98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1156 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1156  major facilitator transporter  100 
 
 		 409 aa  805    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0229771 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1384  major facilitator transporter  70.75 
 
 		 406 aa  546  1e-154  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00122539  normal  0.869525 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2726  major facilitator superfamily multidrug transporter  71 
 
 		 406 aa  547  1e-154  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00306435  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1694  major facilitator superfamiy transporter  70.62 
 
 		 408 aa  545  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.189717  normal  0.0436902 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2075  major facilitator transporter  70.2 
 
 		 406 aa  542  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.15968  normal  0.242694 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1963  major facilitator transporter  65.53 
 
 		 409 aa  517  1.0000000000000001e-145  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0135158  normal  0.496646 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1244  major facilitator transporter  61.52 
 
 		 408 aa  458  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1780  major facilitator superfamily MFS_1  42.29 
 
 		 409 aa  302  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.378935  normal  0.0668238 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4451  major facilitator transporter  42.68 
 
 		 398 aa  287  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4568  major facilitator transporter  45.36 
 
 		 401 aa  283  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.368636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2369  major facilitator transporter  45.2 
 
 		 408 aa  280  4e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00076702  hitchhiker  0.0000240113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0700  major facilitator superfamily permease  42.39 
 
 		 409 aa  276  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1156  major facilitator superfamily MFS_1  42.31 
 
 		 393 aa  276  5e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0686413  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2322  major facilitator superfamily transporter  43.97 
 
 		 425 aa  276  6e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.798593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4387  major facilitator transporter  40.89 
 
 		 406 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.310839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7862  major facilitator superfamily MFS_1  42.53 
 
 		 410 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1537  major facilitator superfamily MFS_1  44.36 
 
 		 401 aa  272  6e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1621  MFS permease  42.67 
 
 		 408 aa  268  8.999999999999999e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4679  major facilitator transporter  39.53 
 
 		 413 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.206752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1531  major facilitator transporter  42.18 
 
 		 419 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1675  major facilitator transporter  42.03 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.816846  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5288  major facilitator superfamily MFS_1  39.06 
 
 		 415 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.120613  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1140  major facilitator transporter  41.98 
 
 		 405 aa  263  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5978  major facilitator superfamily MFS_1  37.99 
 
 		 397 aa  262  8e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2518  major facilitator superfamily MFS_1  43.26 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.203947  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2773  major facilitator transporter  42.2 
 
 		 409 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.975386  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0089  major facilitator transporter  40.31 
 
 		 406 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0823  major facilitator transporter  40.98 
 
 		 408 aa  249  8e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.735993  normal  0.261534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1945  major facilitator superfamily MFS_1  39.83 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.932651  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2733  MFS permease  40.53 
 
 		 420 aa  246  4e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000497  hypothetical protein  37.66 
 
 		 390 aa  242  9e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.011168  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06259  hypothetical protein  37.99 
 
 		 375 aa  239  5e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0933  major facilitator superfamily transporter  38.33 
 
 		 426 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2320  major facilitator superfamily MFS_1  40.8 
 
 		 397 aa  237  3e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.915714  normal  0.0732282 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1374  major facilitator superfamily transporter  39.62 
 
 		 409 aa  236  6e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5280  major facilitator superfamily MFS_1  38.18 
 
 		 392 aa  236  6e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1097  major facilitator transporter  36.62 
 
 		 396 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.15308  normal  0.619836 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2316  putative drug transport transmembrane protein  37.5 
 
 		 399 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.729418 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4770  major facilitator superfamily transporter  37.24 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.432764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2320  major facilitator transporter  37.99 
 
 		 393 aa  222  8e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0921  major facilitator transporter  36.91 
 
 		 395 aa  220  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.181611  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0186  major facilitator transporter  35.46 
 
 		 423 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.729906  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0792  major facilitator transporter  37.73 
 
 		 419 aa  217  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.101988 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1025  major facilitator transporter  38.02 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0221515 
 
 
-
 
NC_003296  RS00888  multidrug ABC transporter transmembrane protein  36.12 
 
 		 399 aa  212  9e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0243138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1069  major facilitator transporter  37.3 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.763435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0953  major facilitator transporter  36.66 
 
 		 412 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1035  major facilitator transporter  36.15 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2950  major facilitator superfamily MFS_1  34.36 
 
 		 418 aa  195  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3466  major facilitator transporter  34.11 
 
 		 402 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4866  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 416 aa  180  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0685  hypothetical protein  34.38 
 
 		 417 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2007  major facilitator superfamily transporter  32.42 
 
 		 398 aa  173  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1700  hypothetical protein  28.95 
 
 		 422 aa  166  5.9999999999999996e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.953118  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3481  drug transport transmembrane protein  32.1 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00472777  normal  0.0481041 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1499  major facilitator superfamily MFS_1  29.55 
 
 		 394 aa  158  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4322  hypothetical protein  30.26 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4169  major facilitator superfamily MFS_1  30.67 
 
 		 390 aa  155  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00845942  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40620  putative MFS transporter  37.36 
 
 		 389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4301  major facilitator transporter  30.43 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.108196  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1112  major facilitator superfamily MFS_1  29.97 
 
 		 403 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0112028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4774  hypothetical protein  29 
 
 		 392 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1151  major facilitator transporter  30.12 
 
 		 403 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.146461  normal  0.639239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3444  MFS family transporter  36.25 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49343  predicted protein  28.02 
 
 		 465 aa  130  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1787  major facilitator superfamily MFS_1  31.12 
 
 		 420 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.406772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5926  major facilitator superfamily transporter  30.35 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1521  major facilitator superfamily MFS_1  30.83 
 
 		 433 aa  110  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.542357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1948  putative multidrug resistance protein  30.35 
 
 		 424 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.138123  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1687  major facilitator transporter  30.67 
 
 		 422 aa  90.5  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1913  major facilitator superfamily protein  30.63 
 
 		 409 aa  87  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2250  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 420 aa  86.7  7e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1671  tetracycline resistance protein  30.16 
 
 		 421 aa  86.3  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.113591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1869  putative multidrug resistance protein  30.16 
 
 		 421 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.94346e-22 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3510  putative multidrug resistance protein  30.19 
 
 		 424 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1832  putative multidrug resistance protein  30.19 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1647  multidrug ABC transporter permease  29.98 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6677  hypothetical protein  26.85 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1580  major facilitator superfamily MFS_1  27.86 
 
 		 444 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3126  major facilitator superfamily protein  29.53 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000813228 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0501  major facilitator superfamily MFS_1  28.07 
 
 		 427 aa  74.3  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602709  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4185  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 		 420 aa  72.8  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.236137  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2339  major facilitator transporter  28.45 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1731  major facilitator superfamily MFS_1  26.49 
 
 		 444 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.288133  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14300  Major Facilitator Superfamily transporter  29.36 
 
 		 436 aa  70.9  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000199719  normal  0.135833 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1542  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0467  major facilitator transporter  29.43 
 
 		 374 aa  63.5  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.629615  normal  0.343035 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1914  major facilitator superfamily MFS_1  29.83 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.29836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3779  major facilitator transporter  23.27 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3978  hypothetical protein  40 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0673836  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1690  metabolite transport protein, C-terminus  32.46 
 
 		 314 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0503244  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2171  major facilitator superfamily MFS_1  25.85 
 
 		 427 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00215555  hitchhiker  0.00378482 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2887  major facilitator superfamily MFS_1  26.11 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.208438  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3922  major facilitator superfamily MFS_1  26.94 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1416  major facilitator superfamily MFS_1  25.96 
 
 		 402 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0563  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 		 426 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.55774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1812  major facilitator superfamily MFS_1  25.64 
 
 		 441 aa  44.3  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000055329 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1689  metabolite transport protein, N-terminus  28.85 
 
 		 114 aa  43.1  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.164457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>