206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0252 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0252  HNH endonuclease  100 
 
 		 193 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0319112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0267  HNH endonuclease domain-containing protein  75.92 
 
 		 194 aa  306  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  73.02 
 
 		 196 aa  299  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  72.11 
 
 		 194 aa  293  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  68.25 
 
 		 199 aa  282  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  51.7 
 
 		 181 aa  198  3e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0423  hypothetical protein  49.46 
 
 		 185 aa  191  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0345  HNH endonuclease  50.56 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.585904 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0166  HNH endonuclease domain protein  50.56 
 
 		 184 aa  190  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1257  HNH endonuclease  50.56 
 
 		 189 aa  189  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1270  HNH endonuclease  50 
 
 		 186 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210243  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1434  HNH endonuclease  51.1 
 
 		 185 aa  187  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212887  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3448  HNH endonuclease  51.1 
 
 		 185 aa  187  8e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.19182  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3847  HNH endonuclease  47.83 
 
 		 185 aa  186  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2107  HNH endonuclease  48.9 
 
 		 185 aa  181  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3397  HNH endonuclease  48.35 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2733  HNH endonuclease  48.35 
 
 		 185 aa  179  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.560093  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  47.85 
 
 		 221 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3227  HNH endonuclease  46.7 
 
 		 185 aa  177  1e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  46.35 
 
 		 220 aa  175  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  49.71 
 
 		 184 aa  174  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5382  HNH endonuclease  47.78 
 
 		 202 aa  171  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631878 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  47.22 
 
 		 204 aa  171  5.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  47.22 
 
 		 186 aa  170  9e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4034  HNH endonuclease  44.57 
 
 		 185 aa  168  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000888657 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  46.89 
 
 		 191 aa  166  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0889  HNH endonuclease  41.76 
 
 		 189 aa  165  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.184851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0960  HNH endonuclease  41.44 
 
 		 189 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.639629  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6164  HNH endonuclease  42.62 
 
 		 187 aa  154  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  43.58 
 
 		 193 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0295  hypothetical protein  42.39 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0984641 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  50.62 
 
 		 166 aa  93.2  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  49.38 
 
 		 165 aa  89.4  3e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  37.42 
 
 		 176 aa  89.7  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  47.06 
 
 		 181 aa  88.6  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  38.06 
 
 		 177 aa  88.2  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  36.84 
 
 		 176 aa  87.4  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  32.92 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  32.92 
 
 		 168 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  43.56 
 
 		 204 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  30.91 
 
 		 169 aa  85.1  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  47.62 
 
 		 174 aa  85.1  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  42.57 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  48.72 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  42.57 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  46.99 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  43.02 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  47.62 
 
 		 167 aa  81.3  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  48.05 
 
 		 171 aa  81.3  0.000000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  48.68 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  43.59 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  42.31 
 
 		 177 aa  80.9  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  42.27 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  48.68 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  38.54 
 
 		 168 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0978  HNH endonuclease  41.67 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  47.44 
 
 		 173 aa  79.3  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  32.87 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  41.05 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0346  HNH nuclease  48.1 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.118836 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  43.62 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1954  HNH endonuclease  41.58 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.843087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  43.37 
 
 		 146 aa  77.4  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3733  HNH endonuclease  32.87 
 
 		 187 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  44.94 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  41.98 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  41.24 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  48.68 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3111  HNH endonuclease  48.15 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.599577 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  41.57 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  41.57 
 
 		 165 aa  74.7  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1211  HNH endonuclease  38 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.594325  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  39.81 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7337  HNH endonuclease  34.44 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  50 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  40 
 
 		 169 aa  73.9  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  39.81 
 
 		 194 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3201  HNH endonuclease  50.72 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.177111  normal  0.769466 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3422  HNH endonuclease  30.05 
 
 		 183 aa  72  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5379  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 182 aa  71.6  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.785631  normal  0.574785 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  43.82 
 
 		 185 aa  72  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2814  HNH endonuclease  30.86 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0623363 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3083  HNH endonuclease  38.46 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.342454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  42.17 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  43.82 
 
 		 185 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  46.67 
 
 		 187 aa  70.9  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  41.98 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  45.45 
 
 		 172 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17680  restriction endonuclease  42.11 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.560252  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1985  HNH nuclease  46.05 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.110291  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  42.7 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  36.73 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4834  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  normal  0.684674 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5301  HNH endonuclease  44.44 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.480344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  40 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  43.21 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3551  HNH endonuclease  37.37 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00264695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1633  HNH endonuclease  44.3 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>