More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3515 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3515  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 		 492 aa  993    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0316  hypothetical protein  47.9 
 
 		 487 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0326  hypothetical protein  47.9 
 
 		 487 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0307  hypothetical protein  48.1 
 
 		 487 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4550  hypothetical protein  46.57 
 
 		 482 aa  362  1e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2890  hypothetical protein  44.99 
 
 		 486 aa  354  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3846  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  45.03 
 
 		 486 aa  350  3e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1518  hypothetical protein  43.66 
 
 		 498 aa  327  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214659  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3686  hypothetical protein  40.04 
 
 		 484 aa  290  3e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1659  hypothetical protein  41.4 
 
 		 493 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224804  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  38.84 
 
 		 500 aa  281  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3339  hypothetical protein  39.3 
 
 		 488 aa  273  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2856  hypothetical protein  39.44 
 
 		 493 aa  270  5e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2900  hypothetical protein  39.44 
 
 		 493 aa  270  5e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  39.44 
 
 		 658 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3165  hypothetical protein  37.73 
 
 		 525 aa  266  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0565388  normal  0.0860599 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4545  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  39.31 
 
 		 495 aa  264  3e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0296  hypothetical protein  40.88 
 
 		 493 aa  262  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11847  hypothetical protein  39.26 
 
 		 487 aa  261  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.81807e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  36.4 
 
 		 491 aa  261  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  33.47 
 
 		 542 aa  212  9e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0302  hypothetical protein  34.83 
 
 		 534 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.947471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0312  hypothetical protein  34.83 
 
 		 534 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0293  hypothetical protein  34.16 
 
 		 529 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.467949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1005  hypothetical protein  32.1 
 
 		 555 aa  192  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0143655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1860  hypothetical protein  31.52 
 
 		 552 aa  186  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4564  hypothetical protein  33.9 
 
 		 523 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360175  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2883  hypothetical protein  34.42 
 
 		 530 aa  178  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0393135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2675  hypothetical protein  34.96 
 
 		 528 aa  177  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0187257  normal  0.0233154 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3721  hypothetical protein  31.24 
 
 		 587 aa  163  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  31.2 
 
 		 609 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  29.19 
 
 		 589 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  29.48 
 
 		 586 aa  151  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.94 
 
 		 502 aa  150  4e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  29.48 
 
 		 586 aa  147  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  28.13 
 
 		 588 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  27.42 
 
 		 519 aa  143  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  30.43 
 
 		 925 aa  141  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0687  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.63 
 
 		 503 aa  140  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.19 
 
 		 510 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.56 
 
 		 457 aa  137  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3335  hypothetical protein  29.39 
 
 		 570 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3320  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.98 
 
 		 564 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  27.4 
 
 		 582 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  26.98 
 
 		 464 aa  135  1.9999999999999998e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  26.44 
 
 		 584 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  27.87 
 
 		 517 aa  133  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1298  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.28 
 
 		 569 aa  133  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.306259  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  29.61 
 
 		 591 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  31.3 
 
 		 463 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  28.26 
 
 		 519 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  29.16 
 
 		 481 aa  130  6e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  27.76 
 
 		 517 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  27 
 
 		 582 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  27.92 
 
 		 598 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  27.71 
 
 		 598 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  31.69 
 
 		 598 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  28.14 
 
 		 589 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  27.81 
 
 		 517 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  27.49 
 
 		 511 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0596  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.28 
 
 		 588 aa  127  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.721596 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  26.38 
 
 		 519 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  27.68 
 
 		 582 aa  126  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  28.12 
 
 		 504 aa  125  1e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4718  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28 
 
 		 564 aa  126  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4662  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.82 
 
 		 563 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.97 
 
 		 522 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4750  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.82 
 
 		 563 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309954  normal  0.275452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5045  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.65 
 
 		 563 aa  125  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4243  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.38 
 
 		 601 aa  124  3e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  27.01 
 
 		 597 aa  124  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.1 
 
 		 509 aa  123  7e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  26.87 
 
 		 582 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  26.87 
 
 		 582 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.63 
 
 		 523 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.38 
 
 		 509 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3848  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.04 
 
 		 571 aa  121  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  28.48 
 
 		 925 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2125  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.98 
 
 		 587 aa  120  7e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.401658  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2778  Succinate dehydrogenase  27.5 
 
 		 510 aa  120  7.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.961247  normal  0.792272 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  27.86 
 
 		 599 aa  119  9e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  26.01 
 
 		 583 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  26.29 
 
 		 518 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  29.31 
 
 		 591 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  26.88 
 
 		 596 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.2 
 
 		 523 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5237  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.02 
 
 		 560 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.04 
 
 		 593 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.56 
 
 		 465 aa  117  5e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1792  3-oxosteroid 1-dehydrogenase  27.99 
 
 		 563 aa  117  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157211  normal  0.304525 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0801  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.74 
 
 		 598 aa  117  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  28.23 
 
 		 631 aa  116  7.999999999999999e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13800  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.42 
 
 		 547 aa  116  8.999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.290223  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.72 
 
 		 482 aa  116  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0986  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.3 
 
 		 567 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  27.84 
 
 		 517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.7 
 
 		 534 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30250  putative FAD-binding dehydrogenase  28.82 
 
 		 572 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1218  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.11 
 
 		 500 aa  115  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  28.63 
 
 		 521 aa  114  5e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>