More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1575 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1575  lipoyl synthase  100 
 
 		 290 aa  603  1.0000000000000001e-171  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00830336  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0504  lipoyl synthase  60.64 
 
 		 282 aa  355  3.9999999999999996e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.354667 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0513  lipoyl synthase  54.48 
 
 		 292 aa  338  5.9999999999999996e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170423  normal  0.0962099 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  55.6 
 
 		 288 aa  332  4e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  55.23 
 
 		 299 aa  325  5e-88  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  53.24 
 
 		 304 aa  325  8.000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  53.62 
 
 		 290 aa  322  4e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  51.09 
 
 		 328 aa  317  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0446  lipoic acid synthetase  50.72 
 
 		 302 aa  307  2.0000000000000002e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3189  lipoyl synthase  51.27 
 
 		 290 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.411626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 292 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  53.26 
 
 		 282 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 299 aa  296  3e-79  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  48.36 
 
 		 321 aa  293  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 308 aa  292  4e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0490  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 297 aa  291  7e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  49.82 
 
 		 298 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  49.46 
 
 		 298 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  50.71 
 
 		 298 aa  289  4e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 298 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 298 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 298 aa  288  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 298 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 298 aa  288  6e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 298 aa  288  6e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 298 aa  288  6e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 298 aa  288  6e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  50.35 
 
 		 298 aa  288  1e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  50 
 
 		 298 aa  287  2e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0610  lipoyl synthase  51.09 
 
 		 283 aa  285  4e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  48.01 
 
 		 321 aa  285  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 305 aa  285  5e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4149  lipoic acid synthetase  48.92 
 
 		 311 aa  285  5e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 305 aa  285  5e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2373  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 348 aa  285  9e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  48.39 
 
 		 303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1624  lipoyl synthase  49.27 
 
 		 322 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.686327  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  48.39 
 
 		 303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  49.45 
 
 		 287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1921  lipoyl synthase  48.91 
 
 		 310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0537683  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  46.55 
 
 		 329 aa  282  4.0000000000000003e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  49.11 
 
 		 296 aa  282  4.0000000000000003e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0672  lipoyl synthase  48.39 
 
 		 308 aa  282  5.000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.61797  normal  0.208975 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2102  lipoyl synthase  48.41 
 
 		 326 aa  281  6.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2032  lipoyl synthase  48.41 
 
 		 326 aa  281  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  47.9 
 
 		 334 aa  281  9e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  46.38 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  47.31 
 
 		 304 aa  281  1e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1552  lipoyl synthase  48.56 
 
 		 368 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1828  lipoyl synthase  48.41 
 
 		 326 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1992  lipoyl synthase  48.4 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0241  lipoyl synthase  47.1 
 
 		 312 aa  279  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.395057  normal  0.45798 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3791  lipoyl synthase  48.38 
 
 		 350 aa  279  4e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  46.91 
 
 		 298 aa  279  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  47.65 
 
 		 314 aa  279  5e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  50 
 
 		 335 aa  278  5e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1742  lipoyl synthase  47.6 
 
 		 328 aa  278  6e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0397139 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  47.48 
 
 		 317 aa  278  8e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  48 
 
 		 315 aa  278  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1124  lipoyl synthase  48.18 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1068  lipoyl synthase  46.18 
 
 		 300 aa  277  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.595  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1509  lipoyl synthase  47.81 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.499062  normal  0.4257 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  48.36 
 
 		 311 aa  277  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2065  lipoyl synthase  47.81 
 
 		 321 aa  276  2e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1092  lipoyl synthase  47.46 
 
 		 312 aa  276  4e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00219878  hitchhiker  0.00000000000266656 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  47.83 
 
 		 315 aa  275  5e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0523  lipoyl synthase  49.27 
 
 		 325 aa  275  6e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  47.45 
 
 		 323 aa  275  9e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  48.93 
 
 		 324 aa  274  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4375  lipoyl synthase  50.18 
 
 		 307 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0743  lipoic acid synthetase  46.79 
 
 		 326 aa  273  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1082  lipoyl synthase  47.81 
 
 		 322 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.721061  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1586  lipoyl synthase  46.4 
 
 		 331 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.426522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1436  lipoyl synthase  46.35 
 
 		 325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00922055  hitchhiker  0.00000261266 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  45.58 
 
 		 324 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2824  lipoyl synthase  46.01 
 
 		 320 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2841  lipoyl synthase  46.59 
 
 		 319 aa  271  6e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176893  hitchhiker  0.000447826 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1406  lipoyl synthase  48.03 
 
 		 291 aa  271  7e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0645546 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  46.76 
 
 		 298 aa  271  8.000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  45.62 
 
 		 351 aa  271  9e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3569  lipoyl synthase  48.93 
 
 		 300 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  47.64 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  47.64 
 
 		 320 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  46.55 
 
 		 316 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  48 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1966  lipoic acid synthetase  46.93 
 
 		 318 aa  270  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.523068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2123  lipoyl synthase  47.45 
 
 		 323 aa  270  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  45.76 
 
 		 276 aa  270  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6533  lipoyl synthase  47.27 
 
 		 320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0432658  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  46.01 
 
 		 325 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2544  lipoyl synthase  48.57 
 
 		 300 aa  269  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3346  lipoyl synthase  46.74 
 
 		 294 aa  269  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1316  lipoyl synthase  46.74 
 
 		 294 aa  269  4e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1957  lipoyl synthase  47.1 
 
 		 292 aa  269  4e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0540392  decreased coverage  0.00259733 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  48.19 
 
 		 320 aa  269  5e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1162  lipoyl synthase  48.01 
 
 		 291 aa  268  5.9999999999999995e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484773  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3382  lipoic acid synthetase  48.2 
 
 		 288 aa  268  5.9999999999999995e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1611  lipoyl synthase  47.45 
 
 		 323 aa  268  7e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1149  lipoyl synthase  49.1 
 
 		 292 aa  268  7e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.025967  normal  0.19755 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>