238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2838 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2838  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 		 231 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.21955  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1933  uracil-DNA glycosylase  76.21 
 
 		 227 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1979  uracil-DNA glycosylase  76.21 
 
 		 227 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.68386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2152  uracil-DNA glycosylase  75.11 
 
 		 225 aa  347  1e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1913  uracil-DNA glycosylase  76.21 
 
 		 227 aa  347  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.36371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4215  uracil-DNA glycosylase  75.56 
 
 		 225 aa  342  4e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.098635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1622  uracil-DNA glycosylase  74.67 
 
 		 225 aa  337  9.999999999999999e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0212304  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3819  uracil-DNA glycosylase  76 
 
 		 225 aa  337  9.999999999999999e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.937863  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3204  uracil-DNA glycosylase  74.66 
 
 		 229 aa  332  2e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12991  uracil-DNA glycosylase  78.85 
 
 		 227 aa  329  2e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.105831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0728  uracil-DNA glycosylase  71.56 
 
 		 238 aa  328  3e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09210  Uracil-DNA glycosylase  70.22 
 
 		 225 aa  325  4.0000000000000003e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.031789  normal  0.516797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0813  uracil-DNA glycosylase  71.43 
 
 		 227 aa  322  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0733111 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1341  uracil-DNA glycosylase  72.52 
 
 		 228 aa  320  9.999999999999999e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5982  Uracil-DNA glycosylase superfamily  69.51 
 
 		 224 aa  313  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.569392  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4601  uracil-DNA glycosylase  70.22 
 
 		 225 aa  310  9e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2944  uracil-DNA glycosylase  70.09 
 
 		 226 aa  309  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.551901  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07580  Uracil-DNA glycosylase  69.23 
 
 		 225 aa  303  1.0000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1403  uracil-DNA glycosylase  68.92 
 
 		 233 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.117941 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1489  uracil-DNA glycosylase  68.64 
 
 		 223 aa  297  9e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0103431  normal  0.970473 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0087  uracil-DNA glycosylase  65.64 
 
 		 230 aa  293  1e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.179154  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0685  uracil-DNA glycosylase  67.42 
 
 		 224 aa  293  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0841896  hitchhiker  0.0000169832 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21850  Uracil-DNA glycosylase  66.21 
 
 		 229 aa  288  5.0000000000000004e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00151672  normal  0.371882 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31640  Uracil-DNA glycosylase  63.96 
 
 		 259 aa  271  5.000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.720517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0715  uracil-DNA glycosylase  58.59 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.805249 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1990  uracil-DNA glycosylase  66.2 
 
 		 213 aa  270  1e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.236215  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4002  uracil-DNA glycosylase  66.04 
 
 		 230 aa  268  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0889  uracil-DNA glycosylase  60.94 
 
 		 263 aa  251  5.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0774  uracil-DNA glycosylase  61.47 
 
 		 234 aa  246  3e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04060  Uracil-DNA glycosylase  60.09 
 
 		 225 aa  241  7.999999999999999e-63  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3639  Uracil-DNA glycosylase superfamily  57.14 
 
 		 240 aa  241  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2154  uracil-DNA glycosylase  51.72 
 
 		 232 aa  211  5.999999999999999e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.249827  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  49.33 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  45.37 
 
 		 225 aa  194  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5297  uracil-DNA glycosylase  47.56 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0258  uracil-DNA glycosylase  49.2 
 
 		 225 aa  191  9e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  45.21 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0249  uracil-DNA glycosylase  49.2 
 
 		 225 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0362  uracil-DNA glycosylase  47.8 
 
 		 232 aa  188  5.999999999999999e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0490386  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3318  uracil-DNA glycosylase  50.67 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0407603  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5527  uracil-DNA glycosylase  42.73 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.77536  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5191  uracil-DNA glycosylase  42.73 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  42.73 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  42.73 
 
 		 225 aa  184  8e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  45 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000051966  hitchhiker  0.00000589305 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  49.5 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2839  uracil-DNA glycosylase  47 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5079  uracil-DNA glycosylase  42.73 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000684584  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  47.32 
 
 		 231 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  45.7 
 
 		 247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  48.78 
 
 		 218 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5521  uracil-DNA glycosylase  43.42 
 
 		 225 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  47.32 
 
 		 231 aa  181  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5493  uracil-DNA glycosylase  42.73 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5250  uracil-DNA glycosylase  43.42 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5648  uracil-DNA glycosylase  43.42 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1297  uracil-DNA glycosylase  45.58 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00279375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  49.25 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000031363  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5430  uracil-DNA glycosylase  44.55 
 
 		 225 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  53.25 
 
 		 223 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  48.47 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  49.03 
 
 		 233 aa  177  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  45.95 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12267  predicted protein  42.73 
 
 		 227 aa  175  4e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2831  uracil-DNA glycosylase  46.08 
 
 		 221 aa  175  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00406873  normal  0.934783 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  48.56 
 
 		 261 aa  175  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0922  uracil-DNA glycosylase  51.16 
 
 		 226 aa  175  6e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000179843  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  46.43 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  47.74 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3256  uracil-DNA glycosylase  47.58 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  51.98 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  41.78 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  48.54 
 
 		 241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3988  uracil-DNA glycosylase  45.89 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.409874 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  46.22 
 
 		 241 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  47 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  45.29 
 
 		 231 aa  171  7.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  44 
 
 		 226 aa  171  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1139  uracil-DNA glycosylase  50.26 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  42.73 
 
 		 224 aa  170  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  46.07 
 
 		 222 aa  170  2e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  43.78 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  44.65 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  45.85 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321985  hitchhiker  0.00000000131635 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  44.65 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2138  uracil-DNA glycosylase  50.93 
 
 		 222 aa  169  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.205482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  46.61 
 
 		 222 aa  168  6e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0228  uracil-DNA glycosylase  45.58 
 
 		 216 aa  168  8e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4548  uracil-DNA glycosylase  42.98 
 
 		 225 aa  167  9e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  44.84 
 
 		 229 aa  167  9e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3314  uracil-DNA glycosylase  41.7 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.518113  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  41.55 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2914  uracil-DNA glycosylase  47.16 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0434  uracil-DNA glycosylase  46.15 
 
 		 304 aa  167  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.227613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0458  uracil-DNA glycosylase  46.15 
 
 		 304 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.22898 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  45.5 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3688  uracil-DNA glycosylase  43.54 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3501  uracil-DNA glycosylase  47.37 
 
 		 253 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000421907 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0649  uracil-DNA glycosylase  47.22 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0945  uracil-DNA glycosylase  47.22 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>