177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1680 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1680  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  529  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1950  NUDIX hydrolase  46.77 
 
 		 255 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666959  hitchhiker  0.00341622 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4220  NUDIX hydrolase  42.02 
 
 		 304 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288399  normal  0.0172337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3831  NUDIX hydrolase  46.03 
 
 		 361 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4221  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 315 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292609  normal  0.0178702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3830  NUDIX hydrolase  46.04 
 
 		 301 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1097  NUDIX hydrolase  46.09 
 
 		 305 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.183195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4845  NUDIX hydrolase  39.04 
 
 		 298 aa  99  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0715  NUDIX hydrolase  38.46 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7095  NUDIX hydrolase  36.55 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.337747  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0754  NUDIX hydrolase  34.46 
 
 		 282 aa  65.5  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00528415  hitchhiker  0.00425905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5579  NUDIX hydrolase  37.04 
 
 		 173 aa  58.9  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.542924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3733  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  33.05 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0829824  normal  0.0242018 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4567  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.790014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 153 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1924  NUDIX hydrolase  33.57 
 
 		 340 aa  53.9  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0514  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 		 142 aa  53.9  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000824501  hitchhiker  0.00000161401 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4342  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 156 aa  52.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.87034 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2546  NUDIX family hydrolase  30.65 
 
 		 141 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16380  ADP-ribose pyrophosphatase  31.54 
 
 		 158 aa  51.6  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.221799  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3244  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 158 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  32.81 
 
 		 139 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0258  MutT/Nudix family protein  31.71 
 
 		 137 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2856  NUDIX hydrolase  31.69 
 
 		 155 aa  50.1  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.383622  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  38.03 
 
 		 141 aa  50.4  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 		 142 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2396  NUDIX family hydrolase  30.65 
 
 		 141 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.64074  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1218  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.843116 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3392  hydrolase, NUDIX family  31.19 
 
 		 120 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02177  predicted NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 141 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.256653  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1407  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 141 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02136  hypothetical protein  29.84 
 
 		 141 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.284783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1398  NUDIX hydrolase  29.84 
 
 		 141 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.708086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2405  NUDIX family hydrolase  31.19 
 
 		 120 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2095  NUDIX hydrolase  34.25 
 
 		 327 aa  49.3  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0792688  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51490  hypothetical protein  33.33 
 
 		 212 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000141034  hitchhiker  0.000162281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2270  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 174 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.792713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 		 147 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  35.82 
 
 		 141 aa  47.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  29.69 
 
 		 142 aa  47.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0589  mutT/nudix family protein  31.48 
 
 		 140 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  39.71 
 
 		 144 aa  47.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0533  MutT/NUDIX family protein  31.48 
 
 		 140 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.133702  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0516  NUDIX hydrolase  34.62 
 
 		 171 aa  47.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0622  mutT/nudix family protein  31.48 
 
 		 140 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 136 aa  47.4  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3686  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 151 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03438  MutT-nudix family protein  30.61 
 
 		 149 aa  48.1  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  33.61 
 
 		 163 aa  47  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1130  NUDIX family pyrophosphatase  44.9 
 
 		 149 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.649949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1569  hypothetical protein  31.25 
 
 		 165 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0218097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1383  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 193 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.744983 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  30.47 
 
 		 137 aa  47  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2480  NUDIX family hydrolase  30.16 
 
 		 141 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2639  NUDIX family hydrolase  30.16 
 
 		 141 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2535  NUDIX family hydrolase  28.06 
 
 		 141 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06560  ADP-ribose pyrophosphatase  44.07 
 
 		 141 aa  46.6  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.715262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1930  NUDIX hydrolase  33.62 
 
 		 151 aa  46.2  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.104334  normal  0.229344 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  34.44 
 
 		 149 aa  46.6  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2523  hydrolase, nudix family  29.37 
 
 		 141 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.464819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1689  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 140 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0533  MutT/NUDIX family protein  30.28 
 
 		 140 aa  46.2  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0645  NUDIX hydrolase  30.48 
 
 		 153 aa  46.2  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0664584 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2431  hydrolase, nudix family  29.37 
 
 		 141 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13920  ADP-ribose pyrophosphatase  34.15 
 
 		 220 aa  46.2  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.625001  normal  0.785558 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  30.56 
 
 		 140 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1136  NUDIX hydrolase  30.14 
 
 		 335 aa  45.8  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3444  mutator MutT protein  35.29 
 
 		 129 aa  45.8  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.013842 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1537  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 148 aa  45.8  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.537681  normal  0.0457282 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1505  MutT/nudix family protein  28.1 
 
 		 158 aa  45.4  0.0009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000663569  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1573  hypothetical protein  31.58 
 
 		 160 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  41.38 
 
 		 163 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0498  putative mutator protein(7,8-dihydro-8- oxoguanine-triphosphatase), MutT  35.38 
 
 		 142 aa  45.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.718712 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0090  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 147 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0673  NUDIX hydrolase  33.09 
 
 		 158 aa  45.4  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.612507  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0572  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 147 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.546019  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3458  mutator MutT protein  35.38 
 
 		 141 aa  45.4  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.432135  hitchhiker  0.00028908 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0536  NUDIX hydrolase  31.52 
 
 		 140 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0542  NUDIX hydrolase  42.86 
 
 		 147 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.184867  normal  0.118986 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2831  7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase  40.82 
 
 		 153 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0396301  normal  0.239165 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2537  NUDIX family pyrophosphatase  37.68 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3076  NUDIX hydrolase  38.78 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4650  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 		 163 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2661  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 147 aa  44.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2114  NUDIX hydrolase  34.48 
 
 		 147 aa  44.3  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.902381  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3259  NUDIX hydrolase  45.61 
 
 		 168 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.303659  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  29.63 
 
 		 161 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0414  mutator MutT protein  38.78 
 
 		 132 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0779  NUDIX hydrolase  28.46 
 
 		 156 aa  44.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0032986  normal  0.0903569 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04356  hypothetical protein  42.37 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0459  putative mutator mutT protein  37.68 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1317  putative mutator mutT protein  37.68 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3537  mutator mutT protein  37.68 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0659  mutT/nudix family protein  28.46 
 
 		 140 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.73799  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  27.5 
 
 		 157 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2217  NUDIX hydrolase  33.61 
 
 		 158 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.524488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4678  mutT/nudix family protein  29.03 
 
 		 140 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.1477999999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  30.4 
 
 		 156 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  34.67 
 
 		 161 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.327149 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>