More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2463 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0610  sugar transporter family protein  84.69 
 
 		 431 aa  760    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.861991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2463  MFS transporter  100 
 
 		 431 aa  870    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04815  permease  84.8 
 
 		 431 aa  719    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 423 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  23.72 
 
 		 448 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  25.44 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  25.44 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  25.44 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  24.21 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  24.21 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1882  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0481298  normal  0.608146 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1553  major facilitator superfamily MFS_1  25.29 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  24.89 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  24.66 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  24.04 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  23.87 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  23.53 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  24.43 
 
 		 432 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  23.87 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  24.68 
 
 		 432 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  24.17 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  23.33 
 
 		 412 aa  70.1  0.00000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 480 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  24.11 
 
 		 480 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  25.68 
 
 		 446 aa  69.3  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  24.12 
 
 		 460 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 480 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  24.93 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  24.28 
 
 		 423 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  28.71 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 432 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  24.93 
 
 		 426 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  24.93 
 
 		 426 aa  67  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.364649 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  22.49 
 
 		 434 aa  67  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  22.86 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 480 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 480 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  23.82 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  24.04 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  22.8 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  22.22 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  22.36 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5071  major facilitator superfamily MFS_1  23.06 
 
 		 485 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.706796  normal  0.279172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0602  major facilitator superfamily MFS_1  22.04 
 
 		 459 aa  63.2  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  22.84 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  22.28 
 
 		 415 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  23.7 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 410 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  23.35 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1173  MFS short chain dicaboxylate:H+ symporter DcaK  22.09 
 
 		 421 aa  62  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.603793  normal  0.341481 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  23.52 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  21.76 
 
 		 479 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3393  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  21.96 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1232  major facilitator transporter  21.39 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  21.76 
 
 		 479 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  22.11 
 
 		 438 aa  61.6  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  26.58 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  21.12 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  21.71 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  23.3 
 
 		 416 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0741  major facilitator transporter  22.68 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0470116 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  22.94 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  22.64 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2152  major facilitator transporter  23.35 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.291  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  22.64 
 
 		 467 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  21.3 
 
 		 438 aa  60.1  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  22.93 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  22.77 
 
 		 463 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  22.44 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2622  major facilitator superfamily MFS_1  20.86 
 
 		 421 aa  59.3  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2507  benzoate transport  26.34 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19270  putative MFS transporter  22.6 
 
 		 455 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.149627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  21.43 
 
 		 491 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  21.9 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4993  MFS family membrane efflux protein  23.53 
 
 		 526 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.521864 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3364  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 463 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  24.25 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2058  major facilitator family protein  22.85 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0107331  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1678  major facilitator superfamily MFS_1  22.91 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.251673 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6160  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730505  normal  0.770759 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  22.77 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3564  major facilitator transporter  19.79 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4685  general substrate transporter  20.67 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0475747  normal  0.909787 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  25.08 
 
 		 406 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5381  transporter, MFS superfamily  23.62 
 
 		 432 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269188  normal  0.117501 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  23.25 
 
 		 420 aa  57  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2413  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 447 aa  57  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000787137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3160  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0312386 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>