More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1992 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_1992  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
327 aa  650    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2093  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.3 
 
 
321 aa  293  2e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000858649  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.32 
 
 
323 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2708  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.16 
 
 
315 aa  271  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1563  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  43.69 
 
 
331 aa  258  9e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.117544  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0085  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.17 
 
 
318 aa  258  1e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0126141  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2553  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.48 
 
 
308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.336984  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2331  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.16 
 
 
317 aa  249  3e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.61 
 
 
339 aa  249  4e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0077711 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.9 
 
 
300 aa  249  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.601892  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.82 
 
 
304 aa  248  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3242  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.25 
 
 
310 aa  248  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0946  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.6 
 
 
322 aa  246  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0463053  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1119  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.08 
 
 
318 aa  246  4e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0757482  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.17 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20490  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  43.29 
 
 
326 aa  244  9.999999999999999e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.086583  normal  0.344725 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01640  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  41.55 
 
 
324 aa  242  7.999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2031  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
315 aa  241  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0664  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.51 
 
 
324 aa  239  5e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000161767  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0121  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.31 
 
 
298 aa  237  2e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.53 
 
 
332 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2656  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.92 
 
 
315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3315  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
324 aa  233  3e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29230  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  42.36 
 
 
334 aa  233  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33150  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  44.37 
 
 
336 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.96599 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0929  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.32 
 
 
330 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.293677  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4041  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.07 
 
 
330 aa  233  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2401  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.38 
 
 
340 aa  232  6e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0135356  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3819  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.52 
 
 
322 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595689  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0281  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.96 
 
 
315 aa  229  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.15 
 
 
312 aa  229  6e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.3931  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.32 
 
 
335 aa  228  7e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.245622  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3113  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.64 
 
 
325 aa  228  8e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.2 
 
 
332 aa  228  9e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.1 
 
 
326 aa  227  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.095702  normal  0.124231 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0773  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.36 
 
 
311 aa  227  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000374508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0151  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.67 
 
 
323 aa  225  6e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
333 aa  225  7e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5564  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.23 
 
 
346 aa  223  4e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.271716  normal  0.315175 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.55 
 
 
334 aa  223  4.9999999999999996e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  0.0603947 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3000  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.27 
 
 
328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.999287 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.75 
 
 
326 aa  219  3.9999999999999997e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.278038  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.4 
 
 
331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0705285 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02840  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  36.86 
 
 
324 aa  219  5e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.840845  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2171  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.61 
 
 
324 aa  215  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.38 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.05 
 
 
339 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00187301  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0393  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.16 
 
 
326 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3569  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.62 
 
 
324 aa  213  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10090  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  38.75 
 
 
331 aa  212  7e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0761  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  36.45 
 
 
316 aa  210  3e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000797199  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1916  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.57 
 
 
320 aa  209  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000481644  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1581  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
305 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1610  putative transport system integral membrane protein  38.91 
 
 
341 aa  206  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.46 
 
 
350 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.14041  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17870  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  39.18 
 
 
327 aa  204  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.246834  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0059  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.4 
 
 
320 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.542171  normal  0.242962 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
327 aa  202  9e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05740  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  39.8 
 
 
346 aa  200  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04190  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  35.33 
 
 
313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1768  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.45 
 
 
320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0555688  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1014  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.6 
 
 
323 aa  198  1.0000000000000001e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1292  transmembrane lipoprotein  33.53 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.817448 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
326 aa  196  3e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4681  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.99 
 
 
310 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00295974  normal  0.937314 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0143  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.41 
 
 
318 aa  196  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3209  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.43 
 
 
319 aa  195  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.24552  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2732  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.62 
 
 
316 aa  192  8e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0340422  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.79 
 
 
319 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.52 
 
 
332 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0595  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 
313 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13600  ABC-type polysaccharide transport system, permease component  39.16 
 
 
332 aa  191  2e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.248364  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1438  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.73 
 
 
335 aa  188  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.650576  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2192  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
307 aa  186  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0695  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.41 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000207262  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2339  ABC transporter, permease protein  34.63 
 
 
322 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.552195  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2051  sugar transport system (permease) (binding protein dependent transporter)  34.85 
 
 
308 aa  176  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2785  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.79 
 
 
351 aa  175  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5753  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.1 
 
 
329 aa  174  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.623467  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.19 
 
 
333 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1715  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.36 
 
 
316 aa  172  9e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.33 
 
 
307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2571  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
292 aa  162  7e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0859971  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2456  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
316 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1547  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.2 
 
 
478 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000265018  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2527  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.33 
 
 
309 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.849073  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.64 
 
 
316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00640866  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.89 
 
 
310 aa  115  8.999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.155614  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.64 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1875  MalF-type ABC sugar transport systems permease component  31.25 
 
 
350 aa  114  3e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0432685  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30 
 
 
316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000245953 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0699  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.4 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.216687  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0911  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  28.68 
 
 
315 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.488788  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0563  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  33.03 
 
 
294 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.22835  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4872  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.41 
 
 
310 aa  107  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.181942  normal  0.51159 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.82 
 
 
307 aa  106  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3596  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.66 
 
 
325 aa  105  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.295531  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3574  carbohydrate ABC transporter permease  31.65 
 
 
294 aa  104  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.15 
 
 
310 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>