More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0316 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0316  lysine biosynthesis enzyme LysX  100 
 
 		 282 aa  571  1.0000000000000001e-162  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3469  lysine biosynthesis enzyme LysX  68.48 
 
 		 285 aa  383  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3597  lysine biosynthesis enzyme LysX  65 
 
 		 283 aa  384  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.109467 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1059  lysine biosynthesis enzyme LysX  68.59 
 
 		 282 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.411939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3306  lysine biosynthesis enzyme LysX  60.98 
 
 		 287 aa  351  7e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0318  lysine biosynthesis enzyme LysX  56.83 
 
 		 288 aa  334  9e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2724  lysine biosynthesis enzyme LysX  55.68 
 
 		 281 aa  310  1e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.772565  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0438  lysine biosynthesis enzyme LysX  52.5 
 
 		 281 aa  300  2e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00025755 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1151  lysine biosynthesis enzyme LysX  51.94 
 
 		 292 aa  293  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.492268  normal  0.326079 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1761  lysine biosynthesis enzyme LysX  42.75 
 
 		 296 aa  255  5e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0328  lysine biosynthesis enzyme LysX  42.91 
 
 		 294 aa  254  8e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  44.01 
 
 		 294 aa  254  8e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1502  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  42.76 
 
 		 291 aa  249  5e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0772  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  40 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.788078 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  46.69 
 
 		 272 aa  233  3e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1295  lysine biosynthesis enzyme LysX  39.93 
 
 		 280 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00562119 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6289  lysine biosynthesis enzyme LysX  43.01 
 
 		 293 aa  219  5e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1288  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.85 
 
 		 285 aa  203  3e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0210035 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1137  lysine biosynthesis enzyme LysX  35.64 
 
 		 283 aa  185  7e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0237722  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1991  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 281 aa  179  2.9999999999999997e-44  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.317152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0291  lysine biosynthesis enzyme LysX  41.13 
 
 		 302 aa  179  4.999999999999999e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.42871  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1704  lysine biosynthesis enzyme LysX  33.21 
 
 		 282 aa  178  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.3971  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1298  lysine biosynthesis enzyme LysX  38.83 
 
 		 271 aa  176  3e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.18194  normal  0.20368 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0259  lysine biosynthesis enzyme LysX  40.75 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.661273 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0168  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  35.87 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000151287  normal  0.111818 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1379  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  40.15 
 
 		 267 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.595719 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1291  lysine biosynthesis enzyme LysX  39.25 
 
 		 282 aa  169  7e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1118  alpha-L-glutamate ligase  41.26 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.36995  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1580  alpha-L-glutamate ligase  37.5 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.261705  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0874  SSU ribosomal protein S6P modification protein  41.44 
 
 		 292 aa  128  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.205884  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1729  alpha-L-glutamate ligase  40.98 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3203  SSU ribosomal protein S6P modification protein  35.56 
 
 		 329 aa  125  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.398244  normal  0.0345991 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0182  alpha-L-glutamate ligase  40.44 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0564  alpha-L-glutamate ligase  34.47 
 
 		 293 aa  125  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.194605  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2302  alpha-L-glutamate ligase  31.87 
 
 		 292 aa  124  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0136928 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0721  alpha-L-glutamate ligase  33.7 
 
 		 292 aa  123  3e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.609176 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1944  alpha-L-glutamate ligase  34.42 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.123222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2074  alpha-L-glutamate ligase  33.49 
 
 		 292 aa  116  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0692  SSU ribosomal protein S6P modification protein  37.02 
 
 		 296 aa  115  6.9999999999999995e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.136634  hitchhiker  0.0000298511 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2585  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.35 
 
 		 324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1185  alpha-L-glutamate ligase  30.8 
 
 		 265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0136  alpha-L-glutamate ligase  32.34 
 
 		 265 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0680474 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1276  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.4 
 
 		 310 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0912  alpha-L-glutamate ligase  28.62 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.966867  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1297  alpha-L-glutamate ligase  28.62 
 
 		 266 aa  106  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.276689 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2353  alpha-L-glutamate ligase  32.41 
 
 		 301 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000863949  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0723  alpha-L-glutamate ligase  31.48 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.349493 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1808  L-2-aminoadipate N-acetyltransferase  28.21 
 
 		 269 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5941  ribosomal protein S6 modification protein  32.23 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2266  SSU ribosomal protein S6P modification protein  32.11 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.484979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68660  ribosomal protein S6 modification protein  32.23 
 
 		 301 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1871  ribosomal protein S6 modification protein  31.85 
 
 		 301 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0686  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.65 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.0000000000000259145  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0760  ribosomal protein S6 modification protein  32.19 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00088888  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2388  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.94 
 
 		 300 aa  99.8  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1747  alpha-L-glutamate ligase  30.56 
 
 		 299 aa  99  7e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0481  hypothetical protein  28.75 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0457  hypothetical protein  28.75 
 
 		 302 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3274  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  34.9 
 
 		 300 aa  98.6  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23180  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.98 
 
 		 411 aa  97.4  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2364  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  35.82 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3037  alpha-L-glutamate ligase  27.88 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.342883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0262  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.4 
 
 		 301 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345619 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2254  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.26 
 
 		 314 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1366  ribosomal protein S6 modification protein  31.19 
 
 		 300 aa  97.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1766  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  29.82 
 
 		 301 aa  96.7  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.918853 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0145  alpha-L-glutamate ligase  29.96 
 
 		 264 aa  96.7  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.563722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1299  ribosomal protein S6 modification protein  32.87 
 
 		 301 aa  96.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.186898  normal  0.0117357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05140  ribosomal protein S6 modification enzyme RimK  31.22 
 
 		 301 aa  96.3  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0158  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  32.87 
 
 		 295 aa  95.9  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.314526  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1687  S6 modification enzyme RimK  33.68 
 
 		 310 aa  95.9  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1070  alpha-L-glutamate ligase  28.37 
 
 		 269 aa  95.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.642798  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0924  ribosomal protein S6 modification protein  31.48 
 
 		 300 aa  94.7  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4964  alpha-L-glutamate ligase  30.99 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000940925 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0011  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.14 
 
 		 327 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.991277  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00716  ribosomal protein S6 modification protein  29.55 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2039  SSU ribosomal protein S6P modification protein  30.33 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.014544 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3661  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.99 
 
 		 301 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0273  alpha-L-glutamate ligase  30.99 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1643  alpha-L-glutamate ligase  31.08 
 
 		 300 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0124301 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0248  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.99 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0180089 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0363  SSU ribosomal protein S6P modification protein  31.36 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.26 
 
 		 327 aa  93.6  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.532418  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1549  S6 modification enzyme RimK  29.24 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0263  alpha-L-glutamate ligase  30.99 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.553998 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2754  alpha-L-glutamate ligase  31.02 
 
 		 299 aa  93.6  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0894554  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00857  ribosomal protein S6 modification protein  31.02 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2790  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.02 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00863  hypothetical protein  31.02 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0011  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.26 
 
 		 327 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1105  S6 modification enzyme RimK  34.8 
 
 		 262 aa  93.2  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.352091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1006  ribosomal protein S6 modification protein  31.02 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.195269 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0955  ribosomal protein S6 modification protein  31.02 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2744  ribosomal protein S6 modification protein  31.02 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.155924 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0847  alpha-L-glutamate ligase  25.71 
 
 		 269 aa  92.8  5e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.652747  normal  0.189578 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2779  alpha-L-glutamate ligase  30.97 
 
 		 302 aa  93.2  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000513891  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2480  ribosomal protein S6 modification protein  31.02 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2289  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  30.09 
 
 		 300 aa  93.2  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6087  alpha-L-glutamate ligase, RimK family  31.09 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0948  ribosomal protein S6 modification protein  31.48 
 
 		 300 aa  92.4  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>