258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2205 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3414  4-alpha-glucanotransferase  63.11 
 
 		 677 aa  822    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.723218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2205  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 702 aa  1404    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1347  4-alpha-glucanotransferase  52.14 
 
 		 717 aa  669    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.451927  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3421  4-alpha-glucanotransferase  48.79 
 
 		 708 aa  626  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3175  4-alpha-glucanotransferase  48.31 
 
 		 730 aa  621  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.682952  normal  0.0349305 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4887  4-alpha-glucanotransferase  47.88 
 
 		 724 aa  614  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2869  4-alpha-glucanotransferase  50.21 
 
 		 719 aa  596  1e-169  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2913  4-alpha-glucanotransferase  50.21 
 
 		 719 aa  596  1e-169  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2899  4-alpha-glucanotransferase  50.21 
 
 		 719 aa  596  1e-169  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11812  4-alpha-glucanotransferase malQ  47.9 
 
 		 724 aa  592  1e-168  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.268573 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0478  4-alpha-glucanotransferase  47.38 
 
 		 730 aa  591  1e-167  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1369  4-alpha-glucanotransferase  48.7 
 
 		 708 aa  586  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.613124  hitchhiker  0.00100057 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2153  4-alpha-glucanotransferase  47.86 
 
 		 717 aa  585  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.362113  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24590  4-alpha-glucanotransferase  45.98 
 
 		 718 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.686427  normal  0.585333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2633  4-alpha-glucanotransferase  47.07 
 
 		 733 aa  569  1e-161  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.272173 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3529  4-alpha-glucanotransferase  47.98 
 
 		 712 aa  560  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00842103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1101  4-alpha-glucanotransferase  44.16 
 
 		 717 aa  542  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.00817417  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13220  4-alpha-glucanotransferase  45.58 
 
 		 717 aa  521  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.133916  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3533  4-alpha-glucanotransferase  46.41 
 
 		 721 aa  519  1e-146  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5309  4-alpha-glucanotransferase  45.25 
 
 		 780 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.242878 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1601  4-alpha-glucanotransferase  39.77 
 
 		 766 aa  474  1e-132  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.154546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1692  4-alpha-glucanotransferase  39.23 
 
 		 721 aa  458  1e-127  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0251  4-alpha-glucanotransferase  37.11 
 
 		 721 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11750  4-alpha-glucanotransferase  42.86 
 
 		 1169 aa  448  1.0000000000000001e-124  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1157  4-alpha-glucanotransferase  43.33 
 
 		 757 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.337105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5116  4-alpha-glucanotransferase  44.73 
 
 		 692 aa  449  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.796514  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1321  4-alpha-glucanotransferase  38.85 
 
 		 745 aa  443  1e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1299  4-alpha-glucanotransferase  37.71 
 
 		 749 aa  443  1e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0996  4-alpha-glucanotransferase  43.23 
 
 		 660 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3093  4-alpha-glucanotransferase  38.7 
 
 		 610 aa  343  5.999999999999999e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601313  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  32.74 
 
 		 1464 aa  326  7e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3927  4-alpha-glucanotransferase  32.44 
 
 		 694 aa  312  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0315  4-alpha-glucanotransferase  32.74 
 
 		 707 aa  309  1.0000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3992  4-alpha-glucanotransferase  31 
 
 		 698 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0162  4-alpha-glucanotransferase  31 
 
 		 698 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4120  4-alpha-glucanotransferase  32.64 
 
 		 694 aa  307  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3751  4-alpha-glucanotransferase  30.86 
 
 		 698 aa  306  8.000000000000001e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1402  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.27 
 
 		 1730 aa  304  4.0000000000000003e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.701685  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0233  4-alpha-glucanotransferase  32.08 
 
 		 717 aa  303  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1174  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.82 
 
 		 1715 aa  299  1e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.814781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7548  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.97 
 
 		 1642 aa  297  4e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.838098  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2674  4-alpha-glucanotransferase  34.24 
 
 		 607 aa  297  4e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6809  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.56 
 
 		 1647 aa  296  6e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.687353 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2156  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.49 
 
 		 1703 aa  296  7e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.57322  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2365  4-alpha-glucanotransferase  28.71 
 
 		 732 aa  296  7e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.84762  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1607  4-alpha-glucanotransferase  36.71 
 
 		 728 aa  295  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3829  4-alpha-glucanotransferase  30.99 
 
 		 695 aa  296  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1984  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.42 
 
 		 1673 aa  294  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.432862  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4635  4-alpha-glucanotransferase  30.94 
 
 		 696 aa  291  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01251  4-alpha-glucanotransferase  30.07 
 
 		 732 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0890  4-alpha-glucanotransferase  29.5 
 
 		 699 aa  291  3e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.763251  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001104  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  30.69 
 
 		 726 aa  291  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2985  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  34.1 
 
 		 1662 aa  291  4e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.149144  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1467  4-alpha-glucanotransferase  33.68 
 
 		 646 aa  288  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04850  4-alpha-glucanotransferase  30.47 
 
 		 726 aa  287  4e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1780  4-alpha-glucanotransferase  36.1 
 
 		 605 aa  287  5e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.900692  normal  0.822688 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2938  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.47 
 
 		 1646 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00368766 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2711  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  33.33 
 
 		 1646 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0130297 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2547  4-alpha-glucanotransferase  33.43 
 
 		 692 aa  283  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1822  4-alpha-glucanotransferase  32.99 
 
 		 689 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.231101 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1114  4-alpha-glucanotransferase  34.54 
 
 		 605 aa  282  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.587609 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2451  putative 4-alpha-glucanotransferase  35.71 
 
 		 605 aa  281  3e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3651  4-alpha-glucanotransferase  33.38 
 
 		 689 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215305 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24890  4-alpha-glucanotransferase  34.6 
 
 		 691 aa  280  8e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0829974  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2833  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/malto-oligosyltrehalose synthase  32.19 
 
 		 1650 aa  280  9e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.280468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2994  glycoside hydrolase family protein  33.14 
 
 		 692 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.10076  normal  0.840689 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0297  4-alpha-glucanotransferase  30.33 
 
 		 694 aa  278  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000128437  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3892  4-alpha-glucanotransferase  30.33 
 
 		 694 aa  278  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3797  4-alpha-glucanotransferase  30.48 
 
 		 694 aa  278  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0118  4-alpha-glucanotransferase  29.31 
 
 		 726 aa  278  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03268  4-alpha-glucanotransferase (amylomaltase)  30.48 
 
 		 694 aa  278  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000118056  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3697  4-alpha-glucanotransferase  30.3 
 
 		 694 aa  278  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.451758 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3614  4-alpha-glucanotransferase  30.33 
 
 		 694 aa  278  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0297  4-alpha-glucanotransferase  30.33 
 
 		 694 aa  278  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000311021  normal  0.0613825 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03220  hypothetical protein  30.48 
 
 		 694 aa  278  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000107714  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4052  4-alpha-glucanotransferase  33.33 
 
 		 689 aa  277  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1791  4-alpha-glucanotransferase  33.19 
 
 		 689 aa  277  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.816513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4388  4-alpha-glucanotransferase  33.17 
 
 		 726 aa  276  7e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2866  glycoside hydrolase family protein  32.09 
 
 		 736 aa  276  8e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.988435 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3712  4-alpha-glucanotransferase  29.88 
 
 		 692 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3715  4-alpha-glucanotransferase  29.88 
 
 		 692 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6826  4-alpha-glucanotransferase  32.27 
 
 		 736 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.512583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3787  4-alpha-glucanotransferase  30.28 
 
 		 692 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4723  4-alpha-glucanotransferase  30.48 
 
 		 694 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1210  glycoside hydrolase family protein  33.27 
 
 		 663 aa  275  3e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3821  4-alpha-glucanotransferase  29.88 
 
 		 692 aa  275  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2166  4-alpha-glucanotransferase  32.93 
 
 		 761 aa  273  7e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0039  4-alpha-glucanotransferase  28.51 
 
 		 726 aa  273  8.000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1635  4-alpha-glucanotransferase  27.43 
 
 		 731 aa  271  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3883  4-alpha-glucanotransferase  29.74 
 
 		 692 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3677  4-alpha-glucanotransferase  32.1 
 
 		 656 aa  270  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3127  4-alpha-glucanotransferase  31.8 
 
 		 692 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284548  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2938  4-alpha-glucanotransferase  33.13 
 
 		 664 aa  268  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7029  4-alpha-glucanotransferase  31.19 
 
 		 735 aa  267  5e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.073687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0986  4-alpha-glucanotransferase  29.1 
 
 		 724 aa  266  1e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154961 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1356  4-alpha-glucanotransferase  32.91 
 
 		 808 aa  264  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.547791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2279  4-alpha-glucanotransferase  32.6 
 
 		 684 aa  263  6e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0480824  normal  0.0112086 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4231  glycoside hydrolase family protein  32.81 
 
 		 733 aa  263  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6321  putative 4-alpha-glucanotransferase  31.36 
 
 		 650 aa  262  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1330  4-alpha-glucanotransferase  32.73 
 
 		 808 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>