74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0522 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0522  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 290 aa  597  1e-170  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.598532  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1193  hypothetical protein  48.54 
 
 		 305 aa  285  4e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.65343 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3334  TPR repeat-containing protein  45.21 
 
 		 297 aa  257  1e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0934  TPR repeat-containing protein  41.77 
 
 		 304 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000927672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1012  TPR repeat-containing protein  42.62 
 
 		 308 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.47501  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1081  TPR repeat-containing protein  42.62 
 
 		 308 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1114  TPR repeat-containing protein  42.62 
 
 		 308 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918708 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3277  TPR repeat-containing protein  42.62 
 
 		 308 aa  219  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.114437 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1040  membrane protein  40.08 
 
 		 282 aa  214  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06554  hypothetical protein  37.14 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000673  TPR repeat containing protein  39.75 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0271673  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0614  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  89  9e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 543 aa  55.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  29.41 
 
 		 267 aa  54.3  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1564  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 199 aa  55.1  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 716 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 927 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 602 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  32.89 
 
 		 398 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1288  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.130508  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1499  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00502134  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.52 
 
 		 1694 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 699 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2395  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.96 
 
 		 736 aa  50.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  29.25 
 
 		 573 aa  50.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 409 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 123 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 123 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00051  Flp pilus assembly protein TadD  25.38 
 
 		 297 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000470033 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1476  TPR repeat-containing protein  28.28 
 
 		 226 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818932  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 279 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3642  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.39 
 
 		 622 aa  47.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3209  tetratricopeptide repeat-containing protein  25.47 
 
 		 743 aa  47.4  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0793  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 152 aa  47  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.261295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0006  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 293 aa  46.2  0.0006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.437171  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 250 aa  46.2  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.06 
 
 		 836 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1852  protein of unknown function DUF86  30.12 
 
 		 208 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1878  protein of unknown function DUF86  30.12 
 
 		 208 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 767 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3340  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.43 
 
 		 622 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.309134 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  28.21 
 
 		 452 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  34.67 
 
 		 1979 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1178  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 280 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3161  tetratricopeptide TPR_2  31.43 
 
 		 444 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0774  tetratricopeptide TPR_2  30.69 
 
 		 519 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.169881  normal  0.452711 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1714 aa  44.3  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 4079 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  30.59 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 3560 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00051  TPR-repeat pilus assembly protein TadD  23.36 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1957  hypothetical protein  34.12 
 
 		 475 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00211883  hitchhiker  0.00150316 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 1121 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1138 aa  43.9  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1876  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.72 
 
 		 201 aa  43.9  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  28.18 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  34.25 
 
 		 573 aa  43.5  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 1276 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 523 aa  43.5  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1922  tetratricopeptide TPR_2  28.57 
 
 		 142 aa  43.5  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  22.13 
 
 		 366 aa  43.5  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2656  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.63 
 
 		 634 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28691  hypothetical protein  28.57 
 
 		 306 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2790  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 119 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 512 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  26.92 
 
 		 762 aa  43.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.67 
 
 		 397 aa  43.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.71 
 
 		 746 aa  42.7  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00531  hypothetical protein  29.73 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.93 
 
 		 297 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.93 
 
 		 297 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  31.34 
 
 		 738 aa  42.7  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0681  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 375 aa  42.4  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 391 aa  42.4  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>