More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04815 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0610  sugar transporter family protein  87.01 
 
 		 431 aa  764    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.861991  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04815  permease  100 
 
 		 431 aa  863    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2463  MFS transporter  83.76 
 
 		 431 aa  753    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1898  major facilitator superfamily MFS_1  26.23 
 
 		 448 aa  90.1  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3655  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 447 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.304643  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5734  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 423 aa  77.8  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1882  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0481298  normal  0.608146 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1553  major facilitator superfamily MFS_1  24.87 
 
 		 439 aa  76.6  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  23.83 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5568  transporter, MFS superfamily  23.74 
 
 		 432 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3968  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0624321 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3460  major facilitator transporter  22.49 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.42938  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04141  predicted transporter  25 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3722  General substrate transporter  25 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04104  hypothetical protein  25 
 
 		 405 aa  68.2  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5124  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 432 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0473861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5283  major facilitator transporter  22.49 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529847  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5576  major facilitator family transporter  23.38 
 
 		 432 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3653  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 		 446 aa  66.6  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5236  major facilitator transporter  24.25 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2575  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.491999 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3551  major facilitator transporter  23.43 
 
 		 432 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.629931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6160  major facilitator transporter  30.65 
 
 		 458 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730505  normal  0.770759 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5124  major facilitator transporter  24.27 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5624  major facilitator family transporter  24.18 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5139  major facilitator transporter  23.67 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5297  major facilitator family transporter  22.97 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5538  major facilitator family transporter  22.97 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2964  hypothetical protein  25 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.83907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0070  MFS permease  25.07 
 
 		 460 aa  64.7  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5693  major facilitator family transporter  22.97 
 
 		 433 aa  65.1  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0434  major facilitator superfamily MFS_1  23.56 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000104713  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  22.08 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4630  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 467 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.234892  hitchhiker  0.00910919 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4498  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 467 aa  62  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0152994  normal  0.24714 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  21.45 
 
 		 415 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1242  putative sialic acid transporter  23.32 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.364649 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1227  putative sialic acid transporter  23.32 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0647  major facilitator superfamily MFS_1  25.33 
 
 		 451 aa  61.2  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3497  major facilitator superfamily MFS_1  23.71 
 
 		 398 aa  61.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  21.34 
 
 		 415 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3774  major facilitator transporter  23.75 
 
 		 428 aa  60.8  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.108427 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1197  putative sialic acid transporter  23.59 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  28.65 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1895  major facilitator transporter  23.89 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.004098  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2632  major facilitator transporter  25.38 
 
 		 402 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127081  normal  0.954997 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7074  major facilitator transporter  25.96 
 
 		 436 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.884668 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4303  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 468 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  21.81 
 
 		 415 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3960  major facilitator transporter  23.49 
 
 		 425 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3228  major facilitator transporter  22.16 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.325137 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4932  major facilitator transporter  22.16 
 
 		 480 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.828486  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0896  major facilitator superfamily MFS_1  23.91 
 
 		 462 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6106  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  22.3 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8679  sugar transporter  23.31 
 
 		 533 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.546222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5742  major facilitator transporter  22.67 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3351  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.233758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1962  major facilitator transporter  23.39 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0235717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  21.38 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1920  major facilitator superfamily permease  22.04 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000507154  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  23.96 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  22.74 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2718  major facilitator superfamily aromatic acid transporter  27.03 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0133806  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  23.94 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0462  major facilitator family transporter  22.75 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1376  benzoate transport  26.29 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.282947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4438  benzoate transport  26.57 
 
 		 448 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00260043 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0532  major facilitator family transporter  22.75 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5727  major facilitator transporter  22.56 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4009  major facilitator transporter  22.63 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  21.48 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2870  major facilitator transporter  23.45 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000255107 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1524  major facilitator transporter  20.17 
 
 		 491 aa  57.4  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.400505  normal  0.0396773 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3933  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 399 aa  57  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000233422  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2564  major facilitator transporter  23.05 
 
 		 450 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4496  major facilitator transporter  21.8 
 
 		 434 aa  57  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5150  General substrate transporter  23.08 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0840975 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6265  major facilitator transporter  20.66 
 
 		 480 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3798  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.120406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6588  major facilitator transporter  22.43 
 
 		 415 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0439245 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1565  major facilitator transporter  20.66 
 
 		 480 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523471  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3822  sugar transporter  25.36 
 
 		 443 aa  56.6  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103912  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2518  major facilitator transporter  22.76 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4685  general substrate transporter  23.08 
 
 		 451 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0475747  normal  0.909787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2375  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 451 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661624  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0443  major facilitator superfamily MFS_1  25.42 
 
 		 461 aa  56.2  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1694  major facilitator transporter  22.08 
 
 		 409 aa  56.2  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3912  major facilitator transporter  23.37 
 
 		 453 aa  55.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6200  major facilitator transporter  25.2 
 
 		 492 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0622411 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5132  major facilitator transporter  22.88 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4347  benzoate transport  26.29 
 
 		 448 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0793736  normal  0.0224677 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3453  major facilitator transporter  23.7 
 
 		 472 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5283  major facilitator transporter  23.59 
 
 		 463 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.591426  normal  0.763827 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4705  major facilitator superfamily MFS_1  24.49 
 
 		 434 aa  55.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0828035 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5481  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 468 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5266  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 472 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5007  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 472 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3101  major facilitator transporter  23.46 
 
 		 472 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>