More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3400 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3400  ABC transporter related protein  100 
 
 
252 aa  493  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0345809  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1874  ABC transporter related protein  56.47 
 
 
236 aa  239  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1757  ABC transporter related  46.33 
 
 
279 aa  156  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.543445  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  35.2 
 
 
299 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  35.2 
 
 
299 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4863  putative ABC transporter, ATP-binding protein  29.29 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  39.25 
 
 
301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4483  ABC transporter, ATP-binding protein  31.28 
 
 
277 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4648  ABC transporter ATP-binding protein  30.84 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5003  ABC transporter ATP-binding protein  30.84 
 
 
277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4501  ABC transporter, ATP-binding protein  34.12 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4887  putative ABC transporter, ATP-binding protein  32.61 
 
 
277 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0634  ABC transporter related  33.17 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000003558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3424  ABC transporter-related protein  32.43 
 
 
297 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  37.5 
 
 
301 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  37.3 
 
 
310 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4581  ABC transporter related  33.53 
 
 
277 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1945  ABC transporter related  34.11 
 
 
303 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0153054  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7297  ABC transporter related  30.53 
 
 
321 aa  107  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  36.79 
 
 
301 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  35.51 
 
 
296 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3577  ABC transporter related  30.32 
 
 
305 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  33.33 
 
 
327 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0361  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  29.91 
 
 
297 aa  103  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  35.96 
 
 
300 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1728  ABC transporter related  38.58 
 
 
260 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.968489  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0835  ABC transporter related protein  39.57 
 
 
307 aa  103  4e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.240086  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2040  ABC transporter related  26.61 
 
 
309 aa  102  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  33.89 
 
 
348 aa  102  7e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  29.79 
 
 
304 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2133  ABC transporter related  47.16 
 
 
278 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0145479  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5049  ABC transporter related  27.71 
 
 
309 aa  102  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0984  ABC transporter, ATP-binding protein  30.11 
 
 
276 aa  101  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.101875  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0356  ABC transporter-related protein  35.09 
 
 
309 aa  102  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  38.24 
 
 
279 aa  101  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4245  ABC transporter ATP-binding protein  34.2 
 
 
303 aa  101  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  35.67 
 
 
344 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4622  ABC transporter, ATP-binding protein  34.2 
 
 
294 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  31.41 
 
 
302 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4638  ABC transporter, ATP-binding protein  34.74 
 
 
294 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.672601  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4257  ABC transporter ATP-binding protein  35.29 
 
 
303 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129746  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  35.29 
 
 
310 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  33.48 
 
 
322 aa  100  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3387  ABC transporter related  31.12 
 
 
323 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  35.63 
 
 
258 aa  100  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  32.98 
 
 
325 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  32.98 
 
 
302 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4023  ABC transporter ATP-binding protein  27.72 
 
 
299 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000993933 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6164  ABC transporter related  37.79 
 
 
406 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0995946  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0581  ABC transporter related protein  37.89 
 
 
290 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  34.71 
 
 
316 aa  99.8  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1274  ABC transporter related protein  38.73 
 
 
298 aa  99.4  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0621  ABC transporter related  35.29 
 
 
246 aa  99  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.958584  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5550  ABC transporter related  32.62 
 
 
231 aa  99  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149026  hitchhiker  0.000395004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  38.86 
 
 
301 aa  99  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2749  ABC transporter related  35.96 
 
 
247 aa  99  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.795075 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0485  ABC transporter, ATP-binding protein  35.09 
 
 
301 aa  99  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1115  ABC transporter-like protein  35.83 
 
 
292 aa  98.6  8e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.894559  normal  0.173515 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  30.89 
 
 
317 aa  98.6  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  32.96 
 
 
348 aa  98.6  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  32.96 
 
 
348 aa  98.6  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4636  ABC transporter, ATP-binding protein  34.21 
 
 
294 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4405  ABC transporter ATP-binding protein  33.68 
 
 
303 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  34.21 
 
 
303 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4745  ABC transporter ATP-binding protein  33.68 
 
 
294 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2337  ABC transporter related  38.18 
 
 
248 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  34.12 
 
 
331 aa  98.2  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  29.9 
 
 
305 aa  97.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08261  ABC transporter, ATP-binding protein  28.38 
 
 
309 aa  97.4  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.915315  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0057  ABC transporter related  33.68 
 
 
414 aa  97.1  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  35.06 
 
 
308 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  33.16 
 
 
294 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0703  ABC transporter, ATP-binding protein  30.41 
 
 
296 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282688  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0698  ATP-binding transport protein nata  30.41 
 
 
296 aa  97.4  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.702927  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  33.33 
 
 
303 aa  97.4  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  33.16 
 
 
294 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1450  ABC transporter related protein  32.32 
 
 
299 aa  96.7  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2711  ABC transporter related protein  37.57 
 
 
305 aa  97.1  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.358434  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0872  ABC transporter related  35.8 
 
 
316 aa  97.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  27.8 
 
 
295 aa  97.1  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0227  ABC transporter related  28.5 
 
 
296 aa  97.1  3e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  33.68 
 
 
293 aa  97.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  37.98 
 
 
307 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  35.42 
 
 
312 aa  96.3  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  32.4 
 
 
332 aa  96.3  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_3998  ABC transporter related  33.86 
 
 
316 aa  96.3  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.296947 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  34.48 
 
 
308 aa  96.3  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  32.57 
 
 
266 aa  96.7  4e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  35.32 
 
 
306 aa  96.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3210  ABC transporter-related protein  34.04 
 
 
294 aa  96.3  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  35.87 
 
 
307 aa  95.9  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  35.29 
 
 
306 aa  95.9  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  33.15 
 
 
306 aa  96.3  5e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2557  ABC transporter related  35.36 
 
 
315 aa  95.9  5e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.471575  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.69 
 
 
304 aa  95.9  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4512  ABC transporter, ATPase subunit  33.73 
 
 
305 aa  95.9  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16714  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1534  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  30.95 
 
 
309 aa  95.9  6e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3473  ABC transporter related  33.33 
 
 
315 aa  95.5  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 
309 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 
304 aa  95.5  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>