222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0186 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0186  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 		 172 aa  353  5.999999999999999e-97  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2712  cytochrome c oxidase, subunit II  46.37 
 
 		 180 aa  164  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.925486  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2667  cytochrome c oxidase, subunit II  43.1 
 
 		 175 aa  157  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000731969  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2971  cytochrome c oxidase, subunit II  40.12 
 
 		 176 aa  141  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297195  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1936  cytochrome c oxidase subunit II  50 
 
 		 243 aa  75.5  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.244228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  36.96 
 
 		 156 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  44.16 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  37.18 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  36.08 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  42.25 
 
 		 186 aa  67.4  0.00000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  35.05 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  34.95 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  36.67 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 		 350 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 		 350 aa  64.7  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 		 350 aa  64.7  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  36.25 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0480  cytochrome c oxidase, subunit II  40.22 
 
 		 203 aa  64.3  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.671352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  34.44 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1622  cytochrome c oxidase, subunit II  35.29 
 
 		 196 aa  63.9  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.330918  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  33.07 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  32.58 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  33.98 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  33.98 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  33.98 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  33.01 
 
 		 165 aa  62  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  30.59 
 
 		 337 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  29.21 
 
 		 334 aa  61.6  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  36.36 
 
 		 351 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  30 
 
 		 337 aa  61.6  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  27.12 
 
 		 334 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  27.12 
 
 		 338 aa  60.8  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0162  cytochrome c oxidase subunit II  35.06 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  29.2 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  26.86 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  45.45 
 
 		 370 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 		 389 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  40 
 
 		 262 aa  59.7  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  32.69 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  31.63 
 
 		 300 aa  58.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  33.01 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0183  cytochrome c oxidase subunit II  30.19 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  43.94 
 
 		 367 aa  58.5  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  35.35 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  30.93 
 
 		 288 aa  57  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  33.67 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  26.88 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  31.18 
 
 		 301 aa  57  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  30.85 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  32.63 
 
 		 342 aa  57  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  32.08 
 
 		 346 aa  57  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  39.71 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  32.65 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0460  cytochrome c oxidase, subunit II  25.53 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.354816  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  33.64 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  27.17 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  32.08 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  30.21 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  31.03 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  30.95 
 
 		 330 aa  55.5  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  32.38 
 
 		 271 aa  55.5  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  31.96 
 
 		 316 aa  55.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2266  cytochrome c, monohaem  28.81 
 
 		 336 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.380948  normal  0.0167103 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  39.44 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 		 329 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  31.13 
 
 		 256 aa  54.7  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  29.13 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  32.73 
 
 		 314 aa  54.3  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  25.86 
 
 		 362 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1944  cytochrome c oxidase, subunit II  28.89 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0103  hypothetical protein  34.15 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3849  cytochrome c oxidase, subunit II  27.68 
 
 		 235 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.26025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  27.48 
 
 		 311 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  32.48 
 
 		 327 aa  53.9  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  30.69 
 
 		 359 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.86 
 
 		 324 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  29.01 
 
 		 345 aa  53.1  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2249  cytochrome c oxidase, subunit II  27.74 
 
 		 329 aa  53.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  33.83 
 
 		 311 aa  53.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  28.46 
 
 		 352 aa  52.4  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2016  cytochrome c oxidase, subunit II  28.75 
 
 		 304 aa  52  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  32.46 
 
 		 336 aa  52  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  36.49 
 
 		 371 aa  51.6  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  38.57 
 
 		 354 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  39.39 
 
 		 377 aa  51.6  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  28.46 
 
 		 352 aa  51.6  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 330 aa  51.6  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  33.8 
 
 		 190 aa  51.2  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  26.14 
 
 		 355 aa  51.2  0.000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  31.13 
 
 		 354 aa  50.8  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  34.29 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  40 
 
 		 171 aa  50.8  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  38.57 
 
 		 353 aa  50.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  26.35 
 
 		 269 aa  50.8  0.000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  29.7 
 
 		 362 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11170  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit II  25.95 
 
 		 315 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.761021  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0079  putative cytochrome c oxidase subunit II  27.91 
 
 		 342 aa  50.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.917681  hitchhiker  0.00234837 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  29.7 
 
 		 362 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 		 279 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0623  cytochrome c oxidase subunit II  33.8 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>