More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0610 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2463  MFS transporter  84.69 
 
 		 431 aa  760    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0610  sugar transporter family protein  100 
 
 		 431 aa  866    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.861991  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04815  permease  88.12 
 
 		 431 aa  732    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  24.53 
 
 		 448 aa  87.8  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  25.5 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  25.22 
 
 		 428 aa  70.9  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1882  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0481298  normal  0.608146 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  24.71 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1553  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 439 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2448  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  22.87 
 
 		 412 aa  65.1  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3514  major facilitator superfamily transporter  24.46 
 
 		 429 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.522107  normal  0.962202 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6160  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 458 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730505  normal  0.770759 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4743  major facilitator transporter  25.23 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.524316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  25 
 
 		 472 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  28.29 
 
 		 430 aa  64.7  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0265  major facilitator superfamily permease  23.19 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0214342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  22.8 
 
 		 432 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  25.12 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  24.73 
 
 		 446 aa  62.8  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  22.02 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1996  major facilitator superfamily MFS_1  29.44 
 
 		 485 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.512683 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  23.38 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0667  major facilitator family transporter  25.37 
 
 		 494 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0482021  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5727  major facilitator transporter  24.65 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  23.61 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  22.92 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  23.54 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  25 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  24.94 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  24.94 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  24.94 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  23.92 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  23.37 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  24.19 
 
 		 434 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0382  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.660441 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  23.37 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.364649 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  23.81 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  23.37 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3505  major facilitator transporter  23.34 
 
 		 420 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5153  major facilitator transporter  24.5 
 
 		 475 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.507557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  23.19 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5132  major facilitator transporter  25.19 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 432 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0310  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 420 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2700  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0407  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0462175  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  22.9 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  22.76 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3393  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  21.8 
 
 		 430 aa  58.5  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  22.53 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  22.76 
 
 		 432 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0788  major facilitator family transporter  25.25 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.509193  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0386  major facilitator transporter  23.24 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  21.31 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  22.53 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  24.74 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1973  major facilitator transporter  25.25 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  22.53 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0555  major facilitator family transporter  25.25 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  22.97 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0486  major facilitator family transporter  25.25 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0312823  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4627  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2122  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 409 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0910  major facilitator family transporter  25 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.367874  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5986  major facilitator transporter  22.95 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2477  major facilitator superfamily MFS_1  22.95 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  23.88 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2070  major facilitator transporter  25 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.376866  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  25.29 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6741  major facilitator transporter  21.73 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  21.49 
 
 		 480 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1856  major facilitator transporter  21.3 
 
 		 438 aa  57  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  21.39 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1404  general substrate transporter  21.53 
 
 		 428 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1232  major facilitator transporter  22.57 
 
 		 421 aa  57  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  22.62 
 
 		 460 aa  57  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  21.49 
 
 		 480 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6282  major facilitator transporter  22.95 
 
 		 479 aa  57  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.384913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1173  MFS short chain dicaboxylate:H+ symporter DcaK  22.57 
 
 		 421 aa  57  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.603793  normal  0.341481 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3147  major facilitator transporter  24.75 
 
 		 434 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  26.13 
 
 		 445 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2772  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 406 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0243448  normal  0.307117 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3924  major facilitator superfamily transporter  21.56 
 
 		 438 aa  56.6  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.496152  normal  0.0457831 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  23.06 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  24.54 
 
 		 427 aa  56.6  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  23.1 
 
 		 462 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  21.24 
 
 		 415 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5752  major facilitator transporter  21.45 
 
 		 425 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.968797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>