210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0433 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0433  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 259 aa  508  1e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0824  periplasmic solute binding protein  41.87 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0801  periplasmic solute binding protein  41.87 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0860  periplasmic solute binding protein  35.05 
 
 		 298 aa  149  3e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00530614  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  32.68 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  28.37 
 
 		 295 aa  89.4  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  26.55 
 
 		 339 aa  79.7  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  24.11 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  26.22 
 
 		 297 aa  73.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  22.71 
 
 		 288 aa  72  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  25.29 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  27.31 
 
 		 322 aa  68.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  21.83 
 
 		 321 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  22.15 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  27.36 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  24.72 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  22.94 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  21.94 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1329  high-affinity zinc transporter periplasmic component  23.03 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00390701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  21.79 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0248  periplasmic solute binding protein  25.9 
 
 		 287 aa  62  0.000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01361  hypothetical protein  25.17 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  20.88 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2593  high-affinity zinc transporter periplasmic component  24.16 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00016843  normal  0.856449 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0842  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  26.85 
 
 		 282 aa  59.7  0.00000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.290902  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  22.56 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  26.16 
 
 		 345 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  24.03 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  23.81 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01828  high-affinity zinc transporter periplasmic component  23.33 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1783  periplasmic solute binding protein  23.33 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000935054  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01816  hypothetical protein  23.33 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1775  high-affinity zinc transporter periplasmic component  23.33 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1951  high-affinity zinc transporter periplasmic component  23.33 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00866903  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2087  high-affinity zinc transporter periplasmic component  23.33 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000165105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  24.83 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0953  high-affinity zinc transporter periplasmic component  23.05 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0035869  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  20.8 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0053  periplasmic solute binding protein  22.69 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0166309  normal  0.103773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  21.19 
 
 		 346 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  20.08 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  22.22 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0098  twin-arginine translocation pathway signal  22.33 
 
 		 320 aa  56.2  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  22.35 
 
 		 371 aa  55.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0119  periplasmic solute binding protein  21.45 
 
 		 344 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.527461 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1071  periplasmic solute binding protein  20.14 
 
 		 306 aa  55.5  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2856  periplasmic solute binding protein  22.22 
 
 		 325 aa  55.5  0.0000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  25.98 
 
 		 278 aa  55.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  25.76 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1194  periplasmic solute binding protein  42.19 
 
 		 329 aa  54.7  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170646 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  22.22 
 
 		 313 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  22.83 
 
 		 314 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  22.83 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  23.11 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1604  ABC transporter substrate-binding protein  22.69 
 
 		 308 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0613847 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  21.72 
 
 		 313 aa  53.9  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  22.83 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  22.83 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  21.19 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  22.83 
 
 		 314 aa  54.3  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  22.91 
 
 		 368 aa  53.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3616  periplasmic solute binding protein  24.07 
 
 		 378 aa  53.9  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0144381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3183  periplasmic solute binding protein  22.42 
 
 		 371 aa  53.5  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0392805  normal  0.124808 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  20.63 
 
 		 299 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02035  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  24.68 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1667  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  25.19 
 
 		 297 aa  52.8  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0185  periplasmic solute binding protein  22.1 
 
 		 307 aa  52.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3046  periplasmic solute binding protein  25.29 
 
 		 336 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205239  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  20 
 
 		 301 aa  52.4  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1015  solute binding protein  27.49 
 
 		 310 aa  52.4  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  24.02 
 
 		 301 aa  52.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  22.15 
 
 		 300 aa  52  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  20 
 
 		 309 aa  52  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  24.09 
 
 		 296 aa  51.6  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3927  periplasmic solute binding protein  22.83 
 
 		 309 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.51869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2853  periplasmic solute binding protein  21.82 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2426  high-affinity zinc transporter periplasmic component  21.03 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000208109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  19.38 
 
 		 315 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  26.02 
 
 		 303 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2251  high-affinity zinc transporter periplasmic component  33.33 
 
 		 340 aa  51.6  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  21.03 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_002978  WD0937  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  26.77 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.388709  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  22.05 
 
 		 319 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5108  periplasmic solute binding protein  32.1 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  22.05 
 
 		 337 aa  50.8  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1232  periplasmic solute binding protein  22.74 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  25.32 
 
 		 301 aa  50.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33560  putative adhesion protein  22.3 
 
 		 317 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000392177  normal  0.054682 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  23.11 
 
 		 292 aa  50.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  25.56 
 
 		 318 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2852  putative adhesion protein  22.3 
 
 		 314 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2090  periplasmic solute binding protein  21.54 
 
 		 300 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2423  periplasmic solute binding protein  23.13 
 
 		 296 aa  50.4  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.890095  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  21.79 
 
 		 321 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2895  twin-arginine translocation pathway signal  25.24 
 
 		 310 aa  50.4  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1704  putative high-affinity zinc uptake system protein  33.33 
 
 		 356 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0200273  normal  0.0153509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3980  periplasmic solute binding protein  21.18 
 
 		 354 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.749936 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  21.76 
 
 		 326 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03390  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  20.08 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  20.94 
 
 		 318 aa  49.7  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>