More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0953 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 144 aa  281  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5460  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 159 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.599234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1665  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0641  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5638  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.109485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1689  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0524  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1638  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 159 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.570464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4454  MarR family transcriptional regulator  58.96 
 
 		 139 aa  137  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.691105  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4541  MarR family transcriptional regulator  58.96 
 
 		 139 aa  137  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.786222  normal  0.801932 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4836  MarR family transcriptional regulator  58.21 
 
 		 139 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 139 aa  133  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1731  MarR family transcriptional regulator  57.25 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5859  MarR family transcriptional regulator  58.75 
 
 		 89 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0346402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2446  regulatory protein MarR  38.73 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 142 aa  57  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6388  transcriptional regulator, MarR family  30.08 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  28.33 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2839  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 151 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5701  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 184 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0574544  normal  0.0180901 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2761  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 165 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2937  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 165 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 153 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  37.27 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0933  transcriptional regulator, MarR family  40.96 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.611634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  29.63 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2322  transcriptional regulator, TrmB  32.73 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2650  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038621  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2545  MarR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00936337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5904  transcriptional regulator, MarR family  39.77 
 
 		 172 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.174555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2015  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 205 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.870425 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  27.48 
 
 		 139 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0353  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthases-like protein  34.09 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3199  transcriptional regulator, MarR family  45.07 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.534315  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  47.62 
 
 		 146 aa  50.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  43.42 
 
 		 189 aa  50.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  34.12 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5857  MarR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 85 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0150711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7675  transcriptional regulator, MarR family  41.77 
 
 		 157 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0241  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 165 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.932018  normal  0.191669 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  39.73 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  38.27 
 
 		 287 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  37.66 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 		 171 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  23.28 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  35.29 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  32.71 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  26.04 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  28.08 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  33.04 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>