More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001059 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001059  putative two-component response regulator  100 
 
 		 235 aa  480  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2286  response regulator GltR  51.05 
 
 		 241 aa  225  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.336147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2418  two component transcriptional regulator  50.85 
 
 		 237 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4373  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 243 aa  218  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4212  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 241 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  44.26 
 
 		 241 aa  210  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1111  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  48.52 
 
 		 245 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.53214 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1050  two component transcriptional regulator  49.57 
 
 		 260 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.36572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1011  two component transcriptional regulator  49.15 
 
 		 241 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675078  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1012  winged helix family two component transcriptional regulator  49.15 
 
 		 241 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0418267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  45.83 
 
 		 243 aa  209  4e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2272  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.08 
 
 		 240 aa  208  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.543841  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  47.86 
 
 		 245 aa  208  6e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  47.86 
 
 		 245 aa  207  8e-53  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1290  DNA-binding response regulator  48.51 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22940  two-component response regulator GltR  49.57 
 
 		 242 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.281067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1148  two component transcriptional regulator  48.29 
 
 		 243 aa  206  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000285872  normal  0.61114 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1936  two-component response regulator GltR  49.57 
 
 		 242 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985974  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1245  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.5 
 
 		 256 aa  206  4e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0649443  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.25 
 
 		 236 aa  204  8e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2739  two component transcriptional regulator  46.03 
 
 		 241 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.107521 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1631  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.96 
 
 		 275 aa  202  3e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1299  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.09 
 
 		 242 aa  202  3e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0317425  normal  0.569469 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 238 aa  202  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4347  two component transcriptional regulator  46.84 
 
 		 244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.215798  normal  0.0155623 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3459  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0398  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 246 aa  197  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.761758 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5142  two component transcriptional regulator  45.8 
 
 		 246 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0161802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4614  two component transcriptional regulator  45.8 
 
 		 246 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5018  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 246 aa  194  7e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.259334  normal  0.450101 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3112  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 246 aa  194  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4604  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.41 
 
 		 246 aa  193  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1190  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.882993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4429  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.41 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23129  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3477  two component transcriptional regulator  45.11 
 
 		 261 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.76 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0474711  normal  0.959624 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2345  two component transcriptional regulator  44.21 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000474063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  45.34 
 
 		 239 aa  191  6e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  45.96 
 
 		 240 aa  191  8e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3772  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.83932 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4048  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.507063  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  43.83 
 
 		 243 aa  190  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1587  two component transcriptional regulator  45.26 
 
 		 261 aa  190  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.367759  normal  0.752499 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2275  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.92 
 
 		 246 aa  189  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0529078  normal  0.301367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2223  DNA-binding response regulator  46.64 
 
 		 230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.375792  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0516  response regulator receiver  45.11 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.62167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2032  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  46.64 
 
 		 259 aa  188  5e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3909  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  45.57 
 
 		 247 aa  188  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1148  two component transcriptional regulator  44.31 
 
 		 247 aa  188  8e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2374  two component transcriptional regulator  47.01 
 
 		 245 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.348064  normal  0.588953 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0815  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.4 
 
 		 246 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404408  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2387  DNA-binding response regulator  45.53 
 
 		 236 aa  186  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2008  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 246 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.574198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1909  two component transcriptional regulator  44.96 
 
 		 246 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.596265  normal  0.171962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2403  winged helix family two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 246 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3292  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 246 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0994  two-component response regulator  44.68 
 
 		 246 aa  184  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.78 
 
 		 239 aa  184  9e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0474  transcriptional regulatory protein OmpR, putative  44.44 
 
 		 238 aa  184  9e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.558106  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  45.49 
 
 		 237 aa  184  9e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4197  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.865203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3303  two component transcriptional regulator  44.73 
 
 		 245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3907  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 245 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2086  two component transcriptional regulator  44.92 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7106  two component transcriptional regulator  43.4 
 
 		 237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.323714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  43.4 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  43.35 
 
 		 244 aa  180  1e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2703  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 241 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.790666  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  42.02 
 
 		 236 aa  179  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5704  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.140603  normal  0.300283 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0413  putative transcriptional regulatory protein OmpR  44.02 
 
 		 238 aa  179  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16231  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0441  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 245 aa  179  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0771  two component transcriptional regulator  43.28 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.132718 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  41.7 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  44.26 
 
 		 240 aa  179  4.999999999999999e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 240 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  43.78 
 
 		 262 aa  178  5.999999999999999e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0150  osmolarity response regulator  41.7 
 
 		 241 aa  178  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4633  osmolarity response regulator  42.55 
 
 		 241 aa  178  8e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1115  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3326  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 243 aa  177  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1453  two component transcriptional regulator  43.46 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.952418  normal  0.0249242 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1971  two component transcriptional regulator  41.74 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.999465  normal  0.0504331 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3637  osmolarity response regulator  41.28 
 
 		 241 aa  177  1e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1980  osmolarity response regulator  42.98 
 
 		 243 aa  176  2e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431202  normal  0.459947 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4017  osmolarity response regulator  42.13 
 
 		 241 aa  176  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  42.31 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.31 
 
 		 241 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1082  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.68 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00181983  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1878  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 242 aa  175  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.559477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3538  osmolarity response regulator  42.13 
 
 		 240 aa  175  4e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000279148  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0308  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 248 aa  175  5e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.030574  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3811  osmolarity response regulator  42.8 
 
 		 241 aa  175  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0373241 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3902  osmolarity response regulator  42.8 
 
 		 241 aa  175  5e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.140952 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0168  osmolarity response regulator  40.85 
 
 		 241 aa  175  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  42.06 
 
 		 239 aa  175  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4357  two component transcriptional regulator  44.05 
 
 		 252 aa  174  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  41.88 
 
 		 240 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0581  winged helix family two component transcriptional regulator  42.42 
 
 		 242 aa  174  7e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.296955  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>