130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1089 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1089  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  496  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2954  peptidase A24A prepilin type IV  43.33 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000298652  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1177  peptidase A24A, prepilin type IV  41.98 
 
 		 186 aa  96.7  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00632906  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1248  peptidase A24A prepilin type IV  42.95 
 
 		 186 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000204427 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0875  Type II secretory pathway prepilin signal peptidase PulO and related peptidase  40.32 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.141711 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2018  peptidase A24A prepilin type IV  43.31 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0505831 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3020  peptidase A24A domain protein  47.79 
 
 		 263 aa  89.4  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.695125 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1829  peptidase A24A domain protein  35.55 
 
 		 275 aa  87.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0170394  normal  0.348315 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1340  peptidase A24A domain protein  32.02 
 
 		 274 aa  86.7  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6538  prepilin peptidase  44.52 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.276623  hitchhiker  0.00290802 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17810  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  42.06 
 
 		 261 aa  68.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.614391 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2919  peptidase A24A, prepilin type IV  35.83 
 
 		 229 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0504  prepilin peptidase  31.25 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.613081  normal  0.615675 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2411  peptidase A24A, prepilin type IV  38.3 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8142  peptidase A24A prepilin type IV  36.48 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2632  peptidase A24A prepilin type IV  34.46 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.783995 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1698  peptidase A24A prepilin type IV  36.55 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194935  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1314  peptidase A24A domain-containing protein  39.78 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.410004  normal  0.0147639 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1173  Prepilin peptidase  27.9 
 
 		 283 aa  60.1  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0803  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  29.69 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.414773  normal  0.890784 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2131  prepilin peptidase  30.97 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2663  peptidase A24A domain protein  52.38 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0766  Prepilin peptidase  29.69 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0785  type IV pilus prepilin peptidase PilD  30.21 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.460819  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0479  prepilin peptidase  31.67 
 
 		 303 aa  57  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.508512  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2683  prepilin peptidase  28.57 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000151009  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1855  peptidase A24A domain-containing protein  28.18 
 
 		 259 aa  56.6  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.120379  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2820  prepilin peptidase  30.08 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0392488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3768  peptidase A24A domain protein  29.46 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.878052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2225  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.75 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000075446  normal  0.643146 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0673  prepilin peptidase  30.53 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0406181 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0678  prepilin peptidase  32.99 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2657  prepilin peptidase  32.28 
 
 		 309 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.956099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5490  prepilin peptidase  29.05 
 
 		 294 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16559  normal  0.184138 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07790  prepilin signal peptidase PulO-like peptidase  35.56 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.409927  normal  0.37383 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0632  prepilin peptidase  29.65 
 
 		 288 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3661  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.69 
 
 		 303 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0094  prepilin peptidase  31.69 
 
 		 303 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0576  prepilin peptidase  31.69 
 
 		 303 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251238  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0507  signal peptidase  31.3 
 
 		 283 aa  53.1  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0697104 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0546  prepilin peptidase  31.69 
 
 		 303 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0204548  normal  0.0306295 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3921  prepilin peptidase  27.91 
 
 		 294 aa  52.8  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  0.369065 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0417  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.69 
 
 		 309 aa  52.4  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.167807  hitchhiker  0.00108139 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2176  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  31.51 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.464128  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4495  hypothetical protein  42.86 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0171924  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_002936  DET1362  type IV prepilin leader peptidase family protein  25.68 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000297795  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0418  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  26.27 
 
 		 308 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03233  Type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  25.84 
 
 		 297 aa  51.2  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0166212  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0414  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  26.38 
 
 		 308 aa  50.4  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3110  type 4 prepilin peptidase 1  28.81 
 
 		 289 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2684  Prepilin peptidase  24.62 
 
 		 274 aa  50.4  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000590011 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0365  peptidase A24A domain protein  31.23 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.449957  normal  0.439628 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0186  type IV pilus prepilin peptidase PilD  31.23 
 
 		 266 aa  50.4  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0986593  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2107  prepilin peptidase  28.81 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2029  peptidase A24A domain-containing protein  28.81 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.250506  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1719  hypothetical protein  34.53 
 
 		 221 aa  50.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.135508  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2139  prepilin peptidase  42.31 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4538  prepilin peptidase  29.86 
 
 		 288 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0502  Type 4 prepilin-like peptidase, leader peptide processing enzyme  33.13 
 
 		 318 aa  49.3  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.209111 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3682  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  27.62 
 
 		 295 aa  49.7  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.948084 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002543  leader peptidase (Prepilin peptidase)/N-methyltransferase  26.21 
 
 		 289 aa  49.7  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000528098  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0483  peptidase A24A domain protein  26.56 
 
 		 264 aa  49.3  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0896921  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5009  peptidase A24A prepilin type IV  37.12 
 
 		 280 aa  48.9  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.594309  hitchhiker  0.0000307412 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2368  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  34.84 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.66665  normal  0.125964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3607  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  25.42 
 
 		 308 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.551443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3921  prepilin peptidase  24.79 
 
 		 304 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.985112  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03471  Type II secretory pathway, prepilin signal peptidase PulO  24.58 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0303  prepilin peptidase  26.11 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1532  peptidase A24A domain protein  25 
 
 		 274 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4462  peptidase A24A, prepilin type IV  40.16 
 
 		 249 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18795 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2043  type 4 prepilin-like proteins leader peptide processing enzyme  26.34 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1581  Prepilin peptidase  29.63 
 
 		 294 aa  47  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3391  prepilin peptidase  24.11 
 
 		 305 aa  47  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1199  late competence protein (includes: leader peptidase; N-methyltransferase)  35.9 
 
 		 240 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3210  peptidase A24A, prepilin type IV  37.18 
 
 		 218 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0842795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2683  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  25.74 
 
 		 273 aa  46.6  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.670799  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4062  prepilin peptidase  25.21 
 
 		 304 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.81553  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3524  peptidase A24A domain protein  24.03 
 
 		 253 aa  46.6  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0046971  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4158  peptidase A24A prepilin type IV  35.29 
 
 		 225 aa  47  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.904391 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0501  peptidase A24A prepilin type IV  40.58 
 
 		 202 aa  46.2  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174791  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0411  prepilin peptidase  26.11 
 
 		 303 aa  46.2  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0959  type 4 prepilin peptidase 1. Aspartic peptidase. MEROPS family A24A  32.98 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.770973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2904  prepilin peptidase  25 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1800  peptidase A24A domain-containing protein  25.1 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.910955  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3806  A24 family peptidase  37.08 
 
 		 155 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000259026  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3618  A24 family peptidase  37.08 
 
 		 155 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000960523  hitchhiker  0.00521455 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1459  late competence protein comC  30.61 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3869  Prepilin peptidase  24.79 
 
 		 308 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1419  late competence protein comC  29.59 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1715  peptidase A24A domain protein  40.79 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2211  peptidase A24A prepilin type IV  32.14 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.144961  normal  0.829698 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1134  type IV pilus prepilin peptidase PilD  35.15 
 
 		 351 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2186  Prepilin peptidase  28.27 
 
 		 296 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.295989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3944  prepilin peptidase  24.89 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1953  type 4 prepilin peptidase  24.22 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1221  peptidase A24A domain-containing protein  32.1 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.544367  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1026  peptidase A24A domain protein  26.82 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.725257  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1143  type IV prepilin leader peptidase  30.72 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00336201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3529  peptidase A24 N- domain-containing protein  35.15 
 
 		 351 aa  43.9  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3428  peptidase A24A prepilin type IV  37.38 
 
 		 223 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.110364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>