59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0535 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0535  hypothetical protein  100 
 
 		 185 aa  362  2e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.523865  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3801  NUDIX hydrolase  70.43 
 
 		 196 aa  251  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.225828  normal  0.040121 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3734  NUDIX hydrolase  64.67 
 
 		 171 aa  205  3e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.056814  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2957  NUDIX hydrolase  60.48 
 
 		 188 aa  189  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0330064  normal  0.14207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8348  hypothetical protein  57.14 
 
 		 181 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.359922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06220  NUDIX family protein  55.68 
 
 		 181 aa  170  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0883  NUDIX hydrolase  57.14 
 
 		 199 aa  168  5e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.402979  normal  0.0136644 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6335  NUDIX hydrolase  55.06 
 
 		 181 aa  167  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0941  NUDIX hydrolase  51.11 
 
 		 199 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0785282  normal  0.918248 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1524  NUDIX hydrolase  52.72 
 
 		 188 aa  157  6e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.533164  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4732  NUDIX hydrolase  51.14 
 
 		 179 aa  153  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4177  NUDIX hydrolase  51.79 
 
 		 170 aa  149  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.086433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3304  NUDIX hydrolase  50.6 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.360239  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1731  NUDIX hydrolase  48.8 
 
 		 190 aa  137  7e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.993062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1322  NUDIX hydrolase  46.93 
 
 		 184 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.245288  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1339  NUDIX hydrolase  46.93 
 
 		 184 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1358  NUDIX hydrolase  46.93 
 
 		 184 aa  122  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.097904  normal  0.32724 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1181  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 185 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2393  NUDIX hydrolase  49.61 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53348 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00851  hydrolase, nudix family protein  49.62 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000243046  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06076  hydrolase, nudix family protein  49.62 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000965129  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1786  NUDIX hydrolase  45.83 
 
 		 204 aa  97.8  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.346997 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0711  NUDIX hydrolase  46.1 
 
 		 197 aa  95.1  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.267482 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13930  NTP pyrophosphohydrolase  48.37 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.57247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11440  NTP pyrophosphohydrolase  45.86 
 
 		 215 aa  89  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178204  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5005  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0781982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1646  NUDIX hydrolase  32.89 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.637473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3483  NUDIX hydrolase  31.2 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1014  NUDIX hydrolase  43.17 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.226826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1047  NUDIX hydrolase  34.15 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0665722  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0336  NUDIX family hydrolase  23.23 
 
 		 548 aa  65.5  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0632  NUDIX hydrolase  36.03 
 
 		 205 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.224471 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2190  hypothetical protein  25.71 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1658  NUDIX hydrolase  29.94 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4093  NUDIX hydrolase  34.72 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11570  NUDIX family protein  46.38 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4916  NUDIX hydrolase  41.13 
 
 		 283 aa  62  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.933953  hitchhiker  0.00516547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4848  NUDIX hydrolase  36.92 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00240786  normal  0.150096 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1980  NUDIX hydrolase  29.78 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3204  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0581  NUDIX hydrolase  41.54 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.664417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4860  NUDIX hydrolase  35.54 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0504  NUDIX hydrolase  35.29 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.316146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22390  ADP-ribose pyrophosphatase  31.13 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1034  NUDIX hydrolase  24.85 
 
 		 185 aa  51.2  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0662  NUDIX family hydrolase  23.72 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0202176  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0164  NUDIX hydrolase  32.09 
 
 		 145 aa  48.1  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.860889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0841  NUDIX hydrolase  36.17 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0661  NUDIX domain-containing protein  25.17 
 
 		 186 aa  47  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00385243  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2862  NUDIX hydrolase  36.11 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00008626  normal  0.0453514 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1182  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 		 147 aa  44.7  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2689  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 		 141 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5431  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 260 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.588653 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2784  NUDIX hydrolase  34.07 
 
 		 141 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.801073  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0011  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 144 aa  42.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.695589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1062  NUDIX family hydrolase  28.19 
 
 		 149 aa  42  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0194838  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3543  NUDIX hydrolase  30.3 
 
 		 160 aa  41.6  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291144  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  33.8 
 
 		 161 aa  41.6  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0677  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 145 aa  41.2  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.0113225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>