86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0874 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0874  major facilitator transporter  100 
 
 		 450 aa  882    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0682  major facilitator transporter  53.67 
 
 		 454 aa  507  9.999999999999999e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0373  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 459 aa  318  2e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.259758  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0355  major facilitator transporter  37.94 
 
 		 459 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000720237  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1458  major facilitator transporter  29.24 
 
 		 480 aa  190  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0397  hypothetical protein  29.07 
 
 		 422 aa  168  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0195929  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0233  major facilitator superfamily MFS_1  30.32 
 
 		 457 aa  166  6.9999999999999995e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1763  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 453 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000455527  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2087  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 446 aa  127  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000442741  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5054  major facilitator superfamily MFS_1  26.65 
 
 		 462 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0102448  normal  0.0163601 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1005  major facilitator superfamily MFS_1  25.59 
 
 		 446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2034  major facilitator transporter  25 
 
 		 504 aa  113  7.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1712  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.200643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1339  major facilitator superfamily MFS_1  24.59 
 
 		 471 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5596  major facilitator superfamily MFS_1  23.53 
 
 		 531 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0855834  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0794  major facilitator transporter  28.16 
 
 		 461 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0909  hypothetical protein  28.21 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.765839  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_781  hypothetical protein  28 
 
 		 461 aa  94.4  4e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3236  major facilitator superfamily MFS_1  20.78 
 
 		 513 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.113654 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0968  major facilitator superfamily protein  23.71 
 
 		 468 aa  91.3  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.623645  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0184  major facilitator transporter  22.07 
 
 		 470 aa  91.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.012641 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0793  major facilitator transporter  21.99 
 
 		 482 aa  88.6  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00320766 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0357  major facilitator transporter  22.58 
 
 		 472 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2800  hypothetical protein  24.29 
 
 		 397 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0367  major facilitator superfamily MFS_1  22.58 
 
 		 472 aa  87.8  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000109722 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0364  major facilitator transporter  22.26 
 
 		 472 aa  87.8  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2443  major facilitator superfamily MFS_1  22.22 
 
 		 457 aa  87.8  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000052902  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0359  major facilitator transporter  22.58 
 
 		 471 aa  86.7  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0029  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 427 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0271  hypothetical protein  23.03 
 
 		 491 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0334  twin-arginine translocation pathway signal  21.78 
 
 		 474 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3845  twin-arginine translocation pathway signal  22.99 
 
 		 476 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3609  twin-arginine translocation pathway signal  21.78 
 
 		 474 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0365  major facilitator superfamily permease  22.04 
 
 		 474 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3806  major facilitator transporter  21.53 
 
 		 495 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0201  major facilitator superfamily MFS_1  22.98 
 
 		 402 aa  72.8  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.196345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1748  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 444 aa  70.5  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0189374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1691  major facilitator transporter  23.1 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000499428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5604  major facilitator superfamily MFS_1  19.8 
 
 		 457 aa  62.4  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.638903  normal  0.244185 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1907  major facilitator transporter  19.28 
 
 		 469 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000193036  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3428  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6190  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2056  major facilitator transporter  20.14 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000877049  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1065  major facilitator transporter  22 
 
 		 419 aa  53.5  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.632992  normal  0.786866 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2212  hypothetical protein  23.31 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.814869  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1675  major facilitator superfamily MFS_1  23.08 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2080  major facilitator superfamily transporter  23.08 
 
 		 400 aa  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.592815 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4967  major facilitator transporter  18.84 
 
 		 440 aa  51.6  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.880384  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0984  major facilitator superfamily MFS_1  22.87 
 
 		 391 aa  51.2  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0902256  normal  0.170133 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1862  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 440 aa  50.4  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144262  normal  0.586915 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1791  major facilitator superfamily MFS_1  26.7 
 
 		 420 aa  50.1  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3936  major facilitator transporter  20.23 
 
 		 438 aa  50.1  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3525  major facilitator superfamily MFS_1  20.29 
 
 		 404 aa  48.5  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63708  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2380  drug transporter, putative  28.43 
 
 		 458 aa  48.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0827  major facilitator transporter  24.52 
 
 		 406 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0216762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0398  major facilitator transporter  21.23 
 
 		 408 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1067  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 		 423 aa  47  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0207259  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2454  major facilitator transporter  27.91 
 
 		 510 aa  47  0.0007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1194  major facilitator superfamily MFS_1  21.49 
 
 		 405 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2583  major facilitator transporter  19.41 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3029  major facilitator transporter  19.58 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000550731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3317  major facilitator transporter  19.84 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1277  major facilitator transporter  22.03 
 
 		 410 aa  45.8  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1026  major facilitator transporter  18.48 
 
 		 407 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00890  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G15490)  26.03 
 
 		 591 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.525892 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1826  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.793514  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00358  permease  22.75 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1175  major facilitator superfamily MFS_1  22.46 
 
 		 419 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0759672  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1426  major facilitator superfamily MFS_1  25.93 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.681295  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3461  major facilitator superfamily MFS_1  19.57 
 
 		 405 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1312  major facilitator superfamily MFS_1  20.06 
 
 		 418 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 415 aa  44.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4810  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 555 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0423  major facilitator family transporter  22.87 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2864  major facilitator family transporter  22.87 
 
 		 413 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1756  major facilitator family transporter  22.87 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1569  major facilitator family transporter  22.87 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1224  major facilitator family transporter  22.87 
 
 		 413 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0380  major facilitator family transporter  22.87 
 
 		 408 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3888  major facilitator transporter  20.08 
 
 		 427 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1709  major facilitator transporter  24.14 
 
 		 404 aa  44.3  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0167  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000230184  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02985  MFS drug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08530)  30.22 
 
 		 626 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.225796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0200  major facilitator superfamily MFS_1  25.49 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3349  major facilitator transporter  21.3 
 
 		 441 aa  43.5  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4108  major facilitator transporter  21.3 
 
 		 402 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>