0122  amino acid ABC transporter periplasmic protein  23.87 
 
 		 281 aa  57.4  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2694  extracellular solute-binding protein family 3  28.85 
 
 		 277 aa  56.2  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1872  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1598  extracellular solute-binding protein  29.05 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1036  amino acid ABC transporter permease  24.66 
 
 		 990 aa  55.1  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.328178 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0859  amino acid ABC transporter permease  24.66 
 
 		 990 aa  55.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0204986  normal  0.722319 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3976  extracellular solute-binding protein  28.3 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.108857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6677  extracellular solute-binding protein  26.45 
 
 		 277 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3166  extracellular solute-binding protein  29.77 
 
 		 279 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.22 
 
 		 272 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2011  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 		 282 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.986691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 276 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1986  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0177  extracellular solute-binding protein  28.14 
 
 		 267 aa  53.1  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7091  extracellular solute-binding protein family 3  27.27 
 
 		 276 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.51636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1548  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.87 
 
 		 272 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.159181  normal  0.942345 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5590  extracellular solute-binding protein family 3  24.89 
 
 		 277 aa  52.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.332068  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5951  extracellular solute-binding protein family 3  26.04 
 
 		 276 aa  52  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0245803  normal  0.0107841 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3481  extracellular solute-binding protein  27.22 
 
 		 274 aa  52  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.742913  normal  0.533743 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7227  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 		 262 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.87 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0237  extracellular solute-binding protein family 3  29.32 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.640745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 271 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5167  extracellular solute-binding protein family 3  27.27 
 
 		 318 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2155  extracellular solute-binding protein  21.53 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2201  extracellular solute-binding protein  21.53 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51731  normal  0.0309221 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2142  extracellular solute-binding protein  21.53 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.332487  hitchhiker  0.00274771 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0792  extracellular solute-binding protein  24.79 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.256903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0351  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 266 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3548  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  25.41 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2508  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.14 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.897054  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2649  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0433  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980273  hitchhiker  0.00000000179971 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0458  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 266 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357598  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2649  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.71 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2627  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  27.44 
 
 		 280 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0539096  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0887  extracellular solute-binding protein  27.97 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1134  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.29 
 
 		 305 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.276726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0366  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 266 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0588118  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4039  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0382  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 266 aa  50.1  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4588  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 275 aa  49.7  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0319028  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2237  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0917749  hitchhiker  0.00000401987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4395  extracellular solute-binding protein family 3  23.83 
 
 		 340 aa  50.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3796  extracellular solute-binding protein family 3  25.93 
 
 		 281 aa  49.3  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0150584  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 292 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 271 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3110  extracellular solute-binding protein family 3  24.75 
 
 		 278 aa  49.3  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 271 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2326  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter solute-binding protein  25.29 
 
 		 282 aa  49.3  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.129152  normal  0.475007 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 271 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1729  extracellular solute-binding protein family 3  26.79 
 
 		 264 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0729  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 318 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.446742  normal  0.30254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4387  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 318 aa  48.9  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  27.27 
 
 		 271 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 266 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  24.68 
 
 		 278 aa  48.9  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0357  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 		 270 aa  48.9  0.00007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  29.17 
 
 		 295 aa  49.3  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 266 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  28.85 
 
 		 271 aa  48.5  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>