193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1203 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1203  flagellar L-ring protein  100 
 
 		 199 aa  389  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1252  flagellar L-ring protein  100 
 
 		 199 aa  389  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0844  flagellar L-ring protein  36.87 
 
 		 203 aa  132  1.9999999999999998e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.136014  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0669  flagellar basal body L-ring protein-like protein  38.83 
 
 		 194 aa  124  9e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0165935  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0331  flagellar basal body L-ring protein-like protein  30.58 
 
 		 211 aa  95.5  5e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0825  flagellar basal body L-ring protein  33.33 
 
 		 249 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0174696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3045  flagellar basal body L-ring protein  36.21 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.737045 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3269  flagellar basal body L-ring protein  36.21 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3243  flagellar basal body L-ring protein  33.16 
 
 		 250 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.233718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1654  flagellar L-ring protein  34.29 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5512  flagellar basal body L-ring protein  31.76 
 
 		 259 aa  81.6  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359845  normal  0.839312 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0433  flagellar L-ring protein  31.79 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4425  flagellar basal body L-ring protein  31.29 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4195  flagellar basal body L-ring protein  27.54 
 
 		 246 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.417863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1381  flagellar basal body L-ring protein  29.73 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.953486  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4710  flagellar basal body L-ring protein  27.49 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0294749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3451  flagellar L-ring protein  34.05 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16550  flagellar L-ring protein  29.05 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000577316  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1681  flagellar basal body L-ring protein  31.1 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0473731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1504  flagellar basal body L-ring protein  29.76 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.225643 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3048  flagellar L-ring protein FlgH  27.27 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1154  flagellar biosynthesis, basal-body outer-membrane L (lipopolysaccharide layer) ring protein  32.46 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4104  flagellar L-ring protein  34.52 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1119  flagellar basal body L-ring protein  28.22 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2845  flagellar basal body L-ring protein  27.37 
 
 		 255 aa  70.5  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.456717  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3789  flagellar basal body L-ring protein  30.67 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0885051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1145  flagellar L-ring protein  28.08 
 
 		 192 aa  69.7  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000678845  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1376  flagellar L-ring protein  33.14 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3098  flagellar L-ring protein  29.59 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1941  flagellar L-ring protein FlgH  30.56 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3474  flagellar basal body L-ring protein  30 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2925  flagellar L-ring protein  33.78 
 
 		 240 aa  67  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.79436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3844  flagellar L-ring protein  30.61 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0044385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3760  flagellar L-ring protein  30.98 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3279  flagellar L-ring protein  30.95 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0158  flagellar basal body L-ring protein  26.06 
 
 		 238 aa  64.7  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.361018  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1631  flagellar L-ring protein precursor FlgH  33.33 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.366939  normal  0.882442 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0142  flagellar basal body L-ring protein  25.53 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1429  flagellar basal body L-ring protein  26.46 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50420  flagellar basal body L-ring protein  29.44 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.664762  hitchhiker  0.000989473 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0596  flagellar L-ring protein  32.95 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4294  flagellar basal body L-ring protein  29.44 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4205  flagellar basal body L-ring protein  23.66 
 
 		 242 aa  62  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.437324  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2559  flagellar L-ring protein  28.72 
 
 		 244 aa  61.2  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527082 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1503  flagellar basal body L-ring protein  29.12 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773524 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2520  flagellar basal body L-ring protein  27.92 
 
 		 238 aa  61.2  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1223  flagellar L-ring protein  32.08 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1327  flagellar basal body L-ring protein  30.38 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.821167  normal  0.0823128 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02922  flagellar basal body L-ring protein  30.12 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0932  flagellar L-ring protein  29.45 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3243  flagellar basal body L-ring protein  32.08 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2426  flagellar basal body L-ring protein  30.89 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.468869 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1101  flagellar basal body L-ring protein  25.97 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21807  normal  0.536314 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0710  flagellar basal body L-ring protein  30.41 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0394  flagellar basal body L-ring protein  25.41 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2844  flagellar basal body L-ring protein  30.29 
 
 		 240 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0173222  normal  0.127078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3945  flagellar basal body L-ring protein  30.06 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0786  flagellar basal body L-ring protein  30.41 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0733  flagellar basal body L-ring protein  30.46 
 
 		 240 aa  57.8  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1960  flagellar L-ring protein  27.22 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1335  flagellar basal body L-ring protein  29.11 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.599387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4384  flagellar basal body L-ring protein  28.24 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1422  flagellar basal body L-ring protein  29.11 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.474859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4191  flagellar basal body L-ring protein  28.19 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1320  flagellar basal body L-ring protein  29.73 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0291  flagellar basal body L-ring protein  25.41 
 
 		 235 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127273  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1265  flagellar basal body L-ring protein  29.11 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1167  flagellar basal body L-ring protein  28.93 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0558946  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2312  flagellar basal body L-ring protein  29.01 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.359463 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3094  flagellar basal body L-ring protein  29.11 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1770  flagellar L-ring protein  28.21 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1351  flagellar basal body L-ring protein  30 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2591  flagellar basal body L-ring protein  31.01 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2956  flagellar basal body L-ring protein  28.48 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.656972  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3081  flagellar basal body L-ring protein  29.94 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3725  flagellar basal body L-ring protein  27.37 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1471  flagellar basal body L-ring protein  27.65 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0240352  normal  0.68969 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2941  flagellar basal body L-ring protein  31.01 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0638  flagellar basal body L-ring protein  29.25 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.722941  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1427  flagellar basal body L-ring protein  31.76 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00360883  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2508  flagellar L-ring protein  34.48 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.153573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2604  flagellar L-ring protein  34.48 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.735916  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2779  flagellar L-ring protein  27.63 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2958  flagellar basal body L-ring protein  26.98 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.1622  normal  0.0541486 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1349  flagellar L-ring protein  34.48 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00261084  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0899  flagellar L-ring protein  25.88 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1603  flagellar basal body L-ring protein  29.38 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.153327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2207  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.22 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1900  flagellar basal body L-ring protein  27.92 
 
 		 230 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0652089 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1949  flagellar L-ring protein  26.7 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.30106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1137  flagellar basal body L-ring protein  24.59 
 
 		 230 aa  53.9  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1346  flagellar basal body L-ring protein  29.3 
 
 		 217 aa  53.9  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0269  flagellar basal body L-ring protein  27.15 
 
 		 221 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.884119 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1309  flagellar basal body L-ring protein  28.75 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2266  flagellar L-ring protein  28 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.181453  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0514  flagellar L-ring protein  33.75 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.100607  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3474  flagellar basal body L-ring protein  24.47 
 
 		 250 aa  53.1  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.671007  normal  0.222981 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0102  flagellar basal body L-ring protein  32.89 
 
 		 235 aa  52.8  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.354617  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1324  flagellar basal body L-ring protein  27.27 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.489763  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3365  flagellar basal body L-ring protein  27.15 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>