More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2881 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2881  cytochrome c, class I  100 
 
 		 103 aa  203  5e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  55.88 
 
 		 107 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  69.44 
 
 		 273 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  58.33 
 
 		 287 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0629  cytochrome c, class I  58.67 
 
 		 102 aa  90.1  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1873  putative cytochrome c  54.32 
 
 		 102 aa  84.3  5e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal  0.677809 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  48.08 
 
 		 98 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0264  cytochrome c class I  47.44 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  51.28 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  50 
 
 		 108 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0123  cytochrome c class I  46.25 
 
 		 418 aa  71.2  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.266844  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  43.4 
 
 		 104 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  44.14 
 
 		 112 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  39.47 
 
 		 192 aa  68.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  40.24 
 
 		 238 aa  68.2  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000045  cytochrome c553  38.78 
 
 		 106 aa  67  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  40 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  40 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  40 
 
 		 105 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  46.43 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  45.54 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  41.67 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  39.25 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  41.67 
 
 		 221 aa  64.7  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  38.32 
 
 		 229 aa  63.9  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  45.24 
 
 		 205 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  38.46 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  39.42 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  42.16 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1634  cytochrome c class I  49.32 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.18479  normal  0.474892 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  40.57 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0524  cytochrome c, class I  38.24 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614003 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0934  cytochrome c class I  36.11 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2249  cytochrome c class I  39.13 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.802822 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00327  cytochrome C552  44.44 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  43.48 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0391  cytochrome c, class I  45.19 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.401855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05667  cytochrome-c oxidase  39.47 
 
 		 108 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  39.78 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1464  cytochrome c, class I  43.75 
 
 		 98 aa  58.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00242813  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3651  cytochrome c, class I  44.23 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  35.64 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  40.74 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2330  cytochrome c, class I  36.96 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2353  cytochrome c class I  36.96 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1718  cytochrome c, class I  36.96 
 
 		 119 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507301  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  47.3 
 
 		 202 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  36.54 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  40.38 
 
 		 193 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1587  cytochrome c, class I  35.92 
 
 		 220 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  43.59 
 
 		 179 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  37.65 
 
 		 206 aa  57  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  34.58 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  37.74 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5672  cytochrome c, class I  38.04 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  40.85 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2369  cytochrome c, class I  38.04 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166553  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  41 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  34.58 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  34.58 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  34.58 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  34.26 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  34.58 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  33.33 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  34.58 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  34.58 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  36.79 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  34.58 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  35.24 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  37.08 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2409  cytochrome c-552  42.25 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0908  cytochrome c, class I  35.4 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.413276  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0707  cytochrome c554  34.62 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0335  cytochrome c, class I  43.56 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  41.43 
 
 		 216 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  41.43 
 
 		 217 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4237  cytochrome c class I  44.29 
 
 		 262 aa  53.9  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00192123  normal  0.323742 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  37.62 
 
 		 113 aa  53.9  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  41.03 
 
 		 206 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1108  hypothetical protein  39.33 
 
 		 248 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  32.69 
 
 		 205 aa  53.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  35.78 
 
 		 225 aa  53.5  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3951  cytochrome c, class I  40.74 
 
 		 221 aa  52.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  33.65 
 
 		 206 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  38.95 
 
 		 237 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0904  cytochrome c, class I  36.92 
 
 		 120 aa  53.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1588  cytochrome c, class I  38.74 
 
 		 221 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166336  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  36.79 
 
 		 206 aa  52.8  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1859  cytochrome c family protein  35.71 
 
 		 324 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.886955  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0064  putative cytochrome C precursor  42.86 
 
 		 222 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  40.85 
 
 		 209 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  36.11 
 
 		 213 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1516  cytochrome c553-like protein  36.89 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.513352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0615  cytochrome c, class I  34.52 
 
 		 218 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0594  cytochrome c class I  34.78 
 
 		 218 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3908  cytochrome c, class I  39.42 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2099  cytochrome c class I  35.51 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149898 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1543  cytochrome c-553  40.66 
 
 		 102 aa  51.6  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.31178  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  40.24 
 
 		 198 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>