More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0236 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0236  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  664    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2451  hypothetical protein  74.62 
 
 		 330 aa  504  1e-141  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0198  twin-arginine translocation pathway signal  62.61 
 
 		 328 aa  435  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.297337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0136  hypothetical protein  60.79 
 
 		 355 aa  424  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0805  hypothetical protein  52.96 
 
 		 328 aa  323  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0073  hypothetical protein  47.4 
 
 		 330 aa  294  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.614615  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0710  hypothetical protein  47.58 
 
 		 331 aa  287  2e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0604  hypothetical protein  47.85 
 
 		 329 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.492978 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4405  hypothetical protein  46.48 
 
 		 329 aa  286  4e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.631102  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4540  hypothetical protein  47.43 
 
 		 330 aa  285  5.999999999999999e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.645973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3116  twin-arginine translocation pathway signal  46.81 
 
 		 331 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.143461  normal  0.765055 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1766  twin-arginine translocation pathway signal  42.38 
 
 		 338 aa  271  1e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.120274 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0796  hypothetical protein  40.13 
 
 		 340 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.980673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  38.57 
 
 		 339 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1801  hypothetical protein  36.49 
 
 		 343 aa  207  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.939675  normal  0.361643 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  39.25 
 
 		 324 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3311  hypothetical protein  37.99 
 
 		 324 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4305  hypothetical protein  37.38 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2663  hypothetical protein  37.99 
 
 		 324 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  37.76 
 
 		 330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  37.76 
 
 		 330 aa  199  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  37.41 
 
 		 328 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  34.24 
 
 		 346 aa  196  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  36.18 
 
 		 332 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3576  hypothetical protein  36.48 
 
 		 330 aa  192  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.37147  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1315  hypothetical protein  36.71 
 
 		 328 aa  192  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.39846  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  36.09 
 
 		 328 aa  192  9e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1950  hypothetical protein  35.87 
 
 		 327 aa  191  1e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0031153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0567  hypothetical protein  33.79 
 
 		 329 aa  186  3e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  36.59 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1161  hypothetical protein  34.81 
 
 		 323 aa  186  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.334484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0599  hypothetical protein  36.05 
 
 		 325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127348  normal  0.507852 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  36.58 
 
 		 327 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  35.78 
 
 		 327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2943  hypothetical protein  35.4 
 
 		 333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.357737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4876  extra-cytoplasmic solute receptor  36.99 
 
 		 328 aa  183  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.748926  normal  0.754985 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  37.11 
 
 		 325 aa  183  3e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  35.92 
 
 		 322 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0300  hypothetical protein  34.69 
 
 		 337 aa  182  8.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.911939  normal  0.367492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1798  hypothetical protein  35.03 
 
 		 329 aa  182  8.000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.379878 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  35.84 
 
 		 325 aa  182  8.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  34.77 
 
 		 326 aa  182  9.000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2295  hypothetical protein  34.14 
 
 		 316 aa  182  9.000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.491669  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3575  hypothetical protein  35.62 
 
 		 334 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.571272  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  34.26 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4467  hypothetical protein  33.45 
 
 		 328 aa  180  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0114308  normal  0.0574707 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  34.69 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3901  hypothetical protein  35.25 
 
 		 325 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  34.95 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  37.03 
 
 		 341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  34.01 
 
 		 322 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1769  hypothetical protein  36.05 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416782  normal  0.417571 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4278  hypothetical protein  36.05 
 
 		 332 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  37.46 
 
 		 324 aa  179  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  38.06 
 
 		 322 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0265  hypothetical protein  35.71 
 
 		 323 aa  179  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  33.84 
 
 		 328 aa  179  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  34.83 
 
 		 327 aa  179  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  33.33 
 
 		 319 aa  178  9e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5514  hypothetical protein  38.72 
 
 		 330 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  36.96 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  34.72 
 
 		 325 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  34.04 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3593  hypothetical protein  35.1 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  35.62 
 
 		 336 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1885  hypothetical protein  36.43 
 
 		 323 aa  177  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3807  hypothetical protein  34.08 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0187  hypothetical protein  34.93 
 
 		 332 aa  176  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  33.54 
 
 		 326 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  33.73 
 
 		 330 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2145  hypothetical protein  35.45 
 
 		 330 aa  175  9e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.467573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1019  hypothetical protein  35.19 
 
 		 334 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.100584  normal  0.433272 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  32.6 
 
 		 328 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0125  hypothetical protein  35.05 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  33.9 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  34.01 
 
 		 335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2095  hypothetical protein  36.77 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3217  hypothetical protein  34.13 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0143  hypothetical protein  35.05 
 
 		 324 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.169608  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3697  hypothetical protein  34.05 
 
 		 334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583429  normal  0.151066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  32.08 
 
 		 351 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3913  extra-cytoplasmic solute receptor  36.51 
 
 		 332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107287  normal  0.463561 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  35.66 
 
 		 330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  35.66 
 
 		 330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3163  hypothetical protein  34.88 
 
 		 330 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2502  hypothetical protein  34.13 
 
 		 333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0326182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1691  hypothetical protein  35.57 
 
 		 331 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2763  hypothetical protein  36.54 
 
 		 322 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal  0.0763345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4430  hypothetical protein  35.03 
 
 		 328 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.840915  normal  0.593251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  33.01 
 
 		 335 aa  172  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3250  hypothetical protein  35.37 
 
 		 330 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.268792 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  36.21 
 
 		 328 aa  172  6.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  32.73 
 
 		 329 aa  172  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4563  hypothetical protein  33.45 
 
 		 329 aa  172  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.011816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5869  extra-cytoplasmic solute receptor  35.49 
 
 		 346 aa  171  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3566  hypothetical protein  35.35 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00357296  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3899  hypothetical protein  38.38 
 
 		 341 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129071  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  35.59 
 
 		 304 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  35.89 
 
 		 353 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1818  hypothetical protein  33.33 
 
 		 326 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00429449 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>