More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1784 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1784  putative oxidoreductase  100 
 
 		 256 aa  508  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1378  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.64 
 
 		 251 aa  290  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179495  normal  0.922727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.82 
 
 		 248 aa  228  7e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5011  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.45 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.24255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.24 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.806821  normal  0.214566 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 		 259 aa  162  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 		 251 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000195486  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2508  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.6 
 
 		 250 aa  158  7e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168106  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 		 250 aa  158  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 244 aa  157  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0346  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.45 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0244456  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  36.18 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  36.18 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1080  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.37 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38691  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 		 254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 		 254 aa  155  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1954  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  39.76 
 
 		 250 aa  155  6e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2627  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.47 
 
 		 268 aa  155  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.335809  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.46 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2595  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3288  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.197949 
 
 
-
 
NC_004310  BR1122  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  37.96 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1385  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.31 
 
 		 248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.41 
 
 		 244 aa  152  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.96 
 
 		 276 aa  151  8e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185872  hitchhiker  0.0000125896 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2921  dehydrogenase  40.57 
 
 		 261 aa  151  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.932836 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.37 
 
 		 249 aa  150  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 		 250 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3583  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 279 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5527  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  35.94 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.711158  normal  0.0192619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0696  glucose 1-dehydrogenase  40.24 
 
 		 252 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.162923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1022  short chain dehydrogenase  38.98 
 
 		 261 aa  149  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.917277  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.06 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3452  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.22 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.759326 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.12 
 
 		 252 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2798  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 		 256 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1563  oxidoreductase  42.63 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.256146 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3132  glucose-1-dehydrogenase  37.4 
 
 		 261 aa  149  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 		 256 aa  148  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.99 
 
 		 248 aa  148  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0714452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4505  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.75 
 
 		 260 aa  148  9e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3759  oxidoreductase  42.23 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.108381  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.33 
 
 		 282 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.316546  normal  0.241504 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1629  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.43 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000722378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0891  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.375615 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3742  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.85 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.071685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2974  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 		 259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1429  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.51 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1904  oxidoreductase  41.43 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3817  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.191751  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.11 
 
 		 246 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000018635 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.03 
 
 		 262 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1536  oxidoreductase  42.23 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2002  oxidoreductase  41.83 
 
 		 257 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6893  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.41 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00227102  normal  0.0503904 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1012  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.57 
 
 		 251 aa  146  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0198691  normal  0.370278 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3472  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.13 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34130  oxidoreductase  41.39 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0512  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 		 248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3510  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4852  glucose-1-dehydrogenase  37.4 
 
 		 261 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  35.69 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.17 
 
 		 268 aa  145  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0201969  normal  0.963829 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0818  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.25 
 
 		 252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.100065 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4448  glucose-1-dehydrogenase  36.59 
 
 		 261 aa  144  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0904  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.59 
 
 		 254 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1670  oxidoreductase  41.6 
 
 		 272 aa  144  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0171077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 		 272 aa  145  9e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3253  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.25 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.152872  normal  0.595682 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.96 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4062  short chain dehydrogenase  36.96 
 
 		 257 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.171649  normal  0.787909 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3047  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 262 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.63 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.22 
 
 		 249 aa  144  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4858  glucose-1-dehydrogenase  36.99 
 
 		 261 aa  143  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.94 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700945 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0939  short chain dehydrogenase  35.89 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1690  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000504993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2281  short chain dehydrogenase  36.47 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3000  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.767749  normal  0.280666 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.48 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 250 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.1 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148918 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0373  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.72 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.575902  normal  0.466968 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  36.19 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4466  glucose-1-dehydrogenase  36.18 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0545  short chain dehydrogenase  38.55 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.379815  normal  0.424655 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 		 256 aa  142  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4834  glucose-1-dehydrogenase  36.18 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.4 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1981  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.27 
 
 		 246 aa  142  5e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>