More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0978 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0978  NLP/P60 protein  100 
 
 		 384 aa  744    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1266  NLP/P60 protein  42.53 
 
 		 362 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1599  NLP/P60 protein  48.57 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0891153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1239  NLP/P60  41.41 
 
 		 362 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.00968494  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1256  NLP/P60 protein  41.41 
 
 		 362 aa  213  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.589306 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4838  NLP/P60 protein  40.89 
 
 		 359 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.11848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1783  NLP/P60 protein  59.74 
 
 		 317 aa  186  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07830  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  66.41 
 
 		 372 aa  186  6e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6442  NLP/P60 protein  63.85 
 
 		 392 aa  178  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2262  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.87 
 
 		 388 aa  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0792  NLP/P60 protein  48.51 
 
 		 535 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2683  NLP/P60 protein  54.46 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468332  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1506  NLP/P60 protein  48.98 
 
 		 524 aa  97.4  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.483483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0142  NLP/P60 protein  50.96 
 
 		 370 aa  94.4  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2692  NLP/P60 protein  43.38 
 
 		 162 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18950  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  48.65 
 
 		 556 aa  89.7  8e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.10475 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5001  NLP/P60 protein  45.79 
 
 		 204 aa  89.4  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.132684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0573  NLP/P60 protein  42.2 
 
 		 388 aa  87.8  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.774962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3095  NLP/P60 protein  41.28 
 
 		 452 aa  87.8  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.378956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  47.92 
 
 		 257 aa  87.4  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0480  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  45.87 
 
 		 390 aa  86.3  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.22 
 
 		 329 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2844  NLP/P60 protein  48.04 
 
 		 259 aa  85.9  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8534  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  41.46 
 
 		 438 aa  85.5  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0174309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  43.86 
 
 		 332 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10024  hypothetical protein  43.22 
 
 		 281 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  40.57 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0148  NLP/P60 protein  48.04 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0913  NLP/P60 protein  51.16 
 
 		 200 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0980  NLP/P60 protein  31.05 
 
 		 230 aa  84.7  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4480  NLP/P60 protein  33.33 
 
 		 340 aa  85.1  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26310  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  44.21 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2429  NLP/P60 protein  38.89 
 
 		 278 aa  83.6  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.328079 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12218  hypothetical protein  49.48 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.327955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3287  NLP/P60  41.32 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3349  NLP/P60 protein  41.32 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0832432  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1960  NLP/P60 protein  40.71 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0530532  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  40.71 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0754  lytic transglycosylase, catalytic  49.46 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.970703  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1030  NLP/P60 family secreted protein  43.33 
 
 		 340 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.427961  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  43.27 
 
 		 222 aa  82.8  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6019  NLP/P60  39.82 
 
 		 223 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377627  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  39.82 
 
 		 223 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  39.82 
 
 		 223 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  35.83 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09540  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  48.81 
 
 		 280 aa  81.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.623217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2342  Lytic transglycosylase catalytic  41.43 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.920192  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0175  cell wall endopeptidase, family M23/M37  39.83 
 
 		 1048 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.131665  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2144  NLP/P60 protein  43.48 
 
 		 374 aa  81.6  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8043  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  45.19 
 
 		 210 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.433259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2986  NLP/P60 protein  43.12 
 
 		 216 aa  81.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0120192 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3298  NLP/P60 protein  41.38 
 
 		 372 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.154902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3049  NLP/P60 protein  47.06 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1072  NLP/P60 protein  41.54 
 
 		 393 aa  80.9  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.191144  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2273  NLP/P60 protein  46.24 
 
 		 333 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.543976  normal  0.489772 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  38.94 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2959  NLP/P60 protein  43.14 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.454421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2074  NLP/P60 protein  43.82 
 
 		 295 aa  80.5  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.591046  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3552  NLP/P60 protein  43.88 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0023  NLP/P60 protein  46 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.371839  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1543  NlpC/P60 family protein  31.18 
 
 		 275 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.179042 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3235  NLP/P60 protein  43.75 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.177919  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3145  NLP/P60 protein  48.39 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.120353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9152  Cell wall-associated hydrolase (invasion- associated protein)-like protein  36.25 
 
 		 321 aa  79.7  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01625  predicted lipoprotein  31.18 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.712982  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1985  NLP/P60 protein  31.18 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.778309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1852  NlpC/P60 family protein  31.18 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000302623  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1868  NlpC/P60 family protein  31.18 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000206609  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1974  NLP/P60 protein  31.18 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01615  hypothetical protein  31.18 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.749344  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1734  NlpC/P60 family protein  31.18 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4077  NLP/P60 protein  42.98 
 
 		 308 aa  79  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0063374  normal  0.206509 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2367  NlpC/P60 family protein  31.9 
 
 		 271 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00414236  normal  0.27776 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  36.59 
 
 		 232 aa  79  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0479  NLP/P60  37.29 
 
 		 225 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.972324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1029  putative secreted protein  47.25 
 
 		 331 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.781321  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  37.21 
 
 		 197 aa  78.2  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1699  cell wall-associated hydrolase  47.25 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.26912e-16 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2497  NLP/P60 protein  38.05 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000164638  normal  0.0130851 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4384  NLP/P60 protein  41.88 
 
 		 556 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000240419  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4528  NLP/P60 protein  42.99 
 
 		 370 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  41.23 
 
 		 532 aa  77.8  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1640  NLP/P60 family protein  38.05 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000364437  normal  0.336888 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  40.52 
 
 		 556 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7119  NLP/P60 protein  51.65 
 
 		 182 aa  77.8  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0018  NLP/P60 protein  37.17 
 
 		 188 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32150  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  40.17 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0191937  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2105  NLP/P60 family protein  38.05 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000576333  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3208  NLP/P60 family protein  38.05 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00320254  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2543  NlpC/P60 domain-containing protein  38.05 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.241327  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1378  NLP/P60 family protein  38.05 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0650104  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1602  NLP/P60 family protein  38.05 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000000624175  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2630  NLP/P60 family protein  38.05 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000022944  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  44.66 
 
 		 536 aa  77  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1049  NLP/P60 protein  40 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0796  NLP/P60 protein  47.06 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  38.26 
 
 		 476 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2489  NlpC/P60 domain-containing protein  38.05 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00285101  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4909  NLP/P60 protein  42.2 
 
 		 335 aa  77.4  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>