More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0591 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0591  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 268 aa  545  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0662871  normal  0.0131631 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2336  hypothetical protein  39.5 
 
 		 243 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.352855  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1012  peptidase M48, Ste24p  39.5 
 
 		 243 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1589  peptidase M48, Ste24p  35.56 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2172  peptidase M48, Ste24p  38.24 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.441617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1013  peptidase M48, Ste24p  35.05 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.389833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2623  peptidase M48  33.98 
 
 		 250 aa  102  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0128988 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0698  peptidase M48, Ste24p  31.98 
 
 		 219 aa  97.4  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.0160033 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  33.64 
 
 		 479 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  33.64 
 
 		 479 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  37.88 
 
 		 267 aa  76.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  30.21 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  33.83 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  37.4 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  32.82 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  32.82 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  28.89 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  30.19 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  33.81 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  31.69 
 
 		 264 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  29.35 
 
 		 479 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  30.77 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  34.01 
 
 		 590 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  34.01 
 
 		 569 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  33.33 
 
 		 573 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  34.15 
 
 		 589 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  33.71 
 
 		 566 aa  63.5  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  23.42 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  34.58 
 
 		 504 aa  63.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1890  Zn-dependent protease  33.33 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 280 aa  62.4  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  32.61 
 
 		 605 aa  62.4  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  34.01 
 
 		 564 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  34.01 
 
 		 564 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  25.86 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  34.69 
 
 		 589 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  29.85 
 
 		 265 aa  62  0.000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  34.69 
 
 		 560 aa  62  0.000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  34.69 
 
 		 589 aa  62  0.000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  30.22 
 
 		 278 aa  62  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 593 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  36.27 
 
 		 561 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 562 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  34.69 
 
 		 572 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  34.69 
 
 		 572 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  33.57 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  34.69 
 
 		 572 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  35.92 
 
 		 553 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  34.69 
 
 		 572 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  32.45 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 564 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  35.48 
 
 		 271 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 588 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 588 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 588 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3748  regulatory protein, ArsR  33.55 
 
 		 423 aa  60.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.857978 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12433  hypothetical protein  30.28 
 
 		 274 aa  60.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0709327  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 288 aa  60.1  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  31.11 
 
 		 487 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0388  peptidase M48 Ste24p  33.57 
 
 		 349 aa  59.7  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0132188  normal  0.117009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  33.08 
 
 		 487 aa  59.7  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  33.77 
 
 		 554 aa  59.7  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  31.11 
 
 		 500 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  32.85 
 
 		 561 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  31.17 
 
 		 562 aa  59.3  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  30.98 
 
 		 494 aa  59.3  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  30.99 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  31.39 
 
 		 567 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  31.39 
 
 		 569 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  31.85 
 
 		 487 aa  58.2  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  33.85 
 
 		 492 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3160  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 514 aa  57.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.404677 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2164  protease  33.77 
 
 		 568 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  25.93 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  30.25 
 
 		 520 aa  57.8  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  28.68 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  31.3 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  29.66 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  29.66 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  31.75 
 
 		 478 aa  57  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  36.29 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  32.39 
 
 		 432 aa  57  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  33.08 
 
 		 487 aa  57  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  29.66 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1050  peptidase M48, Ste24p  34.29 
 
 		 424 aa  57  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1406  peptidase M48 Ste24p  26.29 
 
 		 277 aa  57  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  31.58 
 
 		 524 aa  56.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  30.15 
 
 		 483 aa  56.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  31.58 
 
 		 494 aa  56.6  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0147  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  31.58 
 
 		 494 aa  56.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  31.43 
 
 		 494 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  30.32 
 
 		 494 aa  55.8  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  28.85 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  32.33 
 
 		 487 aa  55.8  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  29.55 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0358  peptidase M48, Ste24p  37.14 
 
 		 533 aa  55.8  0.0000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000622653  hitchhiker  0.00063206 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  30.65 
 
 		 284 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>