179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0136 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3032  siderophore biosynthesis protein, putative  59.63 
 
 
601 aa  744    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1053  IucA/IucC  42.96 
 
 
842 aa  707    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2538  IucA/IucC family protein  52.08 
 
 
604 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.836144  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1452  IucA/IucC family protein  59.47 
 
 
629 aa  744    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1518  IucA/IucC family protein  59.63 
 
 
631 aa  747    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.918024 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1508  IucA/IucC family protein  60.13 
 
 
631 aa  748    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2811  IucA/IucC family protein  60.9 
 
 
642 aa  756    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2710  IucA/IucC family protein  60.9 
 
 
642 aa  756    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2413  IucA/IucC family protein  60.23 
 
 
642 aa  752    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0136  siderophore biosynthesis protein  100 
 
 
819 aa  1708    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1654  IucA/IucC family protein  60.73 
 
 
642 aa  752    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000012306 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2732  IucA/IucC family protein  59.3 
 
 
642 aa  759    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00744667  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2439  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  52.25 
 
 
604 aa  642    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0288  IucA/IucC family protein  47.65 
 
 
635 aa  601  1e-170  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2544  IucA/IucC family protein  47.94 
 
 
614 aa  584  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2445  IucA/IucC family siderophore biosynthesis protein  47.94 
 
 
614 aa  585  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3462  IucA/IucC family protein  45.14 
 
 
594 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.479032  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0515  IucA/IucC family protein  45.3 
 
 
625 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2836  IucA/IucC family protein  44.93 
 
 
608 aa  553  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160458  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1071  IucA/IucC family protein  44.57 
 
 
613 aa  551  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.549269  normal  0.885774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2737  IucA/IucC family protein  45.15 
 
 
596 aa  547  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425518  normal  0.263271 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2548  IucA/IucC family protein  44.5 
 
 
596 aa  540  9.999999999999999e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.507194 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4292  IucA/IucC family protein  43.62 
 
 
597 aa  536  1e-151  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.489466  hitchhiker  0.00330556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2837  IucA/IucC family protein  45.21 
 
 
607 aa  535  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.18665  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1801  IucA/IucC family protein  36.15 
 
 
799 aa  511  1e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.0000155987  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0199  IucA/IucC family protein  39.5 
 
 
602 aa  462  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0412549 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0594  siderophore biosynthesis protein  37.31 
 
 
639 aa  433  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00413673  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3174  IucA/IucC family protein  34.55 
 
 
615 aa  373  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.443243  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3328  IucA/IucC family protein  32.82 
 
 
614 aa  348  2e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.935658 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0407  IucA/IucC  33.04 
 
 
601 aa  333  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.27175  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2833  IucA/IucC  34.37 
 
 
813 aa  323  6e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76703  normal  0.213309 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1811  IucA/IucC family protein  30.73 
 
 
599 aa  299  1e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0218  IucA/IucC family protein  30.73 
 
 
621 aa  296  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3255  IucA/IucC family protein  30.68 
 
 
621 aa  277  5e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0658  IucA/IucC family protein  29.93 
 
 
616 aa  257  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.577175  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0949  IucA/IucC family protein  26.97 
 
 
577 aa  255  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2658  IucA/IucC family protein  28.52 
 
 
572 aa  253  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.539637  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5060  IucA/IucC family protein  28.3 
 
 
615 aa  252  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00130311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0920  IucA/IucC family protein  27.38 
 
 
582 aa  246  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.185756  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3180  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  26.57 
 
 
580 aa  244  5e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1812  siderophore synthetase component, IucA/IucC  26.85 
 
 
578 aa  236  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4632  aerobactin synthase, IucC component  26.12 
 
 
580 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0784  IucA/IucC family protein  26.77 
 
 
582 aa  236  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0192  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  26.77 
 
 
582 aa  236  2.0000000000000002e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000752976 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0712  aerobactin siderophore biosynthesis protein IucC  26.77 
 
 
582 aa  235  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3345  petrobactin biosynthesis protein AsbB  24.49 
 
 
612 aa  213  1e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0268839  hitchhiker  0.0000000000000416803 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4058  IucA/IucC  25.07 
 
 
716 aa  208  4e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.309342  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1796  siderophore biosynthesis protein  23.66 
 
 
610 aa  206  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1984  petrobactin biosynthesis protein AsbB  23.9 
 
 
612 aa  206  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.216331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1839  siderophore biosynthesis protein  23.5 
 
 
610 aa  205  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2017  petrobactin biosynthesis protein AsbB  23.5 
 
 
610 aa  205  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0614699999999996e-42 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1813  siderophore biosynthesis protein  23.5 
 
 
610 aa  204  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00844264  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1982  siderophore biosynthesis protein  23.5 
 
 
612 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2674  IucA/IucC family protein  26.83 
 
 
618 aa  196  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.247069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2587  IucA/IucC  29.25 
 
 
619 aa  194  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.296644  hitchhiker  0.00946712 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1112  IucA/IucC  27.13 
 
 
617 aa  184  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.28831  normal  0.852167 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0586  IucA/IucC  25.72 
 
 
1148 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3031  siderophore biosynthesis protein, putative  46.89 
 
 
206 aa  169  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2301  siderophore synthetase component  26.34 
 
 
562 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1845  IucA/IucC family protein  22.31 
 
 
613 aa  168  4e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.330256  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2810  hypothetical protein  45.56 
 
 
221 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.218147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2731  hypothetical protein  45.56 
 
 
216 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0416274  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1655  siderophore biosynthesis protein, putative  44.74 
 
 
221 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000687205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2709  hypothetical protein  44.97 
 
 
236 aa  164  7e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2412  siderophore biosynthesis protein, putative  47.62 
 
 
229 aa  162  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1519  siderophore biosynthesis protein, putative  47.27 
 
 
224 aa  161  6e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554005 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1509  siderophore biosynthesis protein, putative  47.27 
 
 
221 aa  160  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1453  siderophore biosynthesis protein, putative  46.67 
 
 
227 aa  158  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00879  siderophore biosynthesis protein  24.73 
 
 
589 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0128879  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4056  IucA/IucC family protein  26.08 
 
 
998 aa  154  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.88864  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3761  IucA/IucC family protein  26.08 
 
 
998 aa  153  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0951466 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4393  IucA/IucC  25.31 
 
 
577 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2631  IucA/IucC family protein  26.35 
 
 
577 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6952  IucA/IucC family protein  23.63 
 
 
1153 aa  150  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4017  IucA/IucC family protein  26.23 
 
 
991 aa  147  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0297482  normal  0.327782 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0108  IucA/IucC family protein  22.5 
 
 
592 aa  140  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0112  IucA/IucC family protein  22.5 
 
 
592 aa  140  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3523  IucA/IucC family protein  23.48 
 
 
615 aa  134  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1072  Siderophore biosynthesis protein, conserved region  36.84 
 
 
209 aa  121  7e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0309618  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3461  IucA/IucC  33.33 
 
 
189 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0514  aceytltranferase  32.04 
 
 
196 aa  106  2e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2446  hypothetical protein  33.52 
 
 
192 aa  99.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2549  hypothetical protein  31.36 
 
 
188 aa  99  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.432912 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2545  putative siderophore biosynthetic enzyme  35.85 
 
 
192 aa  97.8  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2738  hypothetical protein  31.95 
 
 
188 aa  96.7  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.482702  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0287  aceytltranferase  31.71 
 
 
187 aa  94  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1280  hypothetical protein  22.57 
 
 
580 aa  90.1  1e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1652  siderophore synthase  20.8 
 
 
588 aa  90.9  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1279  hypothetical protein  23.2 
 
 
580 aa  89.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4293  hypothetical protein  29.63 
 
 
183 aa  89  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.49385  hitchhiker  0.000790517 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0585  IucA/IucC family protein  22.64 
 
 
925 aa  89  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0175917 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2594  hypothetical protein  32.42 
 
 
187 aa  86.3  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184474  normal  0.69464 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3273  putative acetyltransferase  31.93 
 
 
203 aa  85.9  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3906  IucA/IucC family protein  23.6 
 
 
633 aa  81.6  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2746  hypothetical protein  28.92 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.126222  hitchhiker  0.000868803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2439  hypothetical protein  29.67 
 
 
187 aa  79  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.397369  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2557  hypothetical protein  28.57 
 
 
184 aa  76.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.463676  normal  0.298043 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0105  IucA/IucC family protein  25.16 
 
 
584 aa  75.5  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.379013  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0109  IucA/IucC family protein  25.16 
 
 
584 aa  75.5  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110366  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3734  IucA/IucC family protein  22.49 
 
 
563 aa  74.7  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0245205  normal  0.144633 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>