204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0249 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  100 
 
 		 236 aa  471  1e-132  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  76.17 
 
 		 233 aa  355  2.9999999999999997e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  67.81 
 
 		 234 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  67.52 
 
 		 234 aa  306  2.0000000000000002e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  67.93 
 
 		 232 aa  301  5.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  60.87 
 
 		 230 aa  257  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  60.17 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  59.83 
 
 		 238 aa  255  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  56.71 
 
 		 229 aa  251  9.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  57.76 
 
 		 230 aa  249  2e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  56.71 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  56.71 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  56.71 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  64.36 
 
 		 231 aa  248  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  55.74 
 
 		 232 aa  245  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  59.48 
 
 		 234 aa  245  4.9999999999999997e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  56.28 
 
 		 229 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  55.41 
 
 		 227 aa  243  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  58.37 
 
 		 235 aa  243  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  55.74 
 
 		 232 aa  242  3.9999999999999997e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  56.28 
 
 		 227 aa  238  6.999999999999999e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  55.46 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  54.27 
 
 		 241 aa  233  3e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  60.1 
 
 		 229 aa  230  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  55.36 
 
 		 231 aa  230  2e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  55.7 
 
 		 229 aa  229  4e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  57.08 
 
 		 231 aa  228  6e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  54.39 
 
 		 236 aa  228  9e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  54.39 
 
 		 240 aa  224  1e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  54.94 
 
 		 255 aa  221  7e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  51.3 
 
 		 228 aa  219  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  58.16 
 
 		 244 aa  211  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09110  Mn-dependent transcriptional regulator  48.1 
 
 		 239 aa  200  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.357041  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04190  Mn-dependent transcriptional regulator  52.51 
 
 		 240 aa  198  7e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  46.52 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  44.59 
 
 		 254 aa  179  4.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.39 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  35.14 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  33.48 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.7 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.03 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  34.34 
 
 		 237 aa  105  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  33.67 
 
 		 230 aa  105  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.47 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.85 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 226 aa  98.6  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  42.31 
 
 		 227 aa  98.2  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  31.28 
 
 		 227 aa  95.9  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.16 
 
 		 212 aa  94.4  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.68 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  31.14 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.5 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.74 
 
 		 225 aa  91.7  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1950  iron repressor, putative  35.95 
 
 		 218 aa  90.1  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.84 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.62 
 
 		 227 aa  89  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.24 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.58 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.5 
 
 		 218 aa  87.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  36.51 
 
 		 223 aa  87.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  31.14 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.21 
 
 		 241 aa  85.1  9e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  34.88 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  37.4 
 
 		 229 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.52 
 
 		 239 aa  83.2  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.55 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.51 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.16 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.64 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  36.55 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0293  iron-dependent repressor  31.73 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  27.03 
 
 		 215 aa  81.6  0.00000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  35.11 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.1 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.25 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  30.52 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.27 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00437401  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.71 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.26 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  35.43 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  29.46 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.96 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  31.63 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  32.56 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.59 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0775  DtxR family iron dependent repressor  34.33 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0343924  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.38 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  35.04 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  33.86 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2623  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.21 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.71 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.69 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  33.57 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  32.62 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2999  iron dependent repressor  33.58 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000263786  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  35.97 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1590  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.54 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.3687  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>