More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1934 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1934  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  100 
 
 		 215 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12614  Holliday junction resolvase  70.74 
 
 		 188 aa  254  7e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000342168  normal  0.676212 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2573  Holliday junction resolvase  71.67 
 
 		 194 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3826  Holliday junction resolvase  72.43 
 
 		 220 aa  234  9e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2300  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  74.69 
 
 		 189 aa  232  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2304  Holliday junction resolvase  71.35 
 
 		 193 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2265  Holliday junction resolvase  71.35 
 
 		 193 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2312  Holliday junction resolvase  71.35 
 
 		 193 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1692  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  69.23 
 
 		 330 aa  211  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15060  Holliday junction resolvase  70.89 
 
 		 196 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3396  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  67.9 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00187802  hitchhiker  0.00000696704 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17510  Holliday junction endonuclease RuvC  57.37 
 
 		 189 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.919514  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2385  Holliday junction endonuclease RuvC  56.32 
 
 		 177 aa  178  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2352  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.18 
 
 		 170 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0837  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.71 
 
 		 185 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0698715  normal  0.0994154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6113  Crossover junction endodeoxyribonuclease  56.47 
 
 		 200 aa  168  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0688405 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2095  Holliday junction resolvase  51.4 
 
 		 182 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  59.35 
 
 		 199 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0256287  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1794  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.71 
 
 		 188 aa  162  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.282589  normal  0.0953637 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3056  Holliday junction resolvase  60.37 
 
 		 207 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.631668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1992  Holliday junction resolvase  57.52 
 
 		 199 aa  161  6e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0125062 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1370  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  55.17 
 
 		 190 aa  161  8.000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.984472  normal  0.0696246 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2033  Holliday junction resolvase  59.62 
 
 		 192 aa  161  9e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000766099 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2303  Holliday junction resolvase  58.97 
 
 		 192 aa  159  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0280076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3828  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  54.17 
 
 		 176 aa  155  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5146  Holliday junction resolvase  61.11 
 
 		 178 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00188604  decreased coverage  0.000100944 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1369  Holliday junction resolvase  60 
 
 		 172 aa  153  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.242329 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2109  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  62.18 
 
 		 176 aa  151  8.999999999999999e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0239412  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1798  Holliday junction resolvase  60.65 
 
 		 175 aa  150  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0451382  hitchhiker  0.00012152 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15340  Holliday junction endonuclease RuvC  57.89 
 
 		 208 aa  148  5e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0768617  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2065  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  58.71 
 
 		 193 aa  148  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0838  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.92 
 
 		 193 aa  144  7.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13940  Holliday junction endonuclease RuvC  53.5 
 
 		 197 aa  144  9e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.191488  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3627  Holliday junction resolvase  41.36 
 
 		 165 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00535771  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1345  Holliday junction endonuclease RuvC  56.79 
 
 		 178 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.306219  normal  0.526243 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0180  Holliday junction resolvase  41.88 
 
 		 162 aa  138  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0451  Holliday junction resolvase  54.19 
 
 		 194 aa  135  5e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.118775  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1346  Holliday junction resolvase  42.11 
 
 		 166 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000795843  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12900  Holliday junction endonuclease RuvC  58 
 
 		 211 aa  130  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.522457  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0890  Holliday junction resolvase  43.14 
 
 		 164 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0795494 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3178  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  57.41 
 
 		 188 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1808  Holliday junction resolvase  56.83 
 
 		 160 aa  128  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0111  Holliday junction resolvase  44.74 
 
 		 156 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1798  Holliday junction endonuclease RuvC  40.52 
 
 		 161 aa  125  4.0000000000000003e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582609 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1632  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  44.08 
 
 		 160 aa  124  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.286173  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12330  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.85 
 
 		 165 aa  122  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.128626  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3179  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.82 
 
 		 164 aa  121  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.844491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1702  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  41.46 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.131729  normal  0.717874 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1109  Holliday junction resolvase  41.18 
 
 		 159 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000183978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1114  Holliday junction resolvase  33.33 
 
 		 164 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0903  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.36 
 
 		 164 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1452  Holliday junction resolvase  36.42 
 
 		 182 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.883917  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1433  hypothetical protein  42.04 
 
 		 172 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000864662  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1364  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  43.42 
 
 		 162 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.553646  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1322  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.47 
 
 		 179 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725718  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2595  Holliday junction resolvase  43.83 
 
 		 164 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143043 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0932  Holliday junction resolvase  39.02 
 
 		 164 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000174044 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0924  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42 
 
 		 165 aa  112  6e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.250191  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1152  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.33 
 
 		 189 aa  111  7.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2115  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  42.53 
 
 		 184 aa  111  9e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.805464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3314  Holliday junction resolvase  39.24 
 
 		 164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3618  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.65 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.1831  normal  0.457471 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1660  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.42 
 
 		 163 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.183319  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1614  Holliday junction resolvase  34.19 
 
 		 158 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4753  Holliday junction resolvase  37.2 
 
 		 165 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_385  crossover junction endodeoxyribonuclease  36.31 
 
 		 165 aa  106  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0420  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.31 
 
 		 167 aa  106  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1075  Holliday junction resolvase  38.75 
 
 		 164 aa  105  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.228203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1415  Holliday junction resolvase  38.06 
 
 		 171 aa  105  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000523238  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0400  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.77 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0984  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  39.47 
 
 		 200 aa  105  6e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11451  Holliday junction resolvase  35.33 
 
 		 157 aa  105  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.447359  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4363  Holliday junction resolvase  39.88 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1642  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.42 
 
 		 191 aa  104  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0719  Holliday junction resolvase  39.88 
 
 		 168 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1377  Holliday junction resolvase  33.77 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.180632  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2672  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 		 176 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00163378  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0443  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.67 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0379  Holliday junction resolvase  34.97 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2182  Holliday junction resolvase  38 
 
 		 173 aa  102  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.64085  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0394  Holliday junction resolvase  34.97 
 
 		 181 aa  101  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.638558 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0744  Holliday junction resolvase  38.12 
 
 		 164 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000123972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1065  Holliday junction resolvase  32.67 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0002  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  31.61 
 
 		 157 aa  100  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.075802  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0503  Holliday junction resolvase  34.36 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.46163 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1651  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  33.97 
 
 		 157 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1822  Holliday junction resolvase  30.77 
 
 		 157 aa  100  2e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.21855  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0658  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  36.13 
 
 		 191 aa  99.8  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.545827  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0426  Holliday junction resolvase  35.95 
 
 		 181 aa  99.8  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.633574  normal  0.046933 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0957  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  38.04 
 
 		 171 aa  99.4  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0164  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  35.48 
 
 		 192 aa  99  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11591  Holliday junction resolvase  34 
 
 		 157 aa  99  5e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1666  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.01 
 
 		 163 aa  99  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1854  Holliday junction resolvase  32.47 
 
 		 157 aa  98.6  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2011  crossover junction endodeoxyribonuclease RuvC  37.34 
 
 		 164 aa  98.6  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1484  Holliday junction resolvase  38.82 
 
 		 163 aa  97.8  1e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11601  Holliday junction resolvase  33.33 
 
 		 157 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4543  Holliday junction resolvase  40.13 
 
 		 174 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2694  Holliday junction resolvase  36.6 
 
 		 180 aa  97.1  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218252  normal  0.976349 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1130  Holliday junction resolvase  35.95 
 
 		 275 aa  96.7  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>