More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1544 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1544  putative enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  100 
 
 
223 aa  455  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.776241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5263  hypothetical protein  77.13 
 
 
223 aa  348  3e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.458705  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2452  enoyl-CoA hydratase/isomerase  74.44 
 
 
223 aa  337  9.999999999999999e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28240  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  57.8 
 
 
220 aa  256  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2946  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  58.6 
 
 
220 aa  250  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000350804  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.88 
 
 
225 aa  239  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.56971  normal  0.569972 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3474  enoyl-CoA hydratase/isomerase  53.46 
 
 
225 aa  236  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.800872  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0984  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.22 
 
 
236 aa  192  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1789  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.41 
 
 
235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0665  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.53 
 
 
236 aa  145  6e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00829683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4460  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.38 
 
 
268 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3124  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.91 
 
 
238 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000198349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01710  putative enoyl-CoA hydratase  34.3 
 
 
238 aa  111  8.000000000000001e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.104358  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06767  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G14850)  27.6 
 
 
244 aa  95.5  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.761527  normal  0.30064 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06210  conserved hypothetical protein  30.14 
 
 
266 aa  95.1  8e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2555  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.85 
 
 
248 aa  89.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02638  Enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  27.49 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1247  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.82 
 
 
257 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.584439  normal  0.150573 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2282  enoyl-CoA hydratase  31.84 
 
 
237 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.669843  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2694  enoyl-CoA hydratase  28.38 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.142773  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0038  carnitinyl-CoA dehydratase  30.43 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3172  enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.52 
 
 
259 aa  70.5  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1454  enoyl-CoA hydratase  30.5 
 
 
229 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3563  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  30.12 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2065  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  30.99 
 
 
229 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898876  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3619  carnitinyl-CoA dehydratase  30.12 
 
 
261 aa  69.7  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.291673 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4679  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  27.27 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0754  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  30.32 
 
 
695 aa  69.7  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00040  carnitinyl-CoA dehydratase  30.12 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04074  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.124061  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0037  carnitinyl-CoA dehydratase  29.52 
 
 
261 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3804  enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.27 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.482495 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04036  hypothetical protein  27.27 
 
 
260 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.13651  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00039  hypothetical protein  30.12 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0040  carnitinyl-CoA dehydratase  30.12 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14440  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.89 
 
 
715 aa  68.6  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.308219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1875  enoyl-CoA hydratase  28.57 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0040  carnitinyl-CoA dehydratase  29.81 
 
 
261 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4452  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  26.77 
 
 
258 aa  68.2  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000202133  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4743  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  26.77 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0219065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4769  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein  27.27 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00226871  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0873  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.92 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5125  enoyl-CoA hydratase  33.66 
 
 
233 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2066  enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.32 
 
 
273 aa  67.4  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1217  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.96 
 
 
254 aa  67  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00721666  normal  0.45586 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2669  enoyl-CoA hydratase  28.83 
 
 
275 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1744  enoyl-CoA hydratase  29.9 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.216387  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0459  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  28.28 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.432018  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1216  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  28.28 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.307804  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0183  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  28.28 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.260328  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2611  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  28.28 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.285185  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0118  enoyl-CoA hydratase  28.17 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1116  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  28.28 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0703433  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1382  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  28.28 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.465754  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0077  carnitinyl-CoA dehydratase  28.25 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1468  polyketide biosynthesis enoyl-CoA hydratase  28.28 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0875156  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  27.91 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0078  carnitinyl-CoA dehydratase  27.68 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0074  carnitinyl-CoA dehydratase  27.68 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0074  carnitinyl-CoA dehydratase  27.68 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0126  enoyl-CoA hydratase  28.17 
 
 
264 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0076  carnitinyl-CoA dehydratase  27.68 
 
 
261 aa  65.1  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2705  enoyl-CoA hydratase  28.44 
 
 
275 aa  65.1  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.492104  normal  0.320789 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.64 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.64 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08370  short chain enoyl-CoA hydratase  28.5 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0645146  normal  0.165598 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.64 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1226  enoyl-CoA hydratase  31.6 
 
 
233 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.146612  normal  0.418232 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1934  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.31 
 
 
719 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.615527 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2227  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  28.31 
 
 
719 aa  63.5  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.157298 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4034  carnitinyl-CoA dehydratase  29.76 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5972  enoyl-CoA hydratase/isomerase  29.25 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1845  enoyl-CoA hydratase  28.28 
 
 
229 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429815  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0399  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase, NAD-binding  26.46 
 
 
651 aa  63.2  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.165955  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1021  enoyl-CoA hydratase/isomerase  25.91 
 
 
274 aa  63.2  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19110  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  28.44 
 
 
280 aa  63.2  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.184392  normal  0.138145 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18064  predicted protein  27.45 
 
 
298 aa  62.4  0.000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3225  carnitinyl-CoA dehydratase  30.36 
 
 
261 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2156  enoyl-CoA hydratase  30 
 
 
261 aa  62.4  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.666292  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2672  carnitinyl-CoA dehydratase  29.76 
 
 
261 aa  62.4  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.539378  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0032  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  26.44 
 
 
716 aa  62.4  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.58594  normal  0.0455208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2045  enoyl-CoA hydratase  26.63 
 
 
230 aa  62  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.159168  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1423  enoyl-CoA hydratase  28.22 
 
 
229 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.293032  normal  0.655993 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3831  enoyl-CoA hydratase  27.75 
 
 
258 aa  62  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3865  enoyl-CoA hydratase  28.28 
 
 
229 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.0342792 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1426  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.67 
 
 
260 aa  61.6  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.263225  normal  0.215751 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3901  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  27.17 
 
 
729 aa  61.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.143113  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0283  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  26.26 
 
 
729 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00882549  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3423  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  30.3 
 
 
260 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3104  enoyl-CoA hydratase  27.88 
 
 
275 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.19279  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3454  enoyl-CoA hydratase/isomerase  26.17 
 
 
257 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.73615  normal  0.177072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0044  short chain enoyl-CoA hydratase  30.77 
 
 
253 aa  61.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.535261  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2829  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  22.63 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0473  enoyl-CoA hydratase  25.76 
 
 
260 aa  60.1  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1739  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  28.98 
 
 
242 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1912  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  26.26 
 
 
729 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.539426  normal  0.0186555 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3933  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  26.26 
 
 
729 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2108  enoyl-CoA hydratase  28.24 
 
 
229 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430525  normal  0.0139564 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2100  multifunctional fatty acid oxidation complex subunit alpha  24.29 
 
 
719 aa  59.7  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.937609  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5085  enoyl-CoA hydratase/isomerase  22.44 
 
 
249 aa  59.3  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>