More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2000 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  71.64 
 
 		 201 aa  280  1e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  65.66 
 
 		 201 aa  260  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  63.13 
 
 		 201 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  63.13 
 
 		 201 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  63.13 
 
 		 201 aa  253  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  62.19 
 
 		 201 aa  250  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4890  methyltransferase type 12  63.5 
 
 		 201 aa  248  5e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  61.62 
 
 		 199 aa  233  1.0000000000000001e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  60.59 
 
 		 201 aa  229  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  60 
 
 		 423 aa  228  5e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5057  Methyltransferase type 12  63.64 
 
 		 201 aa  227  7e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3347  methyltransferase type 12  61.08 
 
 		 201 aa  225  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.84561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2672  LigA  55.72 
 
 		 200 aa  200  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3123  MCP methyltransferase, CheR-type  56.48 
 
 		 198 aa  188  5e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  53.72 
 
 		 200 aa  186  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  51.53 
 
 		 205 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  50 
 
 		 203 aa  177  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4368  Methyltransferase type 12  48.11 
 
 		 192 aa  149  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  43.37 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  40.54 
 
 		 195 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.69 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  32.2 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 252 aa  61.6  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  33.87 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1814  methyltransferase type 12  24.38 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.69 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.69 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  30.34 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  25.17 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200806 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  27.54 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  34.83 
 
 		 264 aa  58.2  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3724  methyltransferase type 11  37.17 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752355 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  40.51 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.84 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  39.29 
 
 		 233 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  25.66 
 
 		 541 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.33 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2738  glycosyl transferase, group 1  33.01 
 
 		 540 aa  55.8  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  31.91 
 
 		 263 aa  55.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.71 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  26.89 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.98 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.57 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  35.92 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3977  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.65 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296594  normal  0.175655 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  24.19 
 
 		 266 aa  54.3  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  33.9 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  26.47 
 
 		 541 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 251 aa  53.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  24.6 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  32 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  23.93 
 
 		 250 aa  53.9  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  32.05 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  35.71 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  39.53 
 
 		 243 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.21 
 
 		 260 aa  52.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  26.47 
 
 		 541 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  31.17 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.55 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.78 
 
 		 246 aa  52.8  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  26.47 
 
 		 541 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.46 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  26.47 
 
 		 541 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  32.87 
 
 		 270 aa  52.4  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  38.39 
 
 		 232 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.34 
 
 		 229 aa  52.4  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 251 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 354 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  40.7 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  26.85 
 
 		 390 aa  51.6  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 259 aa  52  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  28.85 
 
 		 258 aa  51.6  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2889  methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 273 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000212071 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  34.12 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  27.62 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 305 aa  51.6  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  27.43 
 
 		 280 aa  51.6  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  27.43 
 
 		 280 aa  51.6  0.000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  28.71 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  31.3 
 
 		 242 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2108  hypothetical protein  42.06 
 
 		 247 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  36.25 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5243  hypothetical protein  27.06 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204365  normal  0.202223 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.15 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>