More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4346 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4346  pheophorbide a oxygenase  100 
 
 
465 aa  969    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.18517  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2931  Pheophorbide a oxygenase  60.65 
 
 
477 aa  607  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2189  Pheophorbide a oxygenase  61.37 
 
 
474 aa  598  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00477289 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0535  Rieske (2Fe-2S) region  61.86 
 
 
460 aa  586  1e-166  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2164  cell death suppressor protein Lls1-like  49.78 
 
 
461 aa  501  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.909867  normal  0.138548 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0864  cell death suppressor protein Lls1-like  51.52 
 
 
438 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1781  cell death suppressor protein Lls1-like  51.54 
 
 
456 aa  440  9.999999999999999e-123  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.527136  normal  0.0843855 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43309  predicted protein  45.7 
 
 
492 aa  366  1e-100  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.231154  hitchhiker  0.00124797 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3116  Pheophorbide a oxygenase  35.59 
 
 
442 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2958  pheophorbide a oxygenase  36.41 
 
 
442 aa  247  4e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0467803  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3793  pheophorbide a oxygenase  35.41 
 
 
443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.726  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1303  Rieske (2Fe-2S) region  34.94 
 
 
443 aa  237  4e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.418357  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1056  Rieske (2Fe-2S) region  33.33 
 
 
499 aa  220  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00144994  hitchhiker  0.000116875 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1557  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.74 
 
 
450 aa  216  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0276963  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1530  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.03 
 
 
450 aa  216  9e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0769  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.59 
 
 
497 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0795  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.29 
 
 
497 aa  209  9e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.266613  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26228  predicted protein  30.88 
 
 
668 aa  189  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.281249  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50613  Tic55 component of chloroplast import machinery  29.61 
 
 
498 aa  166  1.0000000000000001e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40637  predicted protein  29.39 
 
 
510 aa  155  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0964  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.13 
 
 
468 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.1498 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2036  hypothetical protein  32.56 
 
 
334 aa  103  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.502892  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31.22 
 
 
338 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.563703  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2825  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  27.61 
 
 
358 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000971916  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5789  Rieske (2Fe-2S) region  26.92 
 
 
349 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2918  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.73 
 
 
337 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.333438  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1185  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.75 
 
 
364 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3671  oxidoreductase alpha subunit  30.81 
 
 
407 aa  87.4  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0725789  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6610  vanillate demethylase oxygenase subunit  29.07 
 
 
380 aa  86.7  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.581564  normal  0.184804 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2137  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.17 
 
 
450 aa  85.1  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3396  vanillate monooxygenase  28.57 
 
 
348 aa  84  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00111775  normal  0.0140003 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2035  hypothetical protein  26.7 
 
 
345 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5546  putative vanillate O-demethylase oxygenase subunit (4-hydroxy- 3-methoxybenzoate demethylase)  29.89 
 
 
347 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0807  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  32.4 
 
 
331 aa  82  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4516  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.07 
 
 
373 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2050  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  29.44 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0319051  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4245  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.51 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4244  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.62 
 
 
352 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4769  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.71 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.289545  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1009  vanillate demethylase  27.03 
 
 
353 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0048453  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1016  dioxygenase, iron-sulfur subunit, putative  29.81 
 
 
369 aa  79.3  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.621392  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6309  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.89 
 
 
341 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241664  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0741  Rieske (2Fe-2S) protein  25.16 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0606248 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4257  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.24 
 
 
349 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1136  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.43 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.959251  normal  0.28876 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3626  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.1 
 
 
362 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.54925  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2492  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  31.64 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0630  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  29.53 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3024  vanillate monooxygenase  31.97 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.44 
 
 
358 aa  77  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2143  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.04 
 
 
372 aa  77  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.444634  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5901  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.11 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00683325  hitchhiker  0.00740172 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5678  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.11 
 
 
408 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000120872  normal  0.0293014 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08691  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  24.37 
 
 
440 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4992  Rieske (2Fe-2S) region  26.94 
 
 
366 aa  76.3  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4330  vanillate monooxygenase  27.37 
 
 
366 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0440139 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0396  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.76 
 
 
360 aa  76.3  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.547393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5685  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.34 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0319041  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3154  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.41 
 
 
221 aa  75.1  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.647374  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0127  Rieske (2Fe-2S) protein  30.53 
 
 
355 aa  74.3  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2133  twin-arginine translocation pathway signal  26.67 
 
 
484 aa  74.3  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.395399  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2013  Rieske (2Fe-2S) family oxidoreductase large subunit  30.61 
 
 
348 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3542  vanillate O-demethylase oxygenase subunit  27.01 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1442  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.97 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193123  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1488  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.97 
 
 
321 aa  73.9  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0113839  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0630  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.41 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.494266  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0993  Rieske (2Fe-2S) region  28.57 
 
 
350 aa  73.2  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1044  phthalate 4,5-dioxygenase  25.78 
 
 
454 aa  73.2  0.000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.714091 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4340  Rieske (2Fe-2S) region  29.88 
 
 
350 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1549  vanillate monooxygenase  28.4 
 
 
359 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.619122  normal  0.0130812 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2359  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.62 
 
 
410 aa  73.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.128163  normal  0.731078 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4297  phthalate 4,5-dioxygenase  29.31 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5781  Rieske (2Fe-2S) region  26.94 
 
 
417 aa  72  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3567  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.38 
 
 
344 aa  72.4  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1687  vanillate monooxygenase  31.55 
 
 
338 aa  72.4  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0203  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  26.06 
 
 
406 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5548  putative Phthalate 4,5-dioxygenase subunit alpha  33.54 
 
 
439 aa  72.4  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3416  vanillate monooxygenase  26.18 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0799476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2034  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.37 
 
 
400 aa  71.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.967449  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7085  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.06 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6982  phthalate 4,5-dioxygenase  29.34 
 
 
438 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2979  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.12 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08721  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  23.25 
 
 
440 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3119  vanillate monooxygenase  28.92 
 
 
358 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3413  vanillate monooxygenase  27.18 
 
 
345 aa  70.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1867  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  30.89 
 
 
388 aa  70.5  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.687816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0919  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  27.68 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40957  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3246  vanillate monooxygenase  26.7 
 
 
347 aa  70.1  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.546586  normal  0.604076 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.12 
 
 
374 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0787  Rieske (2Fe-2S) protein  24.64 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.466147 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6986  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  24.77 
 
 
374 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.529476  normal  0.476808 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2305  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.08 
 
 
352 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.560893  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09481  Rieske iron-sulfur protein 2Fe-2S subunit  25.99 
 
 
448 aa  69.3  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.056748  hitchhiker  0.0000260646 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0481  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain-containing protein  26.9 
 
 
353 aa  69.3  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0971818  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0436  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.91 
 
 
326 aa  69.7  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2297  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.08 
 
 
352 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125012  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2258  Rieske (2Fe-2S) region  29.08 
 
 
352 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.236496  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2355  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.38 
 
 
349 aa  69.7  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.725754  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1175  Phthalate 4,5-dioxygenase  28.74 
 
 
452 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.769494  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1459  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.42 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0280358  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>