More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004106 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  100 
 
 
295 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01361  hypothetical protein  76.11 
 
 
293 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  52.23 
 
 
297 aa  321  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1667  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  54.45 
 
 
297 aa  314  9e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0953  high-affinity zinc transporter periplasmic component  43.21 
 
 
310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0035869  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2593  high-affinity zinc transporter periplasmic component  43.62 
 
 
310 aa  245  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00016843  normal  0.856449 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  43.36 
 
 
314 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  43.36 
 
 
314 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  43.36 
 
 
314 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  43.36 
 
 
314 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  43.36 
 
 
314 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1827  high-affinity zinc transporter periplasmic component  40.81 
 
 
339 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0735941  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1329  high-affinity zinc transporter periplasmic component  43.42 
 
 
352 aa  242  5e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00390701  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2087  high-affinity zinc transporter periplasmic component  43.42 
 
 
310 aa  242  5e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000165105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1783  periplasmic solute binding protein  43.26 
 
 
328 aa  242  6e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000935054  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01828  high-affinity zinc transporter periplasmic component  43.26 
 
 
310 aa  242  7e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1775  high-affinity zinc transporter periplasmic component  43.26 
 
 
310 aa  242  7e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000650264  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01816  hypothetical protein  43.26 
 
 
310 aa  242  7e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1951  high-affinity zinc transporter periplasmic component  43.26 
 
 
310 aa  242  7e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00866903  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2773  high-affinity zinc transporter periplasmic component  40.13 
 
 
321 aa  239  4e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000694266  hitchhiker  0.00715956 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2027  high-affinity zinc transporter periplasmic component  42.61 
 
 
318 aa  237  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000130529  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2140  high-affinity zinc transporter periplasmic component  42.61 
 
 
318 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000251275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2111  high-affinity zinc transporter periplasmic component  40 
 
 
339 aa  236  4e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0209857  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2251  high-affinity zinc transporter periplasmic component  41.48 
 
 
340 aa  235  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2426  high-affinity zinc transporter periplasmic component  40.62 
 
 
314 aa  232  7.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000208109  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  40.67 
 
 
307 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  40.67 
 
 
307 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2142  high-affinity zinc transporter periplasmic component  38.53 
 
 
340 aa  227  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000717331  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  39.71 
 
 
313 aa  224  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00830  ABC transporter, periplasmic binding protein  43.07 
 
 
297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  40.28 
 
 
309 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0275  periplasmic solute binding protein  38.14 
 
 
313 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  37.46 
 
 
308 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  37.05 
 
 
344 aa  216  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3183  periplasmic solute binding protein  34.49 
 
 
371 aa  213  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0392805  normal  0.124808 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1122  periplasmic solute binding protein  38.34 
 
 
328 aa  212  7e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0137  periplasmic solute binding protein  38.74 
 
 
302 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0120  periplasmic solute binding protein  38.41 
 
 
302 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5108  periplasmic solute binding protein  38.74 
 
 
302 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2751  periplasmic solute binding protein  37.71 
 
 
332 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4176  periplasmic solute binding protein  34.13 
 
 
346 aa  209  7e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1122  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  35.4 
 
 
334 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.124728  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1027  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  35.4 
 
 
334 aa  207  1e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5268  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  36.57 
 
 
311 aa  205  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0135  periplasmic solute binding protein  37.67 
 
 
318 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2384  periplasmic solute binding protein  35.9 
 
 
351 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691591  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  33.92 
 
 
347 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  32.66 
 
 
303 aa  188  8e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1194  periplasmic solute binding protein  32.89 
 
 
329 aa  187  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.170646 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0312  periplasmic solute binding protein  30.14 
 
 
362 aa  173  2.9999999999999996e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0842  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  34.43 
 
 
282 aa  166  5e-40  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.290902  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0248  periplasmic solute binding protein  32.35 
 
 
287 aa  155  9e-37  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0577  periplasmic solute binding protein  31.46 
 
 
301 aa  153  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.289421  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4140  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 
326 aa  152  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.101102 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1892  periplasmic solute binding protein  29.38 
 
 
321 aa  152  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00897518  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1256  high-affinity zinc transporter periplasmic component  40.22 
 
 
372 aa  149  6e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000280798  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0188  periplasmic solute binding protein  26.32 
 
 
334 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494723  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1704  putative high-affinity zinc uptake system protein  35.06 
 
 
356 aa  136  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0200273  normal  0.0153509 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  30.88 
 
 
292 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_002978  WD0937  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  29.09 
 
 
293 aa  132  5e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.388709  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3253  periplasmic solute binding protein  29.97 
 
 
347 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0556768 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3151  hypothetical protein  27.11 
 
 
336 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.506548 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3571  ABC zinc transporter, periplasmic binding protein ZnuA  29.57 
 
 
345 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.04 
 
 
320 aa  123  4e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  29.39 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3616  periplasmic solute binding protein  31.19 
 
 
378 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0144381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  28.74 
 
 
312 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  28.86 
 
 
312 aa  116  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  26.41 
 
 
311 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  25.28 
 
 
302 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  27.37 
 
 
368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  27.3 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  28.15 
 
 
308 aa  113  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  30.77 
 
 
285 aa  114  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  27.66 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  27.66 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  27.66 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  27.42 
 
 
303 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1216  periplasmic solute binding protein  29.66 
 
 
278 aa  112  5e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  26.95 
 
 
316 aa  112  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  26.95 
 
 
316 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  28.34 
 
 
365 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  28.52 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 
356 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  26.95 
 
 
316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  27.66 
 
 
316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  27.31 
 
 
309 aa  109  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  23.45 
 
 
311 aa  109  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  27.3 
 
 
316 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  25.94 
 
 
307 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  26.47 
 
 
295 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  28.1 
 
 
292 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  26.51 
 
 
318 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  29.96 
 
 
265 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2317  periplasmic solute binding protein  26.77 
 
 
300 aa  106  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  28.1 
 
 
309 aa  106  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0060  XRE family transcriptional regulator  27.49 
 
 
326 aa  105  9e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.741905  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  28.52 
 
 
309 aa  105  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  24.41 
 
 
331 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  27.11 
 
 
310 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>