More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001354 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001354  ferric siderophore transport system biopolymer transport protein ExbB  100 
 
 
232 aa  461  1e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024242  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05243  biopolymer transport protein  86.58 
 
 
232 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0326  TonB system transport protein ExbB1  70.54 
 
 
228 aa  280  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000984448  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1752  TonB system transport protein ExbB1  57.69 
 
 
226 aa  207  9e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00726097  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3671  TonB system transport protein ExbB1  45.25 
 
 
260 aa  156  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3237  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.28 
 
 
243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.123497  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4006  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.77 
 
 
244 aa  155  7e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0964  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.75 
 
 
244 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0950  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.37 
 
 
251 aa  148  6e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.213402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1019  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.29 
 
 
251 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0155072  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3340  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.29 
 
 
251 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191011  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0788  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.25 
 
 
264 aa  148  7e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00466749  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3329  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.53 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.15 
 
 
249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.171459  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.26 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0594941  decreased coverage  0.0034613 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.97 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000981257 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3906  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.95 
 
 
196 aa  73.2  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.286845  normal  0.293846 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11810  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.81 
 
 
216 aa  72.4  0.000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.41 
 
 
207 aa  70.5  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3210  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.09 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000028591  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3217  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.29 
 
 
202 aa  68.2  0.00000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.581955  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0349  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.16 
 
 
226 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.931428  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0746  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1510  exbB-like biopolymer transport  33.94 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.232406  normal  0.284557 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1029  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.35 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000146441  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.79 
 
 
206 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000000013307  unclonable  0.0000000588107 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0631  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  33.33 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.793155  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0591  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.48 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0990686 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.95 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.728472  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0580  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.67 
 
 
235 aa  65.9  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00547042  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1464  hypothetical protein  41.49 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1438  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.3 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2399  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.35 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0433367  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.88 
 
 
208 aa  64.7  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.162411  normal  0.347505 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1521  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.77 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.565129  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0561  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.73 
 
 
199 aa  64.3  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.305166 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2566  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.95 
 
 
208 aa  64.3  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.11709  decreased coverage  0.00204386 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1925  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
207 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2528  biopolymer transport EXBB-like transmembrane protein  29.85 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0033963  normal  0.0481325 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.53 
 
 
208 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3807  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.46 
 
 
324 aa  63.2  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2279  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.78 
 
 
233 aa  62.8  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0525667  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2130  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.87 
 
 
228 aa  62.8  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0769434  normal  0.602608 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0286  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.51 
 
 
212 aa  62.4  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.79 
 
 
246 aa  61.2  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06640  putative biopolymer transport protein  28.11 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.304214  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2643  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.59 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.232186  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0756  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.56 
 
 
217 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1248  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.75 
 
 
210 aa  61.6  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2061  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.12 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.590103 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0904  Biopolymer transport protein TolR  34.78 
 
 
453 aa  60.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1153  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.87 
 
 
457 aa  60.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2805  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.79 
 
 
206 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00166663  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0409  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.13 
 
 
235 aa  60.1  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.77 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000000225479  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1369  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.64 
 
 
206 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0351  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.65 
 
 
220 aa  59.7  0.00000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2483  putative biopolymer transport exbB-like transmembrane protein  31.21 
 
 
213 aa  59.7  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0658113  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1865  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.53 
 
 
210 aa  59.7  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.646793 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  36.56 
 
 
234 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 
237 aa  59.7  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.691155  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2092  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.94 
 
 
204 aa  59.7  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0117508  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0387  biopolymer transport protein  48.65 
 
 
220 aa  59.7  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  41.33 
 
 
239 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4891  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.39 
 
 
216 aa  59.3  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  41.33 
 
 
239 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1152  TonB system transport protein ExbB2  37.36 
 
 
180 aa  59.3  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06759  hypothetical protein  27.03 
 
 
455 aa  59.3  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.14 
 
 
230 aa  58.9  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0443122 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4607  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.05 
 
 
214 aa  58.9  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  31.58 
 
 
236 aa  58.5  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2393  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.65 
 
 
197 aa  58.5  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  31.58 
 
 
236 aa  58.5  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1396  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.3 
 
 
220 aa  58.5  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.739677  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0112  biopolymer transport protein TolR  34.78 
 
 
451 aa  58.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000847  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  35.11 
 
 
455 aa  58.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08070  ExbB proton channel  40 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21820  ExbB proton channel  40 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25490  putative tolQ-type transport protein  32.77 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0178753  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21700  ExbB proton channel  40 
 
 
236 aa  57.8  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.798679  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0916  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.65 
 
 
200 aa  58.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.931657  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3153  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.82 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2178  putative tolQ-type transport protein  32.77 
 
 
211 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  31.21 
 
 
236 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0287  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.37 
 
 
216 aa  57  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0477  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.93 
 
 
233 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1556  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.43 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.25632  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2303  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.43 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.466313  normal  0.0952346 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1436  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.2 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.726638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6006  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.18 
 
 
244 aa  57  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.819621 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.29 
 
 
218 aa  56.6  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.145562  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.23 
 
 
228 aa  56.2  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2673  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.3 
 
 
253 aa  55.5  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2553  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.64 
 
 
192 aa  55.5  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00158299 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5123  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.33 
 
 
234 aa  55.5  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0113  TonB system transport protein ExbB2  26.9 
 
 
169 aa  55.8  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0282  TonB-system energizer ExbB  37.08 
 
 
142 aa  55.5  0.0000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.53 
 
 
209 aa  55.1  0.0000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.475045  hitchhiker  0.0000283851 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00590  biopolymer transport protein  47.3 
 
 
220 aa  55.5  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.421222  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2342  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.78 
 
 
224 aa  55.5  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.348836  normal  0.105576 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>