More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0450 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_00688  transketolase TktA (AFU_orthologue; AFUA_1G13500)  52.16 
 
 
684 aa  663    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0372185  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02356  transketolase 2, thiamin-binding  53.83 
 
 
667 aa  683    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02765  transketolase 1, thiamin-binding  53.26 
 
 
663 aa  687    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0759  transketolase  53.26 
 
 
663 aa  687    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1205  transketolase  53.83 
 
 
667 aa  683    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0644  transketolase  53.53 
 
 
666 aa  728    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0678  transketolase  53.53 
 
 
666 aa  728    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4965  transketolase  52.11 
 
 
665 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0912  transketolase  50.3 
 
 
662 aa  661    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3040  transketolase  55.37 
 
 
670 aa  709    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0242601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3046  transketolase  55.37 
 
 
670 aa  709    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.590988  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1403  transketolase  50.15 
 
 
662 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.194488  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3411  transketolase  51.34 
 
 
664 aa  664    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.856564  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3718  transketolase  54.23 
 
 
666 aa  728    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000892016  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3872  transketolase  51.86 
 
 
662 aa  655    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0278  transketolase  53.88 
 
 
661 aa  686    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0930  transketolase  53.12 
 
 
664 aa  668    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0385  transketolase  50.75 
 
 
665 aa  645    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3181  transketolase  50.59 
 
 
674 aa  654    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3470  transketolase  54.53 
 
 
666 aa  729    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000202879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3165  transketolase  51.34 
 
 
664 aa  661    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3436  transketolase  54.53 
 
 
666 aa  730    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000116203  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3082  transketolase  51.42 
 
 
664 aa  660    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3388  transketolase  54.53 
 
 
666 aa  729    Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000543798  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2469  transketolase  51.02 
 
 
690 aa  638    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4838  transketolase  51.96 
 
 
665 aa  640    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0970  transketolase  53.89 
 
 
695 aa  703    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00940  conserved hypothetical protein  52.85 
 
 
687 aa  675    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.292242  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4792  transketolase  50.6 
 
 
665 aa  640    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00646987 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26081  transketolase  65.18 
 
 
669 aa  904    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3591  transketolase  54.3 
 
 
668 aa  668    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0287801 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3540  transketolase  53.86 
 
 
664 aa  668    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0018246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4614  transketolase  55.1 
 
 
674 aa  725    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1187  transketolase  64.29 
 
 
670 aa  919    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0904971  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0616  transketolase  52.76 
 
 
666 aa  720    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0159  transketolase  53.92 
 
 
661 aa  666    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.311309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3645  transketolase  73.81 
 
 
670 aa  1030    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.999745  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3467  transketolase  51.17 
 
 
690 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2808  transketolase  51.05 
 
 
665 aa  655    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000368556  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1635  transketolase  73.21 
 
 
670 aa  1047    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3317  transketolase  51.02 
 
 
675 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16284  predicted protein  63.69 
 
 
679 aa  879    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0309  transketolase  50.81 
 
 
684 aa  664    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000137507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0168  transketolase  66.57 
 
 
669 aa  918    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0124  transketolase  66.57 
 
 
669 aa  933    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0136213 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2631  transketolase  51.96 
 
 
664 aa  642    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18031  transketolase  64.14 
 
 
668 aa  918    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3432  transketolase  50.59 
 
 
674 aa  654    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3744  transketolase  54.53 
 
 
666 aa  729    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000152991  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1703  transketolase  62.95 
 
 
668 aa  907    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0538  transketolase  74.7 
 
 
668 aa  1030    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0388  transketolase  52.4 
 
 
671 aa  658    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0026  transketolase  52.44 
 
 
694 aa  681    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0910343  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1430  transketolase  50.15 
 
 
662 aa  650    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0827  transketolase  53.86 
 
 
664 aa  667    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000324946  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0752  transketolase  53.87 
 
 
664 aa  696    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394111  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0472  transketolase  52.78 
 
 
667 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0841196  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20621  transketolase  64.73 
 
 
670 aa  921    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2249  transketolase  52.88 
 
 
663 aa  667    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0965691  hitchhiker  0.0000320127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0565  transketolase  53.06 
 
 
662 aa  644    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0651  transketolase  52.86 
 
 
723 aa  664    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2960  transketolase  53.95 
 
 
662 aa  683    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.986583 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1083  transketolase  52.97 
 
 
664 aa  662    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000105408  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3431  transketolase  51.31 
 
 
696 aa  643    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3468  transketolase  51.17 
 
 
690 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0384  transketolase  53.16 
 
 
663 aa  669    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1042  transketolase  51.84 
 
 
668 aa  659    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1249  transketolase  51.02 
 
 
690 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.47821  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3341  transketolase  52.23 
 
 
663 aa  671    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0470091 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0075  transketolase  50.67 
 
 
665 aa  643    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2808  transketolase  51.26 
 
 
697 aa  692    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.189513  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2283  transketolase  52.77 
 
 
667 aa  672    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0932399  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0389  transketolase  51.02 
 
 
690 aa  638    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0872  transketolase  54.45 
 
 
664 aa  684    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5284  transketolase  52.55 
 
 
691 aa  713    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3330  transketolase  51.95 
 
 
666 aa  664    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0024244  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0551  transketolase  52.99 
 
 
662 aa  677    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0450  transketolase  100 
 
 
672 aa  1387    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0773  transketolase  54.25 
 
 
664 aa  681    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0232346  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3250  transketolase  54.4 
 
 
664 aa  682    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.456833  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2261  transketolase  51.57 
 
 
666 aa  644    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2841  transketolase  51.8 
 
 
665 aa  645    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0647  transketolase  53.11 
 
 
680 aa  673    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000464673  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0458  transketolase  50.9 
 
 
666 aa  637    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07130  transketolase  53.01 
 
 
665 aa  668    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1734  transketolase  52.02 
 
 
658 aa  659    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.901909  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0349  transketolase  51.96 
 
 
658 aa  682    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.515184  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0565  transketolase  53.31 
 
 
680 aa  684    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5573  transketolase  52.55 
 
 
691 aa  713    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3479  transketolase  52.75 
 
 
655 aa  671    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0109031  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3353  transketolase  54.25 
 
 
664 aa  683    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.741116  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4319  transketolase  54.34 
 
 
666 aa  665    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.658339  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67105  transketolase 1  50.67 
 
 
677 aa  635    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2148  transketolase  51.33 
 
 
671 aa  668    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2759  transketolase  52.23 
 
 
663 aa  657    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0339  transketolase  52.25 
 
 
667 aa  642    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17981  transketolase  62.35 
 
 
668 aa  896    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3040  transketolase  52.56 
 
 
666 aa  652    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0715  transketolase  51.05 
 
 
664 aa  635    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.582031 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18201  transketolase  63.84 
 
 
668 aa  917    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>